source: branches/3.18-stable/www/admin/platforms/list_platforms.jsp @ 7932

Last change on this file since 7932 was 7932, checked in by Nicklas Nordborg, 6 months ago

References #2246: Sticky table headers

Implemented for all item list pages and a few other places:

  • Extensions installation dialog
  • Administrate / Services list page
  • Batch inherit annotations
  • Manage list presets
  • List of changed item in view job dialog


  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 15.5 KB
Line 
1<%-- $Id:list_platforms.jsp 3820 2007-10-12 10:03:18Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2007 Nicklas Nordborg
4
5  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
6  Available at http://base.thep.lu.se/
7
8  BASE is free software; you can redistribute it and/or
9  modify it under the terms of the GNU General Public License
10  as published by the Free Software Foundation; either version 3
11  of the License, or (at your option) any later version.
12
13  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
14  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
15  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
16  GNU General Public License for more details.
17
18  You should have received a copy of the GNU General Public License
19  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
20  ------------------------------------------------------------------
21
22  @author Nicklas
23  @version 2.0
24--%>
25<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
26  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
27  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
28  import="net.sf.basedb.core.Item"
29  import="net.sf.basedb.core.Platform"
30  import="net.sf.basedb.core.PlatformVariant"
31  import="net.sf.basedb.core.RawDataType"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
33  import="net.sf.basedb.core.Include"
34  import="net.sf.basedb.core.Type"
35  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
36  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
37  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
38  import="net.sf.basedb.core.Permission"
39  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
40  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
42  import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
43  import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
44  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
45  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
46  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
47  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
48  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
51  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
59  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
60  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
61  import="net.sf.basedb.util.Values"
62  import="java.util.List"
63  import="java.util.Map"
64  import="java.util.Date"
65%>
66<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
67<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
68<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
69<%!
70  private static final Item itemType = Item.PLATFORM;
71  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
72%>
73<%
74final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
75final String ID = sc.getId();
76final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
77final boolean writePermission = sc.hasPermission(Permission.WRITE, itemType);
78final boolean deletePermission = sc.hasPermission(Permission.DELETE, itemType);
79final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
80
81final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
82final String callback = request.getParameter("callback");
83final String title = mode.generateTitle("platform", "platforms");
84final DbControl dc = sc.newDbControl();
85ItemResultIterator<Platform> platforms = null;
86try
87{
88  // Query for variants of a platform
89  final ItemQuery<PlatformVariant> variantQuery = PlatformVariant.getQuery();
90  variantQuery.include(cc.getInclude());
91  variantQuery.restrict(Restrictions.eq(Hql.property("platform"), Expressions.parameter("platform")));
92  variantQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name"))); 
93  final boolean createVariantPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, Item.PLATFORMVARIANT); 
94
95  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
96  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
97  try
98  {
99    final ItemQuery<Platform> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, jspContext, true, Platform.getQuery(), mode);
100    platforms = query.iterate(dc);
101  }
102  catch (Throwable t)
103  {
104    cc.setMessage(t.getMessage());
105  }
106  int numListed = 0;
107  ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
108  ExtensionsInvoker<ListColumnAction<Platform,?>> columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
109  %>
110  <base:page title="<%=title==null ? "Platforms" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
111  <base:head scripts="table.js,~platforms.js" styles="table.css,toolbar.css">
112    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
113    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
114  </base:head>
115 
116  <base:body>
117    <h1><%=title==null ? "Platforms" : title%></h1>
118    <div class="content">
119    <tbl:table 
120      id="platforms" 
121      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
122      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
123      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
124      action="index.jsp"
125      sc="<%=sc%>"
126      item="<%=itemType%>"
127      filterrows="<%=cc.getFilterRows()%>"
128      subclass="fulltable sticky-headers"
129      >
130      <tbl:hidden 
131        name="mode" 
132        value="<%=mode.getName()%>" 
133      />
134      <tbl:hidden 
135        name="callback" 
136        value="<%=callback%>" 
137        skip="<%=callback == null%>" 
138      />
139      <tbl:columndef 
140        id="name"
141        property="name"
142        datatype="string"
143        title="Name"
144        sortable="true" 
145        filterable="true"
146        exportable="true"
147        show="always" 
148      />
149      <tbl:columndef 
150        id="id"
151        clazz="uniquecol"
152        property="id"
153        datatype="int"
154        title="ID"
155        sortable="true"
156        filterable="true"
157        exportable="true"
158      />
159      <tbl:columndef 
160        id="externalId"
161        clazz="uniquecol"
162        property="externalId"
163        datatype="string"
164        title="External ID"
165        sortable="true"
166        filterable="true"
167        exportable="true"
168      />
169      <tbl:columndef 
170        id="fileOnly"
171        property="fileOnly"
172        datatype="boolean"
173        title="File-only"
174        sortable="true"
175        filterable="true"
176        exportable="true"
177      />
178      <tbl:columndef 
179        id="rawDataType"
180        property="rawDataType"
181        datatype="string"
182        title="Raw data type"
183        sortable="true"
184        filterable="true"
185        exportable="true"
186      />
187      <tbl:columndef 
188        id="channels"
189        property="channels"
190        datatype="int"
191        title="Channels"
192        sortable="true"
193        filterable="true"
194        exportable="true"
195      />
196      <tbl:columndef
197        id="variants"
198        title="Variants"
199        property="&variants(name)"
200        datatype="string"
201        filterable="true"
202        exportable="true"
203      />
204      <tbl:columndef 
205        id="description"
206        property="description"
207        datatype="string"
208        title="Description" 
209        sortable="true" 
210        filterable="true" 
211        exportable="true"
212      />
213      <tbl:columndef 
214        id="xt-columns" 
215        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
216        jspcontext="<%=jspContext%>" 
217      />
218      <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
219        <tbl:toolbar
220          subclass="bottomborder"
221          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
222          >
223          <tbl:button 
224            id="btnNewItem"
225            disabled="<%=!createPermission%>" 
226            image="new.png" 
227            title="New&hellip;" 
228            tooltip="<%=createPermission ? "Create platforms" : "You do not have permission to create platforms"%>" 
229          />
230          <tbl:button 
231            id="btnDeleteItems"
232            disabled="<%=!deletePermission%>" 
233            image="delete.png" 
234            title="Delete" 
235            tooltip="<%=deletePermission ? "Delete the selected items" : "You do not have permission to delete platforms" %>" 
236          />
237          <tbl:button 
238            id="btnRestoreItems"
239            disabled="<%=!writePermission%>" 
240            image="restore.png" 
241            title="Restore" 
242            tooltip="<%=writePermission ? "Restore the selected (deleted) items" : "You do not have permission to edit platforms" %>" 
243          />
244          <tbl:button 
245            id="btnColumns"
246            image="columns.png" 
247            title="Columns&hellip;" 
248            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
249          />
250          <tbl:button 
251            id="btnImport"
252            data-plugin-type="IMPORT"
253            image="import.png" 
254            title="Import&hellip;" 
255            tooltip="Import data" 
256            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
257          />
258          <tbl:button 
259            id="btnExport"
260            data-plugin-type="EXPORT"
261            image="export.png" 
262            title="Export&hellip;" 
263            tooltip="Export data" 
264            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
265          />
266          <tbl:button 
267            id="btnRunPlugin"
268            data-plugin-type="OTHER"
269            image="runplugin.png" 
270            title="Run plugin&hellip;" 
271            tooltip="Run a plugin" 
272            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
273          />
274          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
275            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
276        </tbl:toolbar>
277        <tbl:panel>
278          <tbl:presetselector />
279          <tbl:navigator
280            page="<%=cc.getPage()%>" 
281            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
282            totalrows="<%=platforms == null ? 0 : platforms.getTotalCount()%>" 
283            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
284          />
285        </tbl:panel>
286      </div>
287      <tbl:data>
288        <tbl:headers>
289          <tbl:headerrow>
290            <tbl:header colspan="3" />
291            <tbl:columnheaders />
292          </tbl:headerrow>
293          <%
294          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
295          int numRows = cc.getFilterRows();
296          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
297          {
298            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
299            %>
300            <tbl:headerrow>
301              <tbl:header subclass="index" />
302              <tbl:header 
303                subclass="check" 
304                visible="<%=mode.hasCheck()%>"
305                ><base:icon 
306                  subclass="link table-check"
307                  image="check_uncheck.png" 
308                  tooltip="Toggle all (use CTRL, ALT or SHIFT to check/uncheck)" 
309                  visible="<%=lastRow%>"
310                /></tbl:header>
311              <tbl:header 
312                subclass="check" 
313                visible="<%=mode.hasRadio()%>"
314                />
315              <tbl:header 
316                subclass="icons" 
317                visible="<%=mode.hasIcons()%>"
318                >
319                <base:icon
320                  subclass="link table-filter-row-action"
321                  image="add.png"
322                  tooltip="Add extra filter row"
323                  visible="<%=lastRow%>"
324                /><base:icon
325                  subclass="link table-filter-row-action"
326                  image="remove.png"
327                  tooltip="Remove this filter row"
328                  visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
329                  data-remove-row="<%=filterNo%>"
330                />
331              </tbl:header>
332              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
333            </tbl:headerrow>
334            <%
335          }
336          %>
337          <tbl:columnsubtitles />
338        </tbl:headers>
339        <tbl:rows>
340          <%
341          if (cc.getMessage() != null)
342          {
343            %>
344            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
345              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
346            </tbl:panel>
347            <%
348            cc.setMessage(null);
349          }
350          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
351          int selectedItemId = cc.getId();
352          if (platforms != null)
353          {           
354            while (platforms.hasNext())
355            {
356              Platform item = platforms.next();
357              RawDataType rdt = item.getRawDataType();
358              int itemId = item.getId();
359              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
360              String tooltip = mode.isSelectionMode() ? 
361                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : ""); 
362             
363              index++;
364              numListed++;
365              %>
366              <tbl:row>
367                <tbl:header 
368                  clazz="index"
369                  ><%=index%></tbl:header>
370                <tbl:header 
371                  clazz="check" 
372                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
373                  ><input 
374                    type="checkbox" 
375                    name="<%=itemId%>" 
376                    value="<%=itemId%>" 
377                    title="<%=name%>" 
378                    <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%> 
379                  ></tbl:header>
380                <tbl:header 
381                  clazz="check" 
382                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
383                  ><input 
384                    type="radio" 
385                    name="item_id" 
386                    value="<%=itemId%>" 
387                    title="<%=name%>" 
388                    <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
389                  ></tbl:header>
390                <tbl:header 
391                  clazz="icons" 
392                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
393                  ><base:icon 
394                    image="deleted.png"
395                    id="<%="delete."+itemId %>"
396                    subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : "disabled" %>"
397                    data-item-id="<%=itemId%>"
398                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
399                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
400                  />&nbsp;</tbl:header>
401                <tbl:cell column="name"><div 
402                  class="link table-item"
403                  data-item-id="<%=itemId%>"
404                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
405                  tabindex="0"
406                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
407                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
408                <tbl:cell column="externalId"><%=item.getExternalId()%></tbl:cell>
409                <tbl:cell column="fileOnly"><%=item.isFileOnly() ? "yes" : "no"%></tbl:cell>
410                <tbl:cell column="channels"><%=rdt == null ? "N/A" : rdt.getChannels()%></tbl:cell>
411                <tbl:cell column="rawDataType">
412                  <%=item.isFileOnly() ? "N/A" : (rdt == null ? "<i>- any -</i>" : rdt.getName())%>
413                </tbl:cell>
414                <tbl:cell column="variants">
415                  <%
416                  variantQuery.setParameter("platform", itemId, Type.INT);
417                  try
418                  {
419                    String separator = "";
420                    for (PlatformVariant v : variantQuery.list(dc))
421                    {
422                      out.write(separator);
423                      if (mode.hasPropertyLink())
424                      {
425                        out.write(Base.getLinkedName(ID, v, false, mode.hasEditLink()));
426                      }
427                      else
428                      {
429                        out.write(HTML.encodeTags(v.getName()));
430                      }
431                      separator = ", ";
432                    }
433                  }
434                  catch (Throwable t)
435                  {
436                    %>
437                    <div class="error"><%=t.getMessage()%></div>
438                    <%
439                  }
440                  %>
441                  <base:icon
442                    id="<%="new-variant."+itemId %>"
443                    image="add.png" 
444                    subclass="auto-init"
445                    data-auto-init="new-variant"
446                    data-item-id="<%=itemId %>"
447                    tooltip="Create new variant" 
448                    visible="<%=mode.hasEditLink() && createVariantPermission %>"
449                  />
450                </tbl:cell>
451                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
452                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
453                  <tbl:cell column="xt-columns" />
454                </tbl:xt-cells>
455              </tbl:row>
456              <%
457              }
458            }
459          if (numListed == 0)
460          {
461            %>
462            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
463              <div class="messagecontainer note">
464              <%=platforms == null || platforms.getTotalCount() == 0 ? "No platforms were found" : "No platforms on this page. Please select another page!" %>
465              </div>
466            </tbl:panel>
467            <%
468          }
469          %>
470          </tbl:rows>
471      </tbl:data>
472    </tbl:table>
473    </div>
474   
475    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
476      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
477      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
478      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
479    </base:buttongroup>
480   
481  </base:body>
482  </base:page>
483  <%
484}
485finally
486{
487  if (platforms != null) platforms.close();
488  if (dc != null) dc.close();
489}
490%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.