source: branches/3.18-stable/www/admin/extravaluetypes/list_extravaluetypes.jsp @ 7932

Last change on this file since 7932 was 7932, checked in by Nicklas Nordborg, 6 months ago

References #2246: Sticky table headers

Implemented for all item list pages and a few other places:

  • Extensions installation dialog
  • Administrate / Services list page
  • Batch inherit annotations
  • Manage list presets
  • List of changed item in view job dialog


  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 16.0 KB
Line 
1<%-- $Id: list_extravaluetypes.jsp 7932 2021-04-28 07:16:56Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Nicklas Nordborg
4  Copyright (C) 2007 Johan Enell, Nicklas Nordborg
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.Type"
30  import="net.sf.basedb.core.Item"
31  import="net.sf.basedb.core.ExtraValueType"
32  import="net.sf.basedb.core.Formula"
33  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
34  import="net.sf.basedb.core.Include"
35  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
36  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
37  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
38  import="net.sf.basedb.core.Permission"
39  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
40  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
42  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
43  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
44  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
45  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
46  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
47  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
48  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
49  import="net.sf.basedb.util.Values"
50  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
59  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
60  import="java.util.Date"
61  import="java.util.List"
62  import="java.util.Map"
63%>
64<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
65<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
66<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
67<%!
68  private static final Item itemType = Item.EXTRAVALUETYPE;
69  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
70
71  private static final Enumeration<String, String> valueTypes = new Enumeration<String, String>();
72  private static final Enumeration<String, String> avgMethods = new Enumeration<String, String>();
73  static
74  {
75    valueTypes.add(Integer.toString(Type.INT.getValue()), Type.INT.toString());
76    valueTypes.add(Integer.toString(Type.FLOAT.getValue()), Type.FLOAT.toString());
77    valueTypes.add(Integer.toString(Type.STRING.getValue()), Type.STRING.toString());
78    for (Formula.AverageMethod m : Formula.AverageMethod.values())
79    {
80      avgMethods.add(Integer.toString(m.getValue()), HTML.encodeTags(m.toString()));
81    }
82  }
83
84%>
85<%
86final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
87final String ID = sc.getId();
88final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
89final boolean writePermission = sc.hasPermission(Permission.WRITE, itemType);
90final boolean deletePermission = sc.hasPermission(Permission.DELETE, itemType);
91final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
92
93final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
94final String callback = request.getParameter("callback");
95final String title = mode.generateTitle("extra value type", "extra value types");
96final DbControl dc = sc.newDbControl();
97ItemResultIterator<ExtraValueType> extraValueTypes = null;
98try
99{
100  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
101  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
102  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
103  try
104  {
105    final ItemQuery<ExtraValueType> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, jspContext, true, ExtraValueType.getQuery(), mode);
106    extraValueTypes = query.iterate(dc);
107  }
108  catch (Throwable t)
109  {
110    cc.setMessage(t.getMessage());
111  }
112  int numListed = 0;
113  ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
114  ExtensionsInvoker<ListColumnAction<ExtraValueType,?>> columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
115  %>
116  <base:page title="<%=title==null ? "Extra value types" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
117  <base:head scripts="table.js,~extravaluetypes.js" styles="table.css,toolbar.css">
118    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
119    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
120  </base:head>
121 
122  <base:body>
123    <h1><%=title==null ? "Extra value types" : title%></h1>
124    <div class="content">
125    <tbl:table 
126      id="extraValueTypes" 
127      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
128      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
129      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
130      action="index.jsp"
131      sc="<%=sc%>"
132      item="<%=itemType%>"
133      filterrows="<%=cc.getFilterRows()%>"
134      subclass="fulltable sticky-headers"
135      >
136      <tbl:hidden 
137        name="mode" 
138        value="<%=mode.getName()%>" 
139      />
140      <tbl:hidden 
141        name="callback" 
142        value="<%=callback%>" 
143        skip="<%=callback == null%>" 
144      />
145      <tbl:columndef 
146        id="name"
147        property="name"
148        datatype="string"
149        title="Name"
150        sortable="true" 
151        filterable="true"
152        exportable="true"
153        show="always" 
154      />
155      <tbl:columndef 
156        id="id"
157        clazz="uniquecol"
158        property="id"
159        datatype="int"
160        title="ID"
161        sortable="true"
162        filterable="true"
163        exportable="true"
164      />
165      <tbl:columndef 
166        id="entryDate"
167        property="entryDate"
168        datatype="date"
169        title="Registered"
170        sortable="true" 
171        filterable="true"
172        exportable="true"
173        formatter="<%=dateFormatter%>"
174      />
175      <tbl:columndef 
176        id="externalId"
177        clazz="uniquecol"
178        property="externalId"
179        datatype="string"
180        title="External ID"
181        sortable="true" 
182        filterable="true"
183        exportable="true"
184      />
185      <tbl:columndef 
186        id="valueType"
187        property="valueType"
188        datatype="int"
189        title="Value type"
190        enumeration="<%=valueTypes%>"
191        sortable="true" 
192        filterable="true"
193        exportable="true"
194      />
195      <tbl:columndef 
196        id="averageMethod"
197        property="averageMethod"
198        datatype="int"
199        enumeration="<%=avgMethods%>"
200        title="Avg. method"
201        sortable="true" 
202        filterable="true"
203        exportable="true"
204      />
205      <tbl:columndef 
206        id="useColors"
207        property="coloring.usingColors"
208        datatype="boolean"
209        title="Use colors"
210        sortable="true" 
211        filterable="true"
212        exportable="false"
213      />
214      <tbl:columndef 
215        id="logarithmic"
216        property="coloring.logarithmic"
217        datatype="boolean"
218        title="Logarithmic"
219        sortable="true" 
220        filterable="true"
221        exportable="false"
222      />
223      <tbl:columndef 
224        id="minValue"
225        property="coloring.minValue"
226        datatype="float"
227        title="Min value"
228        sortable="true" 
229        filterable="true"
230        exportable="false"
231      />
232      <tbl:columndef 
233        id="midValue"
234        property="coloring.midValue"
235        datatype="float"
236        title="Mid value"
237        sortable="true" 
238        filterable="true"
239        exportable="false"
240      />
241      <tbl:columndef 
242        id="maxValue"
243        property="coloring.maxValue"
244        datatype="float"
245        title="Max value"
246        sortable="true" 
247        filterable="true"
248        exportable="false"
249      />
250      <tbl:columndef 
251        id="description"
252        property="description"
253        datatype="string"
254        title="Description" 
255        sortable="true" 
256        filterable="true" 
257        exportable="true"
258      />
259      <tbl:columndef 
260        id="xt-columns" 
261        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
262        jspcontext="<%=jspContext%>" 
263      />
264      <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
265        <tbl:toolbar
266          subclass="bottomborder"
267          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
268          >
269          <tbl:button 
270            id="btnNewItem"
271            disabled="<%=!createPermission%>" 
272            image="new.png" 
273            title="New&hellip;" 
274            tooltip="<%=createPermission ? "Create new extra value type" : "You do not have permission to create extra value types"%>" 
275          />
276          <tbl:button 
277            id="btnDeleteItems"
278            disabled="<%=!deletePermission%>" 
279            image="delete.png" 
280            title="Delete" 
281            tooltip="<%=deletePermission ? "Delete the selected items" : "You do not have permission to delete extra value types" %>" 
282          />
283          <tbl:button 
284            id="btnRestoreItems"
285            disabled="<%=!writePermission%>" 
286            image="restore.png" 
287            title="Restore" 
288            tooltip="<%=writePermission ? "Restore the selected (deleted) items" : "You do not have permission to edit extra value types" %>" 
289          />
290          <tbl:button 
291            id="btnColumns"
292            image="columns.png" 
293            title="Columns&hellip;" 
294            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
295          />
296          <tbl:button 
297            id="btnImport"
298            data-plugin-type="IMPORT"
299            image="import.png" 
300            title="Import&hellip;" 
301            tooltip="Import data" 
302            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
303          />
304          <tbl:button 
305            id="btnExport"
306            data-plugin-type="EXPORT"
307            image="export.png" 
308            title="Export&hellip;" 
309            tooltip="Export data" 
310            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
311          />
312          <tbl:button 
313            id="btnRunPlugin"
314            data-plugin-type="OTHER"
315            image="runplugin.png" 
316            title="Run plugin&hellip;" 
317            tooltip="Run a plugin" 
318            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
319          />
320          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
321            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
322        </tbl:toolbar>
323        <tbl:panel>
324          <tbl:presetselector />
325          <tbl:navigator
326            page="<%=cc.getPage()%>" 
327            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
328            totalrows="<%=extraValueTypes == null ? 0 : extraValueTypes.getTotalCount()%>" 
329            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
330          />
331        </tbl:panel>
332      </div>
333      <tbl:data>
334        <tbl:headers>
335          <tbl:headerrow>
336            <tbl:header colspan="3" />
337            <tbl:columnheaders />
338          </tbl:headerrow>
339          <%
340          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
341          int numRows = cc.getFilterRows();
342          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
343          {
344            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
345            %>
346            <tbl:headerrow>
347              <tbl:header subclass="index" />
348              <tbl:header 
349                subclass="check" 
350                visible="<%=mode.hasCheck()%>"
351                ><base:icon 
352                  subclass="link table-check"
353                  image="check_uncheck.png" 
354                  tooltip="Toggle all (use CTRL, ALT or SHIFT to check/uncheck)" 
355                  visible="<%=lastRow%>"
356                /></tbl:header>
357              <tbl:header 
358                subclass="check" 
359                visible="<%=mode.hasRadio()%>"
360                />
361              <tbl:header 
362                subclass="icons" 
363                visible="<%=mode.hasIcons()%>"
364                >
365                <base:icon
366                  subclass="link table-filter-row-action"
367                  image="add.png"
368                  tooltip="Add extra filter row"
369                  visible="<%=lastRow%>"
370                /><base:icon
371                  subclass="link table-filter-row-action"
372                  image="remove.png"
373                  tooltip="Remove this filter row"
374                  visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
375                  data-remove-row="<%=filterNo%>"
376                />
377              </tbl:header>
378              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
379            </tbl:headerrow>
380            <%
381          }
382          %>
383          <tbl:columnsubtitles />
384        </tbl:headers>
385        <tbl:rows>
386          <%
387          if (cc.getMessage() != null)
388          {
389            %>
390            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
391              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
392            </tbl:panel>
393            <%
394            cc.setMessage(null);
395          }
396          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
397          int selectedItemId = cc.getId();
398          if (extraValueTypes != null)
399          {           
400            while (extraValueTypes.hasNext())
401            {
402              ExtraValueType item = extraValueTypes.next();
403              int itemId = item.getId();
404              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
405              String tooltip = mode.isSelectionMode() ? 
406                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
407             
408              index++;
409              numListed++;
410              %>
411              <tbl:row>
412                <tbl:header 
413                  clazz="index"
414                  ><%=index%></tbl:header>
415                <tbl:header 
416                  clazz="check" 
417                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
418                  ><input 
419                    type="checkbox" 
420                    name="<%=itemId%>" 
421                    value="<%=itemId%>" 
422                    title="<%=name%>" 
423                    <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%> 
424                  ></tbl:header>
425                <tbl:header 
426                  clazz="check" 
427                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
428                  ><input 
429                    type="radio" 
430                    name="item_id" 
431                    value="<%=itemId%>" 
432                    title="<%=name%>" 
433                    <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
434                  ></tbl:header>
435                <tbl:header 
436                  clazz="icons" 
437                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
438                  ><base:icon 
439                    image="deleted.png"
440                    id="<%="delete."+itemId %>"
441                    subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : "disabled" %>"
442                    data-item-id="<%=itemId%>"
443                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
444                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
445                  />&nbsp;</tbl:header>
446                <tbl:cell column="name"><div 
447                  class="link table-item"
448                  data-item-id="<%=itemId%>"
449                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
450                  tabindex="0"
451                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></tbl:cell>
452                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
453                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
454                <tbl:cell column="externalId"><%=HTML.encodeTags(item.getExternalId())%></tbl:cell>
455                <tbl:cell column="valueType"><%=item.getValueType()%></tbl:cell>
456                <tbl:cell column="averageMethod"><%=item.getAverageMethod().toString()%></tbl:cell>
457                <tbl:cell column="useColors"><%=item.getColoring().isUsingColors() ? "yes" : "no"%></tbl:cell>
458                <tbl:cell column="logarithmic"><%=item.getColoring().isLogarithmic() ? "yes" : "no"%></tbl:cell>
459                <tbl:cell column="minValue"><%=Values.formatNumber(item.getColoring().getMinValue(), 2)%></tbl:cell>
460                <tbl:cell column="midValue"><%=Values.formatNumber(item.getColoring().getMidValue(), 2)%></tbl:cell>
461                <tbl:cell column="maxValue"><%=Values.formatNumber(item.getColoring().getMaxValue(), 2)%></tbl:cell>
462                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
463                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
464                  <tbl:cell column="xt-columns" />
465                </tbl:xt-cells>
466              </tbl:row>
467              <%
468              }
469            }
470          if (numListed == 0)
471          {
472            %>
473            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
474              <div class="messagecontainer note">
475              <%=extraValueTypes == null || extraValueTypes.getTotalCount() == 0 ? "No extra value types were found" : "No extra value types on this page. Please select another page!" %>
476              </div>
477            </tbl:panel>
478            <%
479          }
480          %>
481        </tbl:rows>
482      </tbl:data>
483    </tbl:table>
484    </div>
485   
486    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
487      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
488      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
489      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
490    </base:buttongroup>
491   
492  </base:body>
493  </base:page>
494  <%
495}
496finally
497{
498  if (extraValueTypes != null) extraValueTypes.close();
499  if (dc != null) dc.close();
500}
501%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.