source: branches/3.18-stable/www/admin/itemsubtypes/list_subtypes.jsp @ 7932

Last change on this file since 7932 was 7932, checked in by Nicklas Nordborg, 6 months ago

References #2246: Sticky table headers

Implemented for all item list pages and a few other places:

  • Extensions installation dialog
  • Administrate / Services list page
  • Batch inherit annotations
  • Manage list presets
  • List of changed item in view job dialog


  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 16.7 KB
Line 
1<%-- $Id: list_subtypes.jsp 7932 2021-04-28 07:16:56Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2011 Nicklas Nordborg
4
5  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
6  Available at http://base.thep.lu.se/
7
8  BASE is free software; you can redistribute it and/or
9  modify it under the terms of the GNU General Public License
10  as published by the Free Software Foundation; either version 3
11  of the License, or (at your option) any later version.
12
13  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
14  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
15  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
16  GNU General Public License for more details.
17
18  You should have received a copy of the GNU General Public License
19  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
20  ------------------------------------------------------------------
21
22  @author Nicklas
23  @since 3.0
24--%>
25<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
26  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
27  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
28  import="net.sf.basedb.core.Item"
29  import="net.sf.basedb.core.ItemSubtype"
30  import="net.sf.basedb.core.DataFileType"
31  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
32  import="net.sf.basedb.core.Include"
33  import="net.sf.basedb.core.Type"
34  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
35  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
36  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
37  import="net.sf.basedb.core.Permission"
38  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
39  import="net.sf.basedb.core.Metadata"
40  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
42  import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
43  import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
44  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
45  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
46  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
47  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
48  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
51  import="net.sf.basedb.util.Values"
52  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
59  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
60  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
61  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
62  import="java.util.Date"
63  import="java.util.List"
64  import="java.util.Map"
65%>
66<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
67<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
68<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
69<%!
70  private static final Item itemType = Item.ITEMSUBTYPE;
71  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
72  private static final Enumeration<String, String> items = new Enumeration<String, String>();
73  static
74  {
75    for (Item item : Metadata.getSubtypableItems())
76    {
77      items.add(Integer.toString(item.getValue()), item.toString());
78    }
79  }
80%>
81<%
82final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
83final String ID = sc.getId();
84final boolean writePermission = sc.hasPermission(Permission.WRITE, itemType);
85final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
86final boolean deletePermission = sc.hasPermission(Permission.DELETE, itemType);
87final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
88
89final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
90final String callback = request.getParameter("callback");
91final String title = mode.generateTitle("item subtype", "item subtypes");
92final DbControl dc = sc.newDbControl();
93ItemResultIterator<ItemSubtype> subtypes = null;
94try
95{
96  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
97
98  ItemQuery<ItemSubtype> relatedQuery = ItemSubtype.getQuery(null);
99  relatedQuery.join(Hql.innerJoin("parents", "pp"));
100  relatedQuery.restrict(Restrictions.eq(Hql.alias("pp"), Hql.entityParameter("subtype", Item.ITEMSUBTYPE)));
101  relatedQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
102  relatedQuery.include(cc.getInclude());
103 
104  final ItemQuery<DataFileType> fileTypesQuery = DataFileType.getQuery();
105  fileTypesQuery.include(cc.getInclude());
106  fileTypesQuery.join(Hql.innerJoin("itemSubtypes", "ist"));
107  fileTypesQuery.join(Hql.innerJoin("ist", "itemSubtype", "ist2"));
108  fileTypesQuery.restrict(Restrictions.eq(Hql.alias("ist2"), Expressions.parameter("subtype")));
109  fileTypesQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name"))); 
110
111  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
112  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
113  try
114  {
115    final ItemQuery<ItemSubtype> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, jspContext, true, ItemSubtype.getQuery(null), mode);
116    subtypes = query.iterate(dc);
117  }
118  catch (Throwable t)
119  {
120    cc.setMessage(t.getMessage());
121    t.printStackTrace();
122  }
123  int numListed = 0;
124  ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
125  ExtensionsInvoker<ListColumnAction<ItemSubtype,?>> columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
126  %>
127  <base:page title="<%=title==null ? "Item subtypes" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
128  <base:head scripts="table.js,~subtypes.js" styles="table.css,toolbar.css">
129    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
130    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
131  </base:head>
132 
133  <base:body>
134    <h1><%=title==null ? "Item subtypes" : title%></h1>
135    <div class="content">
136    <tbl:table 
137      id="subtypes" 
138      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
139      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
140      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
141      action="index.jsp"
142      sc="<%=sc%>"
143      item="<%=itemType%>"
144      filterrows="<%=cc.getFilterRows()%>"
145      subclass="fulltable sticky-headers"
146      >
147      <tbl:hidden 
148        name="mode" 
149        value="<%=mode.getName()%>" 
150      />
151      <tbl:hidden 
152        name="callback" 
153        value="<%=callback%>" 
154        skip="<%=callback == null%>" 
155      />
156      <tbl:columndef 
157        id="name"
158        property="name"
159        datatype="string"
160        title="Name"
161        sortable="true" 
162        filterable="true"
163        exportable="true"
164        show="always" 
165      />
166      <tbl:columndef 
167        id="id"
168        clazz="uniquecol"
169        property="id"
170        datatype="int"
171        title="ID"
172        sortable="true"
173        filterable="true"
174        exportable="true"
175      />
176      <tbl:columndef 
177        id="entryDate"
178        property="entryDate"
179        datatype="date"
180        title="Registered"
181        sortable="true" 
182        filterable="true"
183        exportable="true"
184        formatter="<%=dateFormatter%>"
185      />
186      <tbl:columndef 
187        id="systemId"
188        clazz="uniquecol"
189        property="systemId"
190        datatype="string"
191        title="System ID"
192        sortable="true"
193        filterable="true"
194        exportable="true"
195      />
196      <tbl:columndef 
197        id="itemType"
198        property="itemType"
199        datatype="int"
200        title="Main item type"
201        enumeration="<%=items%>"
202        sortable="true"
203        filterable="true"
204        exportable="true"
205      />
206      <tbl:columndef 
207        id="pushAnnotations"
208        property="pushAnnotations"
209        datatype="boolean"
210        title="Push annotations to parent"
211        sortable="true"
212        filterable="true"
213        exportable="true"
214      />
215      <tbl:columndef 
216        id="relatedTypes"
217        property="&relatedSubtypes(name)"
218        datatype="string"
219        title="Related item types"
220        filterable="true"
221        exportable="true"
222      />     
223      <tbl:columndef
224        id="dataFileTypes"
225        title="File types"
226        property="&fileTypes(dataFileType.name)"
227        datatype="string"
228        filterable="true"
229        exportable="true"
230      />
231      <tbl:columndef 
232        id="description"
233        property="description"
234        datatype="string"
235        title="Description" 
236        sortable="true" 
237        filterable="true" 
238        exportable="true"
239      />
240      <tbl:columndef 
241        id="xt-columns" 
242        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
243        jspcontext="<%=jspContext%>" 
244      />
245      <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
246        <tbl:toolbar
247          subclass="bottomborder"
248          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
249          >
250          <tbl:button
251            id="btnNewItem"
252            visible="<%=!mode.isSelectionMode() %>"
253            disabled="<%=createPermission ? false : true %>"
254            image="new.png"
255            title="New&hellip;" 
256            tooltip="<%=createPermission ? "Create new item subtype" : "You do not have permission to create item subtypes"%>"
257          />
258          <tbl:button
259            id="btnDeleteItems"
260            disabled="<%=deletePermission ? false : true %>"
261            image="delete.png"
262            title="Delete"
263            tooltip="<%=deletePermission ? "Delete the selected items" : "You do not have permission to delete item subtypes" %>" 
264          />
265          <tbl:button 
266            id="btnRestoreItems"
267            disabled="<%=!writePermission%>" 
268            image="restore.png" 
269            title="Restore" 
270            tooltip="<%=writePermission ? "Restore the selected (deleted) items" : "You do not have permission to edit item subtypes" %>" 
271          />
272          <tbl:button 
273            id="btnColumns"
274            image="columns.png" 
275            title="Columns&hellip;" 
276            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
277          />
278          <tbl:button 
279            id="btnImport"
280            data-plugin-type="IMPORT"
281            image="import.png" 
282            title="Import&hellip;" 
283            tooltip="Import data" 
284            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
285          />
286          <tbl:button 
287            id="btnExport"
288            data-plugin-type="EXPORT"
289            image="export.png" 
290            title="Export&hellip;" 
291            tooltip="Export data" 
292            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
293          />
294          <tbl:button 
295            id="btnRunPlugin"
296            data-plugin-type="OTHER"
297            image="runplugin.png" 
298            title="Run plugin&hellip;" 
299            tooltip="Run a plugin" 
300            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
301          />
302          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
303            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
304        </tbl:toolbar>
305        <tbl:panel>
306          <tbl:presetselector />
307          <tbl:navigator
308            page="<%=cc.getPage()%>" 
309            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
310            totalrows="<%=subtypes == null ? 0 : subtypes.getTotalCount()%>" 
311            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
312          />
313        </tbl:panel>
314      </div>
315      <tbl:data>
316        <tbl:headers>
317          <tbl:headerrow>
318            <tbl:header colspan="3" />
319            <tbl:columnheaders />
320          </tbl:headerrow>
321          <%
322          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
323          int numRows = cc.getFilterRows();
324          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
325          {
326            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
327            %>
328            <tbl:headerrow>
329              <tbl:header subclass="index" />
330              <tbl:header 
331                subclass="check" 
332                visible="<%=mode.hasCheck()%>"
333                ><base:icon 
334                  subclass="link table-check"
335                  image="check_uncheck.png" 
336                  tooltip="Toggle all (use CTRL, ALT or SHIFT to check/uncheck)" 
337                  visible="<%=lastRow%>"
338                /></tbl:header>
339              <tbl:header 
340                subclass="check" 
341                visible="<%=mode.hasRadio()%>"
342                />
343              <tbl:header 
344                subclass="icons" 
345                visible="<%=mode.hasIcons()%>"
346                >
347                <base:icon
348                  subclass="link table-filter-row-action"
349                  image="add.png"
350                  tooltip="Add extra filter row"
351                  visible="<%=lastRow%>"
352                /><base:icon
353                  subclass="link table-filter-row-action"
354                  image="remove.png"
355                  tooltip="Remove this filter row"
356                  visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
357                  data-remove-row="<%=filterNo%>"
358                />
359              </tbl:header>
360              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
361            </tbl:headerrow>
362            <%
363          }
364          %>
365          <tbl:columnsubtitles />
366        </tbl:headers>
367        <tbl:rows>
368          <%
369          if (cc.getMessage() != null)
370          {
371            %>
372            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
373              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
374            </tbl:panel>
375            <%
376            cc.setMessage(null);
377          }
378          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
379          int selectedItemId = cc.getId();
380          if (subtypes != null)
381          {
382           
383            while (subtypes.hasNext())
384            {
385              ItemSubtype item = subtypes.next();
386              int itemId = item.getId();
387              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
388             
389              boolean usePermission = item.hasPermission(Permission.USE);
390              String tooltip = mode.isSelectionMode() ? 
391                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
392              index++;
393              numListed++;
394              %>
395              <tbl:row>
396                <tbl:header 
397                  clazz="index"
398                  ><%=index%></tbl:header>
399                <tbl:header 
400                  clazz="check" 
401                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
402                  ><input 
403                    type="checkbox" 
404                    name="<%=itemId%>" 
405                    value="<%=itemId%>" 
406                    title="<%=name%>" 
407                    <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%> 
408                  ></tbl:header>
409                <tbl:header 
410                  clazz="check" 
411                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
412                  ><input 
413                    type="radio" 
414                    name="item_id" 
415                    value="<%=itemId%>" 
416                    title="<%=name%>" 
417                    <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
418                  ></tbl:header>
419                <tbl:header 
420                  clazz="icons" 
421                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
422                  ><base:icon 
423                    image="deleted.png"
424                    id="<%="delete."+itemId %>"
425                    subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : "disabled" %>"
426                    data-item-id="<%=itemId%>"
427                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
428                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
429                  /><base:icon
430                    image="systemitem.png"
431                    tooltip="This item is a system item"
432                    visible="<%=item.isSystemItem()%>" 
433                  />&nbsp;</tbl:header>
434                <tbl:cell column="name"><div 
435                  class="link table-item"
436                  data-item-id="<%=itemId%>"
437                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
438                  tabindex="0"
439                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
440                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
441                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
442                <tbl:cell column="systemId"><%=Values.getString(item.getSystemId())%></tbl:cell>
443                <tbl:cell column="itemType"><%=item.getMainItemType()%></tbl:cell>
444                <tbl:cell column="pushAnnotations"><%=item.getPushAnnotations() %></tbl:cell>
445                <tbl:cell column="relatedTypes">
446                  <%
447                  relatedQuery.setEntityParameter("subtype", item);
448                  String separator = "";
449                  for (ItemSubtype related : relatedQuery.list(dc))
450                  {
451                    out.write(separator);
452                    if (mode.hasPropertyLink())
453                    {
454                      out.write(Base.getLinkedName(ID, related, false, mode.hasEditLink()));
455                    }
456                    else
457                    {
458                      out.write(HTML.encodeTags(related.getName()));
459                    }
460                    out.write(" (" + related.getMainItemType() + ")");
461                    separator = ", ";
462                  }
463                  %>
464                </tbl:cell>
465                <tbl:cell column="dataFileTypes">
466                  <%
467                  fileTypesQuery.setParameter("subtype", itemId, Type.INT);
468                  String separator = "";
469                  for (DataFileType dft : fileTypesQuery.list(dc))
470                  {
471                    out.write(separator);
472                    if (mode.hasPropertyLink())
473                    {
474                      out.write(Base.getLinkedName(ID, dft, false, mode.hasEditLink()));
475                    }
476                    else
477                    {
478                      out.write(HTML.encodeTags(dft.getName()));
479                    }
480                    separator = ", ";
481                  }
482                  %>
483                </tbl:cell>
484                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
485                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
486                  <tbl:cell column="xt-columns" />
487                </tbl:xt-cells>
488              </tbl:row>
489              <%
490              }
491            }
492          if (numListed == 0)
493          {
494            %>
495            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
496              <div class="messagecontainer note">
497              <%=subtypes == null || subtypes.getTotalCount() == 0 ? "No item subtypes were found" : "No item subtypes on this page. Please select another page!" %>
498              </div>
499            </tbl:panel>
500            <%
501          }
502          %>
503        </tbl:rows>
504      </tbl:data>
505    </tbl:table>
506    </div>
507   
508    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
509      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
510      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
511      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
512    </base:buttongroup>
513   
514  </base:body>
515  </base:page>
516  <%
517}
518finally
519{
520  if (subtypes != null) subtypes.close();
521  if (dc != null) dc.close();
522}
523%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.