source: branches/3.18-stable/www/views/reporters/list_reporters.jsp @ 7938

Last change on this file since 7938 was 7938, checked in by Nicklas Nordborg, 3 months ago

References #2246: Sticky table headers

Implemented for all items in the "View" menu.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 16.1 KB
Line 
1<%-- $Id: list_reporters.jsp 7938 2021-05-03 11:20:19Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg
4  Copyright (C) 2006 Johan Enell, Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
5  Copyright (C) 2007 Johan Enell, Nicklas Nordborg
6
7  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
8  Available at http://base.thep.lu.se/
9
10  BASE is free software; you can redistribute it and/or
11  modify it under the terms of the GNU General Public License
12  as published by the Free Software Foundation; either version 3
13  of the License, or (at your option) any later version.
14
15  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
16  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
17  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
18  GNU General Public License for more details.
19
20  You should have received a copy of the GNU General Public License
21  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
22  ------------------------------------------------------------------
23
24  @author Nicklas
25  @version 2.0
26--%>
27<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
28  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
29  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
30  import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
31  import="net.sf.basedb.core.Item"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
33  import="net.sf.basedb.core.Reporter"
34  import="net.sf.basedb.core.ReporterType"
35  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
36  import="net.sf.basedb.core.data.ReporterData"
37  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
38  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
39  import="net.sf.basedb.core.DataQuery"
40  import="net.sf.basedb.core.DataResultIterator"
41  import="net.sf.basedb.core.ExtendedProperty"
42  import="net.sf.basedb.core.ExtendedProperties"
43  import="net.sf.basedb.core.Permission"
44  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
45  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
46  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
47  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
48  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
52  import="net.sf.basedb.util.Values"
53  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ButtonAction" 
59  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
60  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnAction"
61  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
62  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
63  import="java.util.Date"
64  import="java.util.Map"
65  import="java.util.List"
66%>
67<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
68<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
69<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
70<%!
71  private static final Item itemType = Item.REPORTER;
72  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
73%>
74<%
75final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
76final String ID = sc.getId();
77final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
78final boolean writePermission = sc.hasPermission(Permission.WRITE, itemType);
79final boolean deletePermission = sc.hasPermission(Permission.DELETE, itemType);
80
81final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
82
83final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
84final String callback = request.getParameter("callback");
85final String title = mode.generateTitle("reporter", "reporters");
86final DbControl dc = sc.newDbControl();
87DataResultIterator<ReporterData> reporters = null;
88ItemResultList<ReporterType> reporterTypes = null;
89try
90{
91  final DataQuery<ReporterData> query = Reporter.getQuery();
92  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
93  cc.configureQuery(dc, query, jspContext, true);
94
95  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
96  final ItemQuery<ReporterType> typeQuery = ReporterType.getQuery();
97  typeQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
98  typeQuery.setCacheResult(true);
99  List<ExtendedProperty> reporterProperties = ExtendedProperties.getProperties("ReporterData");
100  try
101  {
102    reporters = query.iterate(dc);
103  }
104  catch (Throwable t)
105  {
106    cc.setMessage(t.getMessage());
107    t.printStackTrace();
108  }
109  int numListed = 0;
110  Formatter<Date> timeFormatter = FormatterFactory.getDateTimeFormatter(sc);
111  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
112  ExtensionsInvoker<ButtonAction> invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
113  ExtensionsInvoker<ListColumnAction<ReporterData,?>> columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
114  %>
115  <base:page title="<%=title==null ? "Reporters" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
116  <base:head scripts="table.js,~reporters.js" styles="table.css,toolbar.css">
117    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
118    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
119  </base:head>
120 
121  <base:body>
122  <h1><%=title==null ? "Reporters" : title%></h1>
123  <div class="content">
124    <tbl:table 
125      id="reporters" 
126      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
127      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
128      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
129      action="index.jsp"
130      sc="<%=sc%>"
131      item="<%=itemType%>"
132      filterrows="<%=cc.getFilterRows() %>"
133      subclass="fulltable"
134      stickyheaders="name"
135      >
136      <tbl:hidden 
137        name="mode" 
138        value="<%=mode.getName()%>" 
139      />
140      <tbl:hidden 
141        name="callback" 
142        value="<%=callback%>" 
143        skip="<%=callback == null%>" 
144      />
145      <tbl:columndef 
146        id="externalId"
147        clazz="uniquecol"
148        property="externalId"
149        datatype="string"
150        title="External ID"
151        sortable="true" 
152        filterable="true"
153        exportable="true"
154      />
155      <tbl:columndef 
156        id="name"
157        property="name"
158        datatype="string"
159        title="Name"
160        sortable="true" 
161        filterable="true"
162        exportable="true"
163        show="always" 
164      />
165      <tbl:columndef 
166        id="id"
167        clazz="uniquecol"
168        property="id"
169        datatype="int"
170        title="ID"
171        sortable="true"
172        filterable="true"
173        exportable="true"
174      />
175      <tbl:columndef 
176        id="symbol"
177        property="symbol"
178        datatype="string"
179        title="Gene symbol"
180        sortable="true" 
181        filterable="true"
182        exportable="true"
183      />
184      <tbl:columndef 
185        id="description"
186        property="description"
187        datatype="string"
188        title="Description" 
189        sortable="true" 
190        filterable="true" 
191        exportable="true"
192      />
193      <tbl:columndef
194        id="reporterList"
195        property="£reporterListScores"
196        datatype="int"
197        title="Reporter list"
198        filterable="true"
199        enumeration="<%=Base.getReporterListsEnum(dc)%>"
200        multiple="false"
201      />
202      <tbl:columndef 
203        id="entryDate"
204        property="entryDate"
205        datatype="date"
206        title="Registered"
207        sortable="true" 
208        filterable="true"
209        exportable="true"
210        formatter="<%=dateFormatter%>"
211      />
212      <tbl:columndef 
213        id="lastUpdate"
214        property="lastUpdate"
215        datatype="timestamp"
216        title="Last update" 
217        sortable="true" 
218        filterable="true" 
219        exportable="true"
220        formatter="<%=timeFormatter%>"
221      />
222      <tbl:columndef 
223        id="lastSource"
224        property="lastSource"
225        datatype="string"
226        title="Last source"
227        sortable="true"
228        filterable="true"
229        exportable="true"
230      />
231      <%
232      Enumeration<String, String> types = new Enumeration<String, String>();
233      reporterTypes = typeQuery.list(dc);
234      types.add("", "- none -");
235      for (ReporterType rt : reporterTypes)
236      {
237        types.add(Integer.toString(rt.getId()), HTML.encodeTags(rt.getName()));
238      }
239      %>
240      <tbl:columndef 
241        id="reporterType"
242        property="reporterType"
243        sortproperty="reporterType.name"
244        exportproperty="reporterType.name:string"
245        datatype="int"
246        enumeration="<%=types%>"
247        title="Type"
248        sortable="true" 
249        filterable="true"
250        exportable="true"
251      />
252      <%
253      if (reporterProperties != null)
254      {
255        for (ExtendedProperty ep : reporterProperties)
256        {
257          String name = ep.getName();
258          %>
259          <tbl:columndef
260            id="<%=name%>"
261            property="<%=name%>"
262            datatype="<%=ep.getType().getStringValue()%>"
263            title="<%=HTML.encodeTags(ep.getTitle())%>"
264            sortable="true"
265            filterable="true"
266            exportable="true"
267            formatter="<%=FormatterFactory.getExtendedPropertyFormatter(sc, ep)%>"
268          />
269          <%
270        }
271      }
272      %>
273      <tbl:columndef 
274        id="xt-columns" 
275        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
276        jspcontext="<%=jspContext%>" 
277      />
278    <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
279      <tbl:toolbar
280        visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
281        subclass="bottomborder"
282        >
283        <tbl:button 
284          id="btnNewItem"
285          disabled="<%=!createPermission%>" 
286          image="new.png" 
287          title="New&hellip;" 
288          tooltip="<%=createPermission ? "Create a new reporter" : "You do not have permission to create reporter"%>" 
289        />
290        <tbl:button 
291          id="btnDeleteItems"
292          data-confirm="1"
293          disabled="<%=!deletePermission%>" 
294          image="delete.png" 
295          title="Delete&hellip;" 
296          tooltip="<%=deletePermission ? "Delete the selected items" : "You do not have permission to delete reporters" %>" 
297        />
298        <tbl:button 
299          id="btnColumns"
300          image="columns.png" 
301          title="Columns&hellip;" 
302          tooltip="Show, hide and re-order columns" 
303        />
304        <tbl:button
305          id="btnNewReporterList"
306          image="add.png"
307          title="New reporter list&hellip;"
308          tooltip="Create a new reporter list from matching reporters"
309          visible="<%=sc.hasPermission(Permission.CREATE, Item.REPORTERLIST)%>"
310        />
311        <tbl:button 
312          id="btnImport"
313          data-plugin-type="IMPORT"
314          image="import.png" 
315          title="Import&hellip;" 
316          tooltip="Import data" 
317          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
318        />
319        <tbl:button 
320          id="btnExport"
321          data-plugin-type="EXPORT"
322          image="export.png" 
323          title="Export&hellip;" 
324          tooltip="Export data" 
325          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
326        />
327        <tbl:button 
328          id="btnRunPlugin"
329          data-plugin-type="OTHER"
330          image="runplugin.png" 
331          title="Run plugin&hellip;" 
332          tooltip="Run a plugin" 
333          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
334        />
335        <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
336          wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer<ButtonAction>(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
337      </tbl:toolbar>
338      <tbl:panel>
339        <tbl:presetselector />
340        <tbl:navigator
341          page="<%=cc.getPage()%>" 
342          rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
343          totalrows="<%=reporters == null ? 0 : reporters.getTotalCount()%>" 
344          visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
345        />
346      </tbl:panel>
347    </div>
348      <tbl:data>
349        <tbl:headers>
350          <tbl:headerrow>
351            <tbl:header clazz="row-index bg-filled-100" />
352            <tbl:columnheaders />
353          </tbl:headerrow>
354          <%
355          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
356          int numRows = cc.getFilterRows();
357          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
358          {
359            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
360            %>
361            <tbl:headerrow>
362              <tbl:header subclass="row-index bg-filled-100">
363                <div class="index-<%=mode.getName()%>">
364                  <div class="index"></div>
365                  <div class="check">
366                    <base:icon 
367                      subclass="link table-check"
368                      image="check_uncheck.png" 
369                      tooltip="Toggle all (use CTRL, ALT or SHIFT to check/uncheck)" 
370                      visible="<%=lastRow && mode.hasCheck()%>"
371                    />
372                  </div>
373                  <div class="icons">
374                    <base:icon
375                      subclass="link table-filter-row-action"
376                      image="add.png"
377                      tooltip="Add extra filter row"
378                      visible="<%=lastRow%>"
379                    /><base:icon
380                      subclass="link table-filter-row-action"
381                      image="remove.png"
382                      tooltip="Remove this filter row"
383                      visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
384                      data-remove-row="<%=filterNo%>"
385                    />
386                  </div>
387                </div>
388              </tbl:header>
389              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
390            </tbl:headerrow>
391            <%
392          }
393          %>
394          <tbl:columnsubtitles />
395        </tbl:headers>
396        <tbl:rows>
397          <%
398          if (cc.getMessage() != null)
399          {
400            %>
401            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
402              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
403            </tbl:panel>
404            <%
405            cc.setMessage(null);
406          }
407          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
408          int selectedItemId = cc.getId();
409          if (reporters != null)
410          {
411            while (reporters.hasNext())
412            {
413              ReporterData item = reporters.next();
414              int itemId = item.getId();
415              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
416              String tooltip = mode.isSelectionMode() ?
417                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
418              index++;
419              numListed++;
420              %>
421              <tbl:row>
422                <tbl:header clazz="row-index bg-filled-100">
423                  <div class="index-<%=mode.getName()%>">
424                    <div class="index <%=index>999?"index-smaller":""%>"><%=index%></div>
425                    <div class="check">
426                      <base:input
427                        type="checkbox" 
428                        name="<%=itemId%>" 
429                        value="<%=itemId%>" 
430                        title="<%=name%>" 
431                        checked="<%=cc.getSelected().contains(itemId)%>"
432                        visible="<%=mode.hasCheck()%>"
433                      />
434                      <base:input 
435                        type="radio" 
436                        name="item_id" 
437                        value="<%=itemId%>" 
438                        title="<%=name%>" 
439                        checked="<%=selectedItemId == itemId%>"
440                        visible="<%=mode.hasRadio()%>"
441                      />
442                    </div>
443                    <div class="icons"></div>
444                  </div>
445                </tbl:header>
446                <tbl:cell column="name"><div
447                  class="link table-item"
448                  data-item-id="<%=itemId%>"
449                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
450                  tabindex="0"
451                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
452                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
453                <tbl:cell column="externalId"><%=HTML.encodeTags(item.getExternalId())%></tbl:cell>
454                <tbl:cell column="symbol"><%=HTML.encodeTags(item.getSymbol())%></tbl:cell>
455                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
456                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
457                <tbl:cell column="lastUpdate" value="<%=item.getLastUpdate()%>" />
458                <tbl:cell column="lastSource"><%=HTML.encodeTags(item.getLastSource())%></tbl:cell>
459                <tbl:cell column="reporterType"
460                  ><base:propertyvalue 
461                    dbcontrol="<%=dc%>" 
462                    item="<%=item%>" 
463                    property="reporterType"
464                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
465                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
466                  /></tbl:cell>
467                <%
468                if (reporterProperties != null)
469                {
470                  for (ExtendedProperty ep : reporterProperties)
471                  {
472                    name = ep.getName();
473                    %>
474                    <tbl:cell column="<%=name%>"><tbl:cellvalue value="<%=item.getExtended(name)%>" /></tbl:cell>
475                    <%
476                  }
477                }
478                %>
479                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
480                  <tbl:cell column="xt-columns" />
481                </tbl:xt-cells>
482              </tbl:row>
483              <%
484            }
485          }
486          if (numListed == 0)
487          {
488            %>
489            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
490              <div class="messagecontainer note">
491              <%=reporters == null || reporters.getTotalCount() == 0 ? "No reporters were found" : "No reporters on this page. Please select another page!" %>
492              </div>
493            </tbl:panel>
494            <%
495          }
496          %>
497        </tbl:rows>
498      </tbl:data>
499    </tbl:table>
500   
501    </div>
502    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
503      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
504      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
505      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
506    </base:buttongroup>
507  </base:body>
508  </base:page>
509  <%
510}
511finally
512{
513  if (reporters != null) reporters.close();
514  if (dc != null) dc.close();
515}
516%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.