source: branches/3.18-stable/www/my_base/projects/list_projects.jsp @ 7937

Last change on this file since 7937 was 7937, checked in by Nicklas Nordborg, 14 months ago

References #2246: Sticky table headers

Implemented for some more list pages.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 17.0 KB
Line 
1<%-- $Id: list_projects.jsp 7937 2021-04-30 10:57:18Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4  Copyright (C) 2007 Johan Enell
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.Item"
30  import="net.sf.basedb.core.Project"
31  import="net.sf.basedb.core.AnnotationType"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
33  import="net.sf.basedb.core.Include"
34  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
35  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
36  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
37  import="net.sf.basedb.core.Permission"
38  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
39  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
40  import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
42  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
43  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
44  import="net.sf.basedb.core.snapshot.AnnotationLoaderUtil"
45  import="net.sf.basedb.core.snapshot.AnnotationSetSnapshot"
46  import="net.sf.basedb.core.snapshot.SnapshotManager"
47  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
48  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
52  import="net.sf.basedb.util.Values"
53  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
59  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
60  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
61  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
62  import="net.sf.basedb.clients.web.util.ProjectSpecificInfoFilter"
63  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
64  import="java.util.Date"
65  import="java.util.ArrayList"
66  import="java.util.List"
67  import="java.util.Map"
68%>
69<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
70<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
71<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
72<%!
73  private static final Item itemType = Item.PROJECT;
74  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
75%>
76<%
77final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
78final String ID = sc.getId();
79final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
80final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
81
82final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
83final String callback = request.getParameter("callback");
84final String title = mode.generateTitle("project", "projects");
85final DbControl dc = sc.newDbControl();
86ItemResultIterator<Project> projects = null;
87List<AnnotationLoaderUtil> annotationLoaders = new ArrayList<AnnotationLoaderUtil>();
88try
89{
90  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
91
92  ItemQuery<AnnotationType> annotationTypeQuery = Base.getAnnotationTypesQuery(itemType);
93  SnapshotManager manager = new SnapshotManager();
94  ProjectSpecificInfoFilter psInfo = new ProjectSpecificInfoFilter();
95  for (AnnotationType at : annotationTypeQuery.list(dc))
96  {
97    annotationLoaders.add(new AnnotationLoaderUtil(dc, manager, at));
98  }
99 
100  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
101  try
102  {
103    final ItemQuery<Project> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, jspContext, true, Project.getQuery(), mode);
104    projects = query.iterate(dc);
105  }
106  catch (Throwable t)
107  {
108    cc.setMessage(t.getMessage());
109  }
110 
111  int numListed = 0;
112  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
113  ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
114  ExtensionsInvoker<ListColumnAction<Project,?>> columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
115  %>
116  <base:page title="<%=title==null ? "Projects" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
117  <base:head scripts="table.js,~projects.js" styles="table.css,toolbar.css">
118    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
119    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
120  </base:head>
121 
122  <base:body>
123    <h1><%=title==null ? "Projects" : title%></h1>
124    <div class="content">
125    <tbl:table 
126      id="projects" 
127      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
128      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
129      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
130      action="index.jsp"
131      sc="<%=sc%>"
132      item="<%=itemType%>"
133      filterrows="<%=cc.getFilterRows()%>"
134      subclass="fulltable"
135      stickyheaders="name"
136      >
137      <tbl:hidden 
138        name="mode" 
139        value="<%=mode.getName()%>" 
140      />
141      <tbl:hidden 
142        name="callback" 
143        value="<%=callback%>" 
144        skip="<%=callback == null%>" 
145      />
146      <tbl:columndef 
147        id="name"
148        property="name"
149        datatype="string"
150        title="Name"
151        sortable="true" 
152        filterable="true"
153        exportable="true"
154        show="always" 
155      />
156      <tbl:columndef 
157        id="id"
158        clazz="uniquecol"
159        property="id"
160        datatype="int"
161        title="ID"
162        sortable="true"
163        filterable="true"
164        exportable="true"
165      />
166      <tbl:columndef 
167        id="owner"
168        property="owner.name"
169        datatype="string"
170        title="Owner"
171        sortable="true" 
172        filterable="true"
173        exportable="true"
174      />
175      <tbl:columndef 
176        id="permissionTemplate"
177        property="permissionTemplate.name"
178        datatype="string"
179        title="Default permissions"
180        sortable="true" 
181        filterable="true"
182        exportable="true"
183      />
184      <tbl:columndef 
185        id="entryDate"
186        property="entryDate"
187        datatype="date"
188        title="Registered"
189        sortable="true" 
190        filterable="true"
191        exportable="true"
192        formatter="<%=dateFormatter%>"
193      />
194      <tbl:columndef 
195        id="description"
196        property="description"
197        datatype="string"
198        title="Description" 
199        sortable="true" 
200        filterable="true" 
201        exportable="true"
202      />
203      <%
204      for (AnnotationLoaderUtil loader : annotationLoaders)
205      {
206        AnnotationType at = loader.getAnnotationType();
207        Enumeration<String, String> annotationEnum = null;
208        Formatter<Object> formatter = FormatterFactory.getTypeFormatter(sc, at.getValueType());
209        if (at.isEnumeration())
210        {
211          annotationEnum = new Enumeration<String, String>();
212          if (!at.getDisplayAsList()) annotationEnum.add("", "-none-");
213          List<?> values = at.getValues();
214          for (Object value : values)
215          {
216            String encoded = formatter.format(value);
217            annotationEnum.add(encoded, encoded);
218          }
219        }
220        %>
221        <tbl:columndef 
222          id="<%=(loader.isSearchingInheritedAnnotations() ? "ia" : "at")+at.getId()%>"
223          title="<%=HTML.encodeTags(at.getName())+(loader.isSearchingInheritedAnnotations() ? " [I]" : " [A]")%>" 
224          property="<%=(loader.isSearchingInheritedAnnotations() ? "##" : "#")+at.getId()%>"
225          annotation="true"
226          datatype="<%=at.getValueType().getStringValue()%>"
227          enumeration="<%=annotationEnum%>"
228          smartenum="<%=at.getDisplayAsList() %>"
229          sortable="<%=at.getMultiplicity() == 1 && !loader.isSearchingInheritedAnnotations()%>" 
230          filterable="true" 
231          exportable="true"
232          formatter="<%=formatter%>"
233          unit="<%=at.getDefaultUnit()%>"
234        />
235        <%
236      }
237      %>
238      <tbl:columndef
239        id="actions"
240        title="Actions"
241        show="always"
242      />
243      <tbl:columndef
244        id="permission"
245        title="Permission"
246      />
247      <tbl:columndef 
248        id="xt-columns" 
249        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
250        jspcontext="<%=jspContext%>" 
251      />
252      <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
253        <tbl:toolbar
254          subclass="bottomborder"
255          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
256          >
257          <tbl:button 
258            id="btnNewItem"
259            disabled="<%=!createPermission%>" 
260            image="new.png" 
261            title="New&hellip;" 
262            tooltip="<%=createPermission ? "Create new project" : "You do not have permission to create projects"%>" 
263          />
264          <tbl:button 
265            id="btnDeleteItems"
266            image="delete.png"
267            title="Delete" 
268            tooltip="Delete the selected items" 
269          />
270          <tbl:button 
271            id="btnRestoreItems"
272            image="restore.png"
273            title="Restore" 
274            tooltip="Restore the selected (deleted) items"
275          />
276          <tbl:button 
277            id="btnSetOwner"
278            image="take_ownership.png"
279            title="Set owner&hellip;"
280            tooltip="Change owner of the selected items"
281          />
282          <tbl:button 
283            id="btnColumns"
284            image="columns.png" 
285            title="Columns&hellip;" 
286            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
287          />
288          <tbl:button 
289            id="btnImport"
290            data-plugin-type="IMPORT"
291            image="import.png" 
292            title="Import&hellip;" 
293            tooltip="Import data" 
294            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
295          />
296          <tbl:button 
297            id="btnExport"
298            data-plugin-type="EXPORT"
299            image="export.png" 
300            title="Export&hellip;" 
301            tooltip="Export data" 
302            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
303          />
304          <tbl:button 
305            id="btnRunPlugin"
306            data-plugin-type="OTHER"
307            image="runplugin.png" 
308            title="Run plugin&hellip;" 
309            tooltip="Run a plugin" 
310            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
311          />
312          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
313            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
314        </tbl:toolbar>
315        <tbl:panel>
316          <tbl:presetselector />
317          <tbl:navigator
318            page="<%=cc.getPage()%>" 
319            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
320            totalrows="<%=projects == null ? 0 : projects.getTotalCount()%>" 
321            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
322          />
323        </tbl:panel>
324      </div>
325      <tbl:data>
326        <tbl:headers>
327          <tbl:headerrow>
328            <tbl:header clazz="row-index bg-filled-100" />
329            <tbl:columnheaders />
330          </tbl:headerrow>
331          <%
332          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
333          int numRows = cc.getFilterRows();
334          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
335          {
336            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
337            %>
338            <tbl:headerrow>
339              <tbl:header subclass="row-index bg-filled-100">
340                <div class="index-<%=mode.getName()%>">
341                  <div class="index"></div>
342                  <div class="check">
343                    <base:icon 
344                      subclass="link table-check"
345                      image="check_uncheck.png" 
346                      tooltip="Toggle all (use CTRL, ALT or SHIFT to check/uncheck)" 
347                      visible="<%=lastRow && mode.hasCheck()%>"
348                    />
349                  </div>
350                  <div class="icons">
351                    <base:icon
352                      subclass="link table-filter-row-action"
353                      image="add.png"
354                      tooltip="Add extra filter row"
355                      visible="<%=lastRow%>"
356                    /><base:icon
357                      subclass="link table-filter-row-action"
358                      image="remove.png"
359                      tooltip="Remove this filter row"
360                      visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
361                      data-remove-row="<%=filterNo%>"
362                    />
363                  </div>
364                </div>
365              </tbl:header>
366              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
367            </tbl:headerrow>
368            <%
369          }
370          %>
371          <tbl:columnsubtitles />
372        </tbl:headers>
373        <tbl:rows>
374          <%
375          if (cc.getMessage() != null)
376          {
377            %>
378            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
379              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
380            </tbl:panel>
381            <%
382            cc.setMessage(null);
383          }
384          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
385          int selectedItemId = Values.getInt(request.getParameter("item_id"));
386          if (projects != null)
387          {
388            while (projects.hasNext())
389            {
390              Project item = projects.next();
391              int itemId = item.getId();
392              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
393              boolean writePermission = item.hasPermission(Permission.WRITE);
394             
395              boolean deletePermission = item.hasPermission(Permission.DELETE);
396              String tooltip = mode.isSelectionMode() ?
397                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
398              index++;
399              numListed++;
400              %>
401              <tbl:row>
402                <tbl:header clazz="row-index bg-filled-100">
403                  <div class="index-<%=mode.getName()%>">
404                    <div class="index <%=index>999?"index-smaller":""%>"><%=index%></div>
405                    <div class="check">
406                      <base:input
407                        type="checkbox" 
408                        name="<%=itemId%>" 
409                        value="<%=itemId%>" 
410                        title="<%=name%>" 
411                        checked="<%=cc.getSelected().contains(itemId)%>"
412                        visible="<%=mode.hasCheck()%>"
413                      />
414                      <base:input 
415                        type="radio" 
416                        name="item_id" 
417                        value="<%=itemId%>" 
418                        title="<%=name%>" 
419                        checked="<%=selectedItemId == itemId%>"
420                        visible="<%=mode.hasRadio()%>"
421                      />
422                    </div>
423                    <div class="icons">
424                      <base:icon 
425                        image="deleted.png"
426                        id="<%="delete."+itemId %>"
427                        subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : "disabled" %>"
428                        data-item-id="<%=itemId%>"
429                        tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
430                        visible="<%=item.isRemoved()%>"
431                      />
432                    </div>
433                  </div>
434                </tbl:header>
435                <tbl:cell column="name"><div
436                  class="link table-item"
437                  data-item-id="<%=itemId%>"
438                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
439                  tabindex="0"
440                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
441                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
442                <tbl:cell column="owner"
443                  ><base:propertyvalue 
444                    item="<%=item%>" 
445                    property="owner"
446                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
447                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
448                  /></tbl:cell>
449                <tbl:cell column="permissionTemplate"
450                  ><base:propertyvalue 
451                    item="<%=item%>" 
452                    property="permissionTemplate"
453                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
454                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
455                    nulltext="<%=PermissionUtil.getFullPermissionNames(item.getAutoPermission(), "Annotate")%>"
456                  /></tbl:cell>
457                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
458                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
459                <%
460                if (item.isAnnotated())
461                {
462                  AnnotationSetSnapshot snapshot = manager.getSnapshot(dc, item.getAnnotationSet().getId());
463                  for (AnnotationLoaderUtil loader : annotationLoaders)
464                  {
465                    %>
466                    <tbl:cell 
467                      column="<%=(loader.isSearchingInheritedAnnotations() ? "ia" : "at")+loader.getId()%>"
468                      ><%
469                      if (loader.find(snapshot, psInfo.reset())) 
470                      {
471                        %><tbl:cellvalue 
472                          list="<%=loader.getValues()%>"
473                          suffix="<%=loader.getUnitSymbol()%>"
474                          clazz="<%=psInfo.overridesDefaultAnnotation() ? "ps-annotation" : null%>"
475                        /><%
476                      }
477                      %></tbl:cell>
478                    <%
479                  }
480                }
481                %>
482                <tbl:cell column="actions"><span class="link auto-init" data-auto-init="set-active" data-item-id="<%=itemId%>">Set active</span></tbl:cell>
483                <tbl:cell column="permission"><%=PermissionUtil.getShortPermissions(item)%></tbl:cell>
484                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
485                  <tbl:cell column="xt-columns" />
486                </tbl:xt-cells>
487              </tbl:row>
488              <%
489              }
490            }
491          if (numListed == 0)
492          {
493            %>
494            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
495              <div class="messagecontainer note">
496              <%=projects == null || projects.getTotalCount() == 0 ? "No projects were found" : "No projects on this page. Please select another page!" %>
497              </div>
498            </tbl:panel>
499            <%
500          }
501          %>
502        </tbl:rows>
503      </tbl:data>
504    </tbl:table>
505    </div>
506   
507    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
508      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
509      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
510      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
511    </base:buttongroup>
512   
513  </base:body>
514  </base:page>
515  <%
516}
517finally
518{
519  if (projects != null) projects.close();
520  if (dc != null) dc.close();
521}
522%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.