source: branches/3.18-stable/www/admin/extravaluetypes/list_extravaluetypes.jsp @ 7939

Last change on this file since 7939 was 7939, checked in by Nicklas Nordborg, 6 months ago

References #2246: Sticky table headers

It should now be implemented on all list pages.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 16.1 KB
Line 
1<%-- $Id: list_extravaluetypes.jsp 7939 2021-05-04 07:30:31Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Nicklas Nordborg
4  Copyright (C) 2007 Johan Enell, Nicklas Nordborg
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.Type"
30  import="net.sf.basedb.core.Item"
31  import="net.sf.basedb.core.ExtraValueType"
32  import="net.sf.basedb.core.Formula"
33  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
34  import="net.sf.basedb.core.Include"
35  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
36  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
37  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
38  import="net.sf.basedb.core.Permission"
39  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
40  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
42  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
43  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
44  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
45  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
46  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
47  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
48  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
49  import="net.sf.basedb.util.Values"
50  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
59  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
60  import="java.util.Date"
61  import="java.util.List"
62  import="java.util.Map"
63%>
64<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
65<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
66<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
67<%!
68  private static final Item itemType = Item.EXTRAVALUETYPE;
69  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
70
71  private static final Enumeration<String, String> valueTypes = new Enumeration<String, String>();
72  private static final Enumeration<String, String> avgMethods = new Enumeration<String, String>();
73  static
74  {
75    valueTypes.add(Integer.toString(Type.INT.getValue()), Type.INT.toString());
76    valueTypes.add(Integer.toString(Type.FLOAT.getValue()), Type.FLOAT.toString());
77    valueTypes.add(Integer.toString(Type.STRING.getValue()), Type.STRING.toString());
78    for (Formula.AverageMethod m : Formula.AverageMethod.values())
79    {
80      avgMethods.add(Integer.toString(m.getValue()), HTML.encodeTags(m.toString()));
81    }
82  }
83
84%>
85<%
86final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
87final String ID = sc.getId();
88final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
89final boolean writePermission = sc.hasPermission(Permission.WRITE, itemType);
90final boolean deletePermission = sc.hasPermission(Permission.DELETE, itemType);
91final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
92
93final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
94final String callback = request.getParameter("callback");
95final String title = mode.generateTitle("extra value type", "extra value types");
96final DbControl dc = sc.newDbControl();
97ItemResultIterator<ExtraValueType> extraValueTypes = null;
98try
99{
100  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
101  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
102  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
103  try
104  {
105    final ItemQuery<ExtraValueType> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, jspContext, true, ExtraValueType.getQuery(), mode);
106    extraValueTypes = query.iterate(dc);
107  }
108  catch (Throwable t)
109  {
110    cc.setMessage(t.getMessage());
111  }
112  int numListed = 0;
113  ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
114  ExtensionsInvoker<ListColumnAction<ExtraValueType,?>> columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
115  %>
116  <base:page title="<%=title==null ? "Extra value types" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
117  <base:head scripts="table.js,~extravaluetypes.js" styles="table.css,toolbar.css">
118    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
119    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
120  </base:head>
121 
122  <base:body>
123    <h1><%=title==null ? "Extra value types" : title%></h1>
124    <div class="content">
125    <tbl:table 
126      id="extraValueTypes" 
127      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
128      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
129      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
130      action="index.jsp"
131      sc="<%=sc%>"
132      item="<%=itemType%>"
133      filterrows="<%=cc.getFilterRows()%>"
134      subclass="fulltable"
135      stickyheaders="name"
136      >
137      <tbl:hidden 
138        name="mode" 
139        value="<%=mode.getName()%>" 
140      />
141      <tbl:hidden 
142        name="callback" 
143        value="<%=callback%>" 
144        skip="<%=callback == null%>" 
145      />
146      <tbl:columndef 
147        id="name"
148        property="name"
149        datatype="string"
150        title="Name"
151        sortable="true" 
152        filterable="true"
153        exportable="true"
154        show="always" 
155      />
156      <tbl:columndef 
157        id="id"
158        clazz="uniquecol"
159        property="id"
160        datatype="int"
161        title="ID"
162        sortable="true"
163        filterable="true"
164        exportable="true"
165      />
166      <tbl:columndef 
167        id="entryDate"
168        property="entryDate"
169        datatype="date"
170        title="Registered"
171        sortable="true" 
172        filterable="true"
173        exportable="true"
174        formatter="<%=dateFormatter%>"
175      />
176      <tbl:columndef 
177        id="externalId"
178        clazz="uniquecol"
179        property="externalId"
180        datatype="string"
181        title="External ID"
182        sortable="true" 
183        filterable="true"
184        exportable="true"
185      />
186      <tbl:columndef 
187        id="valueType"
188        property="valueType"
189        datatype="int"
190        title="Value type"
191        enumeration="<%=valueTypes%>"
192        sortable="true" 
193        filterable="true"
194        exportable="true"
195      />
196      <tbl:columndef 
197        id="averageMethod"
198        property="averageMethod"
199        datatype="int"
200        enumeration="<%=avgMethods%>"
201        title="Avg. method"
202        sortable="true" 
203        filterable="true"
204        exportable="true"
205      />
206      <tbl:columndef 
207        id="useColors"
208        property="coloring.usingColors"
209        datatype="boolean"
210        title="Use colors"
211        sortable="true" 
212        filterable="true"
213        exportable="false"
214      />
215      <tbl:columndef 
216        id="logarithmic"
217        property="coloring.logarithmic"
218        datatype="boolean"
219        title="Logarithmic"
220        sortable="true" 
221        filterable="true"
222        exportable="false"
223      />
224      <tbl:columndef 
225        id="minValue"
226        property="coloring.minValue"
227        datatype="float"
228        title="Min value"
229        sortable="true" 
230        filterable="true"
231        exportable="false"
232      />
233      <tbl:columndef 
234        id="midValue"
235        property="coloring.midValue"
236        datatype="float"
237        title="Mid value"
238        sortable="true" 
239        filterable="true"
240        exportable="false"
241      />
242      <tbl:columndef 
243        id="maxValue"
244        property="coloring.maxValue"
245        datatype="float"
246        title="Max value"
247        sortable="true" 
248        filterable="true"
249        exportable="false"
250      />
251      <tbl:columndef 
252        id="description"
253        property="description"
254        datatype="string"
255        title="Description" 
256        sortable="true" 
257        filterable="true" 
258        exportable="true"
259      />
260      <tbl:columndef 
261        id="xt-columns" 
262        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
263        jspcontext="<%=jspContext%>" 
264      />
265      <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
266        <tbl:toolbar
267          subclass="bottomborder"
268          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
269          >
270          <tbl:button 
271            id="btnNewItem"
272            disabled="<%=!createPermission%>" 
273            image="new.png" 
274            title="New&hellip;" 
275            tooltip="<%=createPermission ? "Create new extra value type" : "You do not have permission to create extra value types"%>" 
276          />
277          <tbl:button 
278            id="btnDeleteItems"
279            disabled="<%=!deletePermission%>" 
280            image="delete.png" 
281            title="Delete" 
282            tooltip="<%=deletePermission ? "Delete the selected items" : "You do not have permission to delete extra value types" %>" 
283          />
284          <tbl:button 
285            id="btnRestoreItems"
286            disabled="<%=!writePermission%>" 
287            image="restore.png" 
288            title="Restore" 
289            tooltip="<%=writePermission ? "Restore the selected (deleted) items" : "You do not have permission to edit extra value types" %>" 
290          />
291          <tbl:button 
292            id="btnColumns"
293            image="columns.png" 
294            title="Columns&hellip;" 
295            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
296          />
297          <tbl:button 
298            id="btnImport"
299            data-plugin-type="IMPORT"
300            image="import.png" 
301            title="Import&hellip;" 
302            tooltip="Import data" 
303            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
304          />
305          <tbl:button 
306            id="btnExport"
307            data-plugin-type="EXPORT"
308            image="export.png" 
309            title="Export&hellip;" 
310            tooltip="Export data" 
311            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
312          />
313          <tbl:button 
314            id="btnRunPlugin"
315            data-plugin-type="OTHER"
316            image="runplugin.png" 
317            title="Run plugin&hellip;" 
318            tooltip="Run a plugin" 
319            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
320          />
321          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
322            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
323        </tbl:toolbar>
324        <tbl:panel>
325          <tbl:presetselector />
326          <tbl:navigator
327            page="<%=cc.getPage()%>" 
328            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
329            totalrows="<%=extraValueTypes == null ? 0 : extraValueTypes.getTotalCount()%>" 
330            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
331          />
332        </tbl:panel>
333      </div>
334      <tbl:data>
335        <tbl:headers>
336          <tbl:headerrow>
337            <tbl:header clazz="row-index bg-filled-100" />
338            <tbl:columnheaders />
339          </tbl:headerrow>
340          <%
341          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
342          int numRows = cc.getFilterRows();
343          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
344          {
345            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
346            %>
347            <tbl:headerrow>
348              <tbl:header subclass="row-index bg-filled-100">
349                <div class="index-<%=mode.getName()%>">
350                  <div class="index"></div>
351                  <div class="check">
352                    <base:icon 
353                      subclass="link table-check"
354                      image="check_uncheck.png" 
355                      tooltip="Toggle all (use CTRL, ALT or SHIFT to check/uncheck)" 
356                      visible="<%=lastRow && mode.hasCheck()%>"
357                    />
358                  </div>
359                  <div class="icons">
360                    <base:icon
361                      subclass="link table-filter-row-action"
362                      image="add.png"
363                      tooltip="Add extra filter row"
364                      visible="<%=lastRow%>"
365                    /><base:icon
366                      subclass="link table-filter-row-action"
367                      image="remove.png"
368                      tooltip="Remove this filter row"
369                      visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
370                      data-remove-row="<%=filterNo%>"
371                    />
372                  </div>
373                </div>
374              </tbl:header>
375              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
376            </tbl:headerrow>
377            <%
378          }
379          %>
380          <tbl:columnsubtitles />
381        </tbl:headers>
382        <tbl:rows>
383          <%
384          if (cc.getMessage() != null)
385          {
386            %>
387            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
388              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
389            </tbl:panel>
390            <%
391            cc.setMessage(null);
392          }
393          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
394          int selectedItemId = cc.getId();
395          if (extraValueTypes != null)
396          {           
397            while (extraValueTypes.hasNext())
398            {
399              ExtraValueType item = extraValueTypes.next();
400              int itemId = item.getId();
401              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
402              String tooltip = mode.isSelectionMode() ? 
403                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
404             
405              index++;
406              numListed++;
407              %>
408              <tbl:row>
409                <tbl:header clazz="row-index bg-filled-100">
410                  <div class="index-<%=mode.getName()%>">
411                    <div class="index <%=index>999?"index-smaller":""%>"><%=index%></div>
412                    <div class="check">
413                      <base:input
414                        type="checkbox" 
415                        name="<%=itemId%>" 
416                        value="<%=itemId%>" 
417                        title="<%=name%>" 
418                        checked="<%=cc.getSelected().contains(itemId)%>"
419                        visible="<%=mode.hasCheck()%>"
420                      />
421                      <base:input 
422                        type="radio" 
423                        name="item_id" 
424                        value="<%=itemId%>" 
425                        title="<%=name%>" 
426                        checked="<%=selectedItemId == itemId%>"
427                        visible="<%=mode.hasRadio()%>"
428                      />
429                    </div>
430                    <div class="icons">
431                      <base:icon 
432                        image="deleted.png"
433                        id="<%="delete."+itemId %>"
434                        subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : "disabled" %>"
435                        data-item-id="<%=itemId%>"
436                        tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
437                        visible="<%=item.isRemoved()%>"
438                      />
439                    </div>
440                  </div>
441                </tbl:header>
442                <tbl:cell column="name"><div 
443                  class="link table-item"
444                  data-item-id="<%=itemId%>"
445                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
446                  tabindex="0"
447                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></tbl:cell>
448                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
449                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
450                <tbl:cell column="externalId"><%=HTML.encodeTags(item.getExternalId())%></tbl:cell>
451                <tbl:cell column="valueType"><%=item.getValueType()%></tbl:cell>
452                <tbl:cell column="averageMethod"><%=item.getAverageMethod().toString()%></tbl:cell>
453                <tbl:cell column="useColors"><%=item.getColoring().isUsingColors() ? "yes" : "no"%></tbl:cell>
454                <tbl:cell column="logarithmic"><%=item.getColoring().isLogarithmic() ? "yes" : "no"%></tbl:cell>
455                <tbl:cell column="minValue"><%=Values.formatNumber(item.getColoring().getMinValue(), 2)%></tbl:cell>
456                <tbl:cell column="midValue"><%=Values.formatNumber(item.getColoring().getMidValue(), 2)%></tbl:cell>
457                <tbl:cell column="maxValue"><%=Values.formatNumber(item.getColoring().getMaxValue(), 2)%></tbl:cell>
458                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
459                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
460                  <tbl:cell column="xt-columns" />
461                </tbl:xt-cells>
462              </tbl:row>
463              <%
464              }
465            }
466          if (numListed == 0)
467          {
468            %>
469            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
470              <div class="messagecontainer note">
471              <%=extraValueTypes == null || extraValueTypes.getTotalCount() == 0 ? "No extra value types were found" : "No extra value types on this page. Please select another page!" %>
472              </div>
473            </tbl:panel>
474            <%
475          }
476          %>
477        </tbl:rows>
478      </tbl:data>
479    </tbl:table>
480    </div>
481   
482    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
483      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
484      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
485      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
486    </base:buttongroup>
487   
488  </base:body>
489  </base:page>
490  <%
491}
492finally
493{
494  if (extraValueTypes != null) extraValueTypes.close();
495  if (dc != null) dc.close();
496}
497%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.