source: branches/3.18-stable/www/admin/jobagents/list_agents.jsp @ 7932

Last change on this file since 7932 was 7932, checked in by Nicklas Nordborg, 6 months ago

References #2246: Sticky table headers

Implemented for all item list pages and a few other places:

  • Extensions installation dialog
  • Administrate / Services list page
  • Batch inherit annotations
  • Manage list presets
  • List of changed item in view job dialog


  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 18.9 KB
Line 
1<%-- $Id: list_agents.jsp 7932 2021-04-28 07:16:56Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Nicklas Nordborg
4  Copyright (C) 2007 Johan Enell, Martin Svensson
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.Item"
30  import="net.sf.basedb.core.JobAgent"
31  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
32  import="net.sf.basedb.core.Include"
33  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
34  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
35  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
36  import="net.sf.basedb.core.Nameable"
37  import="net.sf.basedb.core.Permission"
38  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
39  import="net.sf.basedb.core.Job"
40  import="net.sf.basedb.core.Type"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
42  import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
43  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
44  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
45  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
46  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
47  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
48  import="net.sf.basedb.util.ShareableUtil"
49  import="net.sf.basedb.util.jobagent.JobInfo"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
54  import="net.sf.basedb.util.Values"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
59  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
60  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
61  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
62  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
63  import="java.util.Iterator"
64  import="java.util.List"
65  import="java.util.Map"
66  import="java.util.Set"
67%>
68<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
69<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
70<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
71<%!
72  private static final Item itemType = Item.JOBAGENT;
73  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
74%>
75<%
76final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
77final String ID = sc.getId();
78final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
79final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
80
81final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
82final String callback = request.getParameter("callback");
83final String title = mode.generateTitle("job agent", "job agents");
84final DbControl dc = sc.newDbControl();
85ItemResultIterator<JobAgent> agents = null;
86try
87{
88  final ItemQuery<PluginDefinition> pluginQuery = PluginDefinition.getQuery();
89  pluginQuery.include(cc.getInclude());
90  pluginQuery.join(Hql.innerJoin("jobAgentSettings", Item.JOBAGENTSETTINGS.getAlias()));
91  pluginQuery.restrict(Restrictions.eq(Hql.property(Item.JOBAGENTSETTINGS.getAlias(), "jobAgent"), Expressions.parameter("agent")));
92  pluginQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
93 
94  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
95  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
96  try
97  {
98    final ItemQuery<JobAgent> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, jspContext, true, JobAgent.getQuery(), mode);
99    agents = query.iterate(dc);
100  }
101  catch (Throwable t)
102  {
103    cc.setMessage(t.getMessage());
104  }
105  int numListed = 0;
106  ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
107  ExtensionsInvoker<ListColumnAction<JobAgent,?>> columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
108  %>
109  <base:page title="<%=title==null ? "Job agents" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
110  <base:head scripts="table.js,~agents.js" styles="table.css,toolbar.css">
111    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
112    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
113  </base:head>
114 
115  <base:body>
116    <h1><%=title==null ? "Job agents" : title%></h1>
117    <div class="content">
118    <tbl:table 
119      id="agents" 
120      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
121      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
122      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
123      action="index.jsp"
124      sc="<%=sc%>"
125      item="<%=itemType%>"
126      filterrows="<%=cc.getFilterRows()%>"
127      subclass="fulltable sticky-headers"
128      >
129      <tbl:hidden 
130        name="mode" 
131        value="<%=mode.getName()%>" 
132      />
133      <tbl:hidden 
134        name="callback" 
135        value="<%=callback%>" 
136        skip="<%=callback == null%>" 
137      />
138      <tbl:columndef 
139        id="name"
140        property="name"
141        datatype="string"
142        title="Name"
143        sortable="true" 
144        filterable="true"
145        exportable="true"
146        show="always" 
147      />
148      <tbl:columndef 
149        id="id"
150        clazz="uniquecol"
151        property="id"
152        datatype="int"
153        title="ID"
154        sortable="true"
155        filterable="true"
156        exportable="true"
157      />
158      <tbl:columndef 
159        id="externalId"
160        clazz="uniquecol"
161        property="externalId"
162        datatype="string"
163        title="External ID"
164        sortable="true"
165        filterable="true"
166        exportable="true"
167      />
168      <tbl:columndef 
169        id="server"
170        property="server"
171        datatype="string"
172        title="Server"
173        sortable="true"
174        filterable="true"
175        exportable="true"
176      />
177      <tbl:columndef 
178        id="port"
179        property="port"
180        datatype="int"
181        title="Port"
182        sortable="true"
183        filterable="true"
184        exportable="true"
185      />
186      <tbl:columndef
187        id="status"
188        title="Status"
189      />
190      <tbl:columndef
191        id="info"
192        title="CPU/Memory"
193      />
194      <tbl:columndef 
195        id="owner"
196        property="owner.name"
197        datatype="string"
198        title="Owner"
199        sortable="true" 
200        filterable="true"
201        exportable="true"
202      />
203      <tbl:columndef 
204        id="description"
205        property="description"
206        datatype="string"
207        title="Description" 
208        sortable="true" 
209        filterable="true" 
210        exportable="true"
211      />
212      <tbl:columndef
213        id="jobs"
214        title="Jobs"
215      />
216      <tbl:columndef
217        id="plugins"
218        title="Plugins"
219        property="&plugins(pluginDefinition.name)"
220        datatype="string"
221        filterable="true"
222      />
223      <tbl:columndef
224        id="permission"
225        title="Permission"
226      />
227      <tbl:columndef
228        id="sharedTo"
229        title="Shared to"
230        filterable="true"
231        filterproperty="!sharedTo.name"
232        datatype="string"
233      />
234      <tbl:columndef 
235        id="xt-columns" 
236        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
237        jspcontext="<%=jspContext%>" 
238      />
239      <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
240        <tbl:toolbar
241          subclass="bottomborder"
242          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
243          >
244          <tbl:button 
245            id="btnNewItem"
246            disabled="<%=!createPermission%>" 
247            image="new.png" 
248            title="New&hellip;" 
249            tooltip="<%=createPermission ? "Create new job agent" : "You do not have permission to create job agents"%>" 
250          />
251          <tbl:button 
252            id="btnDeleteItems"
253            image="delete.png"
254            title="Delete" 
255            tooltip="Delete the selected items" 
256          />
257          <tbl:button 
258            id="btnRestoreItems"
259            image="restore.png"
260            title="Restore" 
261            tooltip="Restore the selected (deleted) items"
262          />
263          <tbl:button 
264            id="btnShareItems"
265            image="share.png"
266            title="Share&hellip;" 
267            tooltip="Share the selected items"
268          />
269          <tbl:button 
270            id="btnSetOwner"
271            image="take_ownership.png"
272            title="Set owner&hellip;"
273            tooltip="Change owner of the selected items"
274          />
275          <tbl:button 
276            id="btnColumns"
277            image="columns.png" 
278            title="Columns&hellip;" 
279            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
280          />
281          <tbl:button 
282            id="btnImport"
283            data-plugin-type="IMPORT"
284            image="import.png" 
285            title="Import&hellip;" 
286            tooltip="Import data" 
287            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
288          />
289          <tbl:button 
290            id="btnExport"
291            data-plugin-type="EXPORT"
292            image="export.png" 
293            title="Export&hellip;" 
294            tooltip="Export data" 
295            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
296          />
297          <tbl:button 
298            id="btnRunPlugin"
299            data-plugin-type="OTHER"
300            image="runplugin.png" 
301            title="Run plugin&hellip;" 
302            tooltip="Run a plugin" 
303            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
304          />
305          <tbl:button
306            id="btnPause"
307            image="pause.png"
308            data-action="PauseSelected"
309            title="Pause"
310            tooltip="Pause the selected job agents"
311          />
312          <tbl:button
313            id="btnStart"
314            image="start.png"
315            data-action="StartSelected"
316            title="Start"
317            tooltip="Start the selected job agents"
318          />
319          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
320            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
321        </tbl:toolbar>
322        <tbl:panel>
323          <tbl:presetselector />
324          <tbl:navigator
325            page="<%=cc.getPage()%>" 
326            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
327            totalrows="<%=agents == null ? 0 : agents.getTotalCount()%>" 
328            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
329          />
330        </tbl:panel>
331      </div>
332      <tbl:data>
333        <tbl:headers>
334          <tbl:headerrow>
335            <tbl:header colspan="3" />
336            <tbl:columnheaders />
337          </tbl:headerrow>
338          <%
339          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
340          int numRows = cc.getFilterRows();
341          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
342          {
343            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
344            %>
345            <tbl:headerrow>
346              <tbl:header subclass="index" />
347              <tbl:header 
348                subclass="check" 
349                visible="<%=mode.hasCheck()%>"
350                ><base:icon 
351                  subclass="link table-check"
352                  image="check_uncheck.png" 
353                  tooltip="Toggle all (use CTRL, ALT or SHIFT to check/uncheck)" 
354                  visible="<%=lastRow%>"
355                /></tbl:header>
356              <tbl:header 
357                subclass="check" 
358                visible="<%=mode.hasRadio()%>"
359                />
360              <tbl:header 
361                subclass="icons" 
362                visible="<%=mode.hasIcons()%>"
363                >
364                <base:icon
365                  subclass="link table-filter-row-action"
366                  image="add.png"
367                  tooltip="Add extra filter row"
368                  visible="<%=lastRow%>"
369                /><base:icon
370                  subclass="link table-filter-row-action"
371                  image="remove.png"
372                  tooltip="Remove this filter row"
373                  visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
374                  data-remove-row="<%=filterNo%>"
375                />
376              </tbl:header>
377              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
378            </tbl:headerrow>
379            <%
380          }
381          %>
382          <tbl:columnsubtitles />
383        </tbl:headers>
384        <tbl:rows>
385          <%
386          if (cc.getMessage() != null)
387          {
388            %>
389            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
390              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
391            </tbl:panel>
392            <%
393            cc.setMessage(null);
394          }
395          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
396          int selectedItemId = cc.getId();
397          if (agents != null)
398          {           
399            while (agents.hasNext())
400            {
401              JobAgent item = agents.next();
402              int itemId = item.getId();
403             
404             
405              boolean deletePermission = item.hasPermission(Permission.DELETE);
406              boolean sharePermission = item.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION);
407              boolean writePermission = item.hasPermission(Permission.WRITE);
408              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
409              String tooltip = mode.isSelectionMode() ? 
410                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
411              index++;
412              numListed++;
413              %>
414              <tbl:row>
415                <tbl:header 
416                  clazz="index"
417                  ><%=index%></tbl:header>
418                <tbl:header 
419                  clazz="check" 
420                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
421                  ><input 
422                    type="checkbox" 
423                    name="<%=itemId%>" 
424                    value="<%=itemId%>" 
425                    title="<%=name%>" 
426                    <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%> 
427                  ></tbl:header>
428                <tbl:header 
429                  clazz="check" 
430                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
431                  ><input 
432                    type="radio" 
433                    name="item_id" 
434                    value="<%=itemId%>" 
435                    title="<%=name%>" 
436                    <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
437                  ></tbl:header>
438                <tbl:header 
439                  clazz="icons" 
440                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
441                  ><base:icon 
442                    image="deleted.png"
443                    id="<%="delete."+itemId %>"
444                    subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : "disabled" %>"
445                    data-item-id="<%=itemId%>"
446                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
447                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
448                  /><base:icon 
449                    image="shared.png" 
450                    id="<%="share."+itemId %>"
451                    subclass="<%=sharePermission ? "table-share-item" : "disabled" %>"
452                    data-item-id="<%=itemId%>"
453                    tooltip="This item is shared to other users, groups and/or projects" 
454                    visible="<%=item.isShared()%>"
455                  />&nbsp;</tbl:header>
456                <tbl:cell column="name"><div 
457                  class="link table-item"
458                  data-item-id="<%=itemId%>"
459                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
460                  tabindex="0"
461                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
462                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
463                <tbl:cell column="externalId"><%=HTML.encodeTags(item.getExternalId())%></tbl:cell>
464                <tbl:cell column="server"><%=HTML.encodeTags(item.getServer())%></tbl:cell>
465                <tbl:cell column="port"><%=item.getPort() == null ? "" : item.getPort().toString()%></tbl:cell>
466                <tbl:cell column="status">
467                  <%
468                  Boolean paused = item.getInfo().isPaused();
469                  %>
470                  <%=paused == null ? "<i>- unknown -</i>" : paused == true ? "Paused" : "Running"%>
471                </tbl:cell>
472                <tbl:cell column="info">
473                  CPU usage: <%=item.getCpuUsage() == null ? "<i>- unknown -</i>" : item.getCpuUsage()+"%" %><br>
474                  Total memory: <%=item.getTotalMemory() == null ? "<i>- unknown -</i>" : Values.formatBytes(item.getTotalMemory()) %><br>
475                  Used memory: <%=item.getUsedMemory() == null ? "<i>- unknown -</i>" : Values.formatBytes(item.getUsedMemory()) %>
476                </tbl:cell>
477                <tbl:cell column="jobs">
478                  <%
479                  Set<JobInfo> jobs = item.getInfo().getJobInfo();
480                  if (jobs == null)
481                  {
482                    %>
483                    Unknown
484                    <%
485                  }
486                  else if (jobs.size() == 0)
487                  {
488                    %>
489                    <i>- none -</i>
490                    <%
491                  }
492                  else
493                  {
494                    String separator = "";
495                    for (JobInfo jobInfo : jobs)
496                    {
497                      try
498                      {
499                        Job job = Job.getById(dc, jobInfo.getJobId());
500                        int percent = job.getPercentComplete();
501                        Job.ExecutionTime estimated = job.getEstimatedExecutionTime();
502                        out.write(separator);
503                        if (mode.hasPropertyLink())
504                        {
505                          out.write(Base.getLinkedName(ID, job, false, mode.hasEditLink()));
506                        }
507                        else
508                        {
509                          out.write(HTML.encodeTags(job.getName()));
510                        }
511                        out.write(" (");
512                        if (percent != -1) out.write(percent + "%, ");
513                        out.write(estimated.name());
514                        out.write(")");
515                        separator = ", ";
516                      }
517                      catch (Throwable t)
518                      {
519                        %>
520                        <div class="error"><%=t.getMessage()%></div>
521                        <%
522                      }
523                    }
524                  }
525                  %>
526                </tbl:cell>
527                <tbl:cell column="plugins">
528                  <%
529                  pluginQuery.setParameter("agent", itemId, Type.INT);
530                  try
531                  {
532                    String separator = "";
533                    for (PluginDefinition p : pluginQuery.list(dc))
534                    {
535                      out.write(separator);
536                      if (mode.hasPropertyLink())
537                      {
538                        out.write(Base.getLink(ID, p.getName(), Item.PLUGINDEFINITION, p.getId(), mode.hasEditLink()));
539                      }
540                      else
541                      {
542                        out.write(HTML.encodeTags(p.getName()));
543                      }
544                      separator = ", ";
545                    }
546                  }
547                  catch (Throwable t)
548                  {
549                    %>
550                    <div class="error"><%=t.getMessage()%></div>
551                    <%
552                  }
553                  %>
554                </tbl:cell>
555                <tbl:cell column="owner"
556                  ><base:propertyvalue 
557                    item="<%=item%>" 
558                    property="owner"
559                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
560                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
561                  /></tbl:cell>
562                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
563                <tbl:cell column="permission"><%=PermissionUtil.getShortPermissions(item)%></tbl:cell>
564                <tbl:cell column="sharedTo">
565                  <%
566                  Iterator<Nameable> sharees = ShareableUtil.getSharedTo(dc, item).iterator();
567                  while(sharees.hasNext())
568                  {
569                    Nameable n = sharees.next();
570                    if (mode.hasPropertyLink())
571                    {
572                      out.write(Base.getLinkedName(ID, n, false, mode.hasEditLink()));
573                    }
574                    else
575                    {
576                      out.write(HTML.encodeTags(n.getName()));
577                    }
578                    out.write(sharees.hasNext() ? ", " : "");
579                  }
580                  %>
581                </tbl:cell>
582                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
583                  <tbl:cell column="xt-columns" />
584                </tbl:xt-cells>
585              </tbl:row>
586              <%
587              }
588            }
589          if (numListed == 0)
590          {
591            %>
592            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
593              <div class="messagecontainer note">
594              <%=agents == null || agents.getTotalCount() == 0 ? "No job agents were found" : "No job agents on this page. Please select another page!" %>
595              </div>
596            </tbl:panel>
597            <%
598          }
599          %>
600        </tbl:rows>
601      </tbl:data>
602    </tbl:table>
603    </div>
604   
605    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
606      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
607      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
608      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
609    </base:buttongroup>
610   
611  </base:body>
612  </base:page>
613  <%
614}
615finally
616{
617  if (agents != null) agents.close();
618  if (dc != null) dc.close();
619}
620%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.