source: branches/3.18-stable/www/views/reporters/list_reporters.jsp @ 7932

Last change on this file since 7932 was 7932, checked in by Nicklas Nordborg, 3 months ago

References #2246: Sticky table headers

Implemented for all item list pages and a few other places:

  • Extensions installation dialog
  • Administrate / Services list page
  • Batch inherit annotations
  • Manage list presets
  • List of changed item in view job dialog


  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 16.1 KB
Line 
1<%-- $Id: list_reporters.jsp 7932 2021-04-28 07:16:56Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
4  Copyright (C) 2006 Johan Enell, Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
5  Copyright (C) 2007 Johan Enell, Nicklas Nordborg
6
7  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
8  Available at http://base.thep.lu.se/
9
10  BASE is free software; you can redistribute it and/or
11  modify it under the terms of the GNU General Public License
12  as published by the Free Software Foundation; either version 3
13  of the License, or (at your option) any later version.
14
15  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
16  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
17  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
18  GNU General Public License for more details.
19
20  You should have received a copy of the GNU General Public License
21  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
22  ------------------------------------------------------------------
23
24  @author Nicklas
25  @version 2.0
26--%>
27<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
28  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
29  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
30  import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
31  import="net.sf.basedb.core.Item"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
33  import="net.sf.basedb.core.Reporter"
34  import="net.sf.basedb.core.ReporterType"
35  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
36  import="net.sf.basedb.core.data.ReporterData"
37  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
38  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
39  import="net.sf.basedb.core.DataQuery"
40  import="net.sf.basedb.core.DataResultIterator"
41  import="net.sf.basedb.core.ExtendedProperty"
42  import="net.sf.basedb.core.ExtendedProperties"
43  import="net.sf.basedb.core.Permission"
44  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
45  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
46  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
47  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
48  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
52  import="net.sf.basedb.util.Values"
53  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
59  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
60  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
61  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
62  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
63  import="java.util.Date"
64  import="java.util.Map"
65  import="java.util.List"
66%>
67<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
68<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
69<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
70<%!
71  private static final Item itemType = Item.REPORTER;
72  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
73%>
74<%
75final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
76final String ID = sc.getId();
77final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
78final boolean writePermission = sc.hasPermission(Permission.WRITE, itemType);
79final boolean deletePermission = sc.hasPermission(Permission.DELETE, itemType);
80
81final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
82
83final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
84final String callback = request.getParameter("callback");
85final String title = mode.generateTitle("reporter", "reporters");
86final DbControl dc = sc.newDbControl();
87DataResultIterator<ReporterData> reporters = null;
88ItemResultList<ReporterType> reporterTypes = null;
89try
90{
91  final DataQuery<ReporterData> query = Reporter.getQuery();
92  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
93  cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
94
95  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
96  final ItemQuery<ReporterType> typeQuery = ReporterType.getQuery();
97  typeQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
98  typeQuery.setCacheResult(true);
99  List<ExtendedProperty> reporterProperties = ExtendedProperties.getProperties("ReporterData");
100  try
101  {
102    reporters = query.iterate(dc);
103  }
104  catch (Throwable t)
105  {
106    cc.setMessage(t.getMessage());
107    t.printStackTrace();
108  }
109  int numListed = 0;
110  Formatter<Date> timeFormatter = FormatterFactory.getDateTimeFormatter(sc);
111  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
112  ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
113  ExtensionsInvoker<ListColumnAction<ReporterData,?>> columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
114  %>
115  <base:page title="<%=title==null ? "Reporters" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
116  <base:head scripts="table.js,~reporters.js" styles="table.css,toolbar.css">
117    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
118    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
119  </base:head>
120 
121  <base:body>
122  <h1><%=title==null ? "Reporters" : title%></h1>
123  <div class="content">
124    <tbl:table 
125      id="reporters" 
126      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
127      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
128      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
129      action="index.jsp"
130      sc="<%=sc%>"
131      item="<%=itemType%>"
132      filterrows="<%=cc.getFilterRows() %>"
133      subclass="fulltable sticky-headers"
134      >
135      <tbl:hidden 
136        name="mode" 
137        value="<%=mode.getName()%>" 
138      />
139      <tbl:hidden 
140        name="callback" 
141        value="<%=callback%>" 
142        skip="<%=callback == null%>" 
143      />
144      <tbl:columndef 
145        id="externalId"
146        clazz="uniquecol"
147        property="externalId"
148        datatype="string"
149        title="External ID"
150        sortable="true" 
151        filterable="true"
152        exportable="true"
153      />
154      <tbl:columndef 
155        id="name"
156        property="name"
157        datatype="string"
158        title="Name"
159        sortable="true" 
160        filterable="true"
161        exportable="true"
162        show="always" 
163      />
164      <tbl:columndef 
165        id="id"
166        clazz="uniquecol"
167        property="id"
168        datatype="int"
169        title="ID"
170        sortable="true"
171        filterable="true"
172        exportable="true"
173      />
174      <tbl:columndef 
175        id="symbol"
176        property="symbol"
177        datatype="string"
178        title="Gene symbol"
179        sortable="true" 
180        filterable="true"
181        exportable="true"
182      />
183      <tbl:columndef 
184        id="description"
185        property="description"
186        datatype="string"
187        title="Description" 
188        sortable="true" 
189        filterable="true" 
190        exportable="true"
191      />
192      <tbl:columndef
193        id="reporterList"
194        property="£reporterListScores"
195        datatype="int"
196        title="Reporter list"
197        filterable="true"
198        enumeration="<%=Base.getReporterListsEnum(dc)%>"
199        multiple="false"
200      />
201      <tbl:columndef 
202        id="entryDate"
203        property="entryDate"
204        datatype="date"
205        title="Registered"
206        sortable="true" 
207        filterable="true"
208        exportable="true"
209        formatter="<%=dateFormatter%>"
210      />
211      <tbl:columndef 
212        id="lastUpdate"
213        property="lastUpdate"
214        datatype="timestamp"
215        title="Last update" 
216        sortable="true" 
217        filterable="true" 
218        exportable="true"
219        formatter="<%=timeFormatter%>"
220      />
221      <tbl:columndef 
222        id="lastSource"
223        property="lastSource"
224        datatype="string"
225        title="Last source"
226        sortable="true"
227        filterable="true"
228        exportable="true"
229      />
230      <%
231      Enumeration<String, String> types = new Enumeration<String, String>();
232      reporterTypes = typeQuery.list(dc);
233      types.add("", "- none -");
234      for (ReporterType rt : reporterTypes)
235      {
236        types.add(Integer.toString(rt.getId()), HTML.encodeTags(rt.getName()));
237      }
238      %>
239      <tbl:columndef 
240        id="reporterType"
241        property="reporterType"
242        sortproperty="reporterType.name"
243        exportproperty="reporterType.name:string"
244        datatype="int"
245        enumeration="<%=types%>"
246        title="Type"
247        sortable="true" 
248        filterable="true"
249        exportable="true"
250      />
251      <%
252      if (reporterProperties != null)
253      {
254        for (ExtendedProperty ep : reporterProperties)
255        {
256          String name = ep.getName();
257          %>
258          <tbl:columndef
259            id="<%=name%>"
260            property="<%=name%>"
261            datatype="<%=ep.getType().getStringValue()%>"
262            title="<%=HTML.encodeTags(ep.getTitle())%>"
263            sortable="true"
264            filterable="true"
265            exportable="true"
266            formatter="<%=FormatterFactory.getExtendedPropertyFormatter(sc, ep)%>"
267          />
268          <%
269        }
270      }
271      %>
272      <tbl:columndef 
273        id="xt-columns" 
274        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
275        jspcontext="<%=jspContext%>" 
276      />
277    <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
278      <tbl:toolbar
279        visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
280        subclass="bottomborder"
281        >
282        <tbl:button 
283          id="btnNewItem"
284          disabled="<%=!createPermission%>" 
285          image="new.png" 
286          title="New&hellip;" 
287          tooltip="<%=createPermission ? "Create a new reporter" : "You do not have permission to create reporter"%>" 
288        />
289        <tbl:button 
290          id="btnDeleteItems"
291          data-confirm="1"
292          disabled="<%=!deletePermission%>" 
293          image="delete.png" 
294          title="Delete&hellip;" 
295          tooltip="<%=deletePermission ? "Delete the selected items" : "You do not have permission to delete reporters" %>" 
296        />
297        <tbl:button 
298          id="btnColumns"
299          image="columns.png" 
300          title="Columns&hellip;" 
301          tooltip="Show, hide and re-order columns" 
302        />
303        <tbl:button
304          id="btnNewReporterList"
305          image="add.png"
306          title="New reporter list&hellip;"
307          tooltip="Create a new reporter list from matching reporters"
308          visible="<%=sc.hasPermission(Permission.CREATE, Item.REPORTERLIST)%>"
309        />
310        <tbl:button 
311          id="btnImport"
312          data-plugin-type="IMPORT"
313          image="import.png" 
314          title="Import&hellip;" 
315          tooltip="Import data" 
316          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
317        />
318        <tbl:button 
319          id="btnExport"
320          data-plugin-type="EXPORT"
321          image="export.png" 
322          title="Export&hellip;" 
323          tooltip="Export data" 
324          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
325        />
326        <tbl:button 
327          id="btnRunPlugin"
328          data-plugin-type="OTHER"
329          image="runplugin.png" 
330          title="Run plugin&hellip;" 
331          tooltip="Run a plugin" 
332          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
333        />
334        <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
335          wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
336      </tbl:toolbar>
337      <tbl:panel>
338        <tbl:presetselector />
339        <tbl:navigator
340          page="<%=cc.getPage()%>" 
341          rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
342          totalrows="<%=reporters == null ? 0 : reporters.getTotalCount()%>" 
343          visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
344        />
345      </tbl:panel>
346    </div>
347      <tbl:data>
348        <tbl:headers>
349          <tbl:headerrow>
350            <tbl:header colspan="3" />
351            <tbl:columnheaders />
352          </tbl:headerrow>
353          <%
354          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
355          int numRows = cc.getFilterRows();
356          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
357          {
358            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
359            %>
360            <tbl:headerrow>
361              <tbl:header subclass="index" />
362              <tbl:header 
363                subclass="check" 
364                visible="<%=mode.hasCheck()%>"
365                ><base:icon 
366                  subclass="link table-check"
367                  image="check_uncheck.png" 
368                  tooltip="Toggle all (use CTRL, ALT or SHIFT to check/uncheck)" 
369                  visible="<%=lastRow%>"
370                /></tbl:header>
371              <tbl:header 
372                subclass="check" 
373                visible="<%=mode.hasRadio()%>"
374                />
375              <tbl:header 
376                subclass="icons" 
377                visible="<%=mode.hasIcons()%>"
378                >
379                <base:icon
380                  subclass="link table-filter-row-action"
381                  image="add.png"
382                  tooltip="Add extra filter row"
383                  visible="<%=lastRow%>"
384                /><base:icon
385                  subclass="link table-filter-row-action"
386                  image="remove.png"
387                  tooltip="Remove this filter row"
388                  visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
389                  data-remove-row="<%=filterNo%>"
390                />
391              </tbl:header>
392              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
393            </tbl:headerrow>
394            <%
395          }
396          %>
397          <tbl:columnsubtitles />
398        </tbl:headers>
399        <tbl:rows>
400          <%
401          if (cc.getMessage() != null)
402          {
403            %>
404            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
405              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
406            </tbl:panel>
407            <%
408            cc.setMessage(null);
409          }
410          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
411          int selectedItemId = cc.getId();
412          if (reporters != null)
413          {
414            while (reporters.hasNext())
415            {
416              ReporterData item = reporters.next();
417              int itemId = item.getId();
418              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
419              String tooltip = mode.isSelectionMode() ?
420                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
421              index++;
422              numListed++;
423              %>
424              <tbl:row>
425                <tbl:header 
426                  clazz="index"
427                  ><%=index%></tbl:header>
428                <tbl:header 
429                  clazz="check" 
430                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
431                  ><input 
432                    type="checkbox" 
433                    name="<%=itemId%>" 
434                    value="<%=itemId%>" 
435                    title="<%=name%>" 
436                    <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%> 
437                  ></tbl:header>
438                <tbl:header 
439                  clazz="check" 
440                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
441                  ><input 
442                    type="radio" 
443                    name="item_id" 
444                    value="<%=itemId%>" 
445                    title="<%=name%>" 
446                    <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
447                  ></tbl:header>
448                <tbl:header 
449                  clazz="icons" 
450                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
451                  >&nbsp;</tbl:header>
452                <tbl:cell column="name"><div
453                  class="link table-item"
454                  data-item-id="<%=itemId%>"
455                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
456                  tabindex="0"
457                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
458                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
459                <tbl:cell column="externalId"><%=HTML.encodeTags(item.getExternalId())%></tbl:cell>
460                <tbl:cell column="symbol"><%=HTML.encodeTags(item.getSymbol())%></tbl:cell>
461                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
462                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
463                <tbl:cell column="lastUpdate" value="<%=item.getLastUpdate()%>" />
464                <tbl:cell column="lastSource"><%=HTML.encodeTags(item.getLastSource())%></tbl:cell>
465                <tbl:cell column="reporterType"
466                  ><base:propertyvalue 
467                    dbcontrol="<%=dc%>" 
468                    item="<%=item%>" 
469                    property="reporterType"
470                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
471                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
472                  /></tbl:cell>
473                <%
474                if (reporterProperties != null)
475                {
476                  for (ExtendedProperty ep : reporterProperties)
477                  {
478                    name = ep.getName();
479                    %>
480                    <tbl:cell column="<%=name%>"><tbl:cellvalue value="<%=item.getExtended(name)%>" /></tbl:cell>
481                    <%
482                  }
483                }
484                %>
485                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
486                  <tbl:cell column="xt-columns" />
487                </tbl:xt-cells>
488              </tbl:row>
489              <%
490            }
491          }
492          if (numListed == 0)
493          {
494            %>
495            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
496              <div class="messagecontainer note">
497              <%=reporters == null || reporters.getTotalCount() == 0 ? "No reporters were found" : "No reporters on this page. Please select another page!" %>
498              </div>
499            </tbl:panel>
500            <%
501          }
502          %>
503        </tbl:rows>
504      </tbl:data>
505    </tbl:table>
506   
507    </div>
508    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
509      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
510      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
511      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
512    </base:buttongroup>
513  </base:body>
514  </base:page>
515  <%
516}
517finally
518{
519  if (reporters != null) reporters.close();
520  if (dc != null) dc.close();
521}
522%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.