source: branches/3.4-stable/www/lims/arraydesigns/list_designs.jsp @ 6780

Last change on this file since 6780 was 6780, checked in by Nicklas Nordborg, 8 years ago

Fixes #1929: Add 'none' option in annotation filters

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 23.0 KB
Line 
1<%-- $Id: list_designs.jsp 6780 2015-03-18 06:53:09Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4  Copyright (C) 2007 Johan Enell, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.Item"
30  import="net.sf.basedb.core.ArrayDesign"
31  import="net.sf.basedb.core.ArrayBatch"
32  import="net.sf.basedb.core.Platform"
33  import="net.sf.basedb.core.PlatformVariant"
34  import="net.sf.basedb.core.File"
35  import="net.sf.basedb.core.AnnotationType"
36  import="net.sf.basedb.core.AnnotationSet"
37  import="net.sf.basedb.core.Annotation"
38  import="net.sf.basedb.core.Job"
39  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
40  import="net.sf.basedb.core.Include"
41  import="net.sf.basedb.core.Type"
42  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
43  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
44  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
45  import="net.sf.basedb.core.Nameable"
46  import="net.sf.basedb.core.Permission"
47  import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
48  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
49  import="net.sf.basedb.core.FeatureIdentificationMethod"
50  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
51  import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
52  import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
53  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
54  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
55  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
56  import="net.sf.basedb.core.snapshot.AnnotationLoaderUtil"
57  import="net.sf.basedb.core.snapshot.AnnotationTypeFilter"
58  import="net.sf.basedb.core.snapshot.AnnotationSnapshot"
59  import="net.sf.basedb.core.snapshot.AnnotationSetSnapshot"
60  import="net.sf.basedb.core.snapshot.SnapshotManager"
61  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
62  import="net.sf.basedb.util.ShareableUtil"
63  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
64  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
65  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
66  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
67  import="net.sf.basedb.util.Values"
68  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
69  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
70  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
71  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
72  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
73  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
74  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
75  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
76  import="java.util.Iterator"
77  import="java.util.List"
78  import="java.util.Map"
79  import="java.util.Date"
80  import="java.util.ArrayList"
81%>
82<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
83<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
84<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
85<%!
86  private static final Item itemType = Item.ARRAYDESIGN;
87  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
88  private static final Enumeration<String, String> fiMethods = new Enumeration<String, String>();
89  static
90  {
91    for (FeatureIdentificationMethod fim : FeatureIdentificationMethod.values())
92    {
93      fiMethods.add(Integer.toString(fim.getValue()), fim.toString());
94    }
95    fiMethods.lock();
96  }
97%>
98<%
99final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
100final String ID = sc.getId();
101final String root = request.getContextPath()+"/";
102final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
103final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
104
105final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
106final String callback = request.getParameter("callback");
107final String title = mode.generateTitle("array design", "array designs");
108final DbControl dc = sc.newDbControl();
109ItemResultIterator<ArrayDesign> designs = null;
110List<AnnotationLoaderUtil> annotationLoaders = new ArrayList<AnnotationLoaderUtil>();
111try
112{
113  final ItemQuery<AnnotationType> annotationTypeQuery = Base.getAnnotationTypesQuery(itemType);
114  SnapshotManager manager = new SnapshotManager();
115  for (AnnotationType at : annotationTypeQuery.list(dc))
116  {
117    annotationLoaders.add(new AnnotationLoaderUtil(dc, manager, at));
118  }
119
120  // Query for batches relatated to the current design
121  final ItemQuery<ArrayBatch> batchQuery = ArrayBatch.getQuery();
122  batchQuery.include(cc.getInclude());
123  batchQuery.restrict(Restrictions.eq(Hql.property("arrayDesign"), Expressions.parameter("arrayDesign")));
124  batchQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name"))); 
125  final boolean createBatchPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, Item.ARRAYBATCH);   
126
127  // Get all platforms
128  final ItemQuery<Platform> platformQuery = Platform.getQuery();
129  platformQuery.include(cc.getInclude());
130  platformQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
131  platformQuery.setCacheResult(true);
132  Enumeration<String, String> platforms = new Enumeration<String, String>();
133  for (Platform p : platformQuery.list(dc))
134  {
135    platforms.add(Integer.toString(p.getId()), p.getName());
136  }
137 
138  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
139  try
140  {
141    final ItemQuery<ArrayDesign> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, true, ArrayDesign.getQuery(), mode);
142    designs = query.iterate(dc);
143  }
144  catch (Throwable t)
145  {
146    cc.setMessage(t.getMessage());
147    t.printStackTrace();
148  }
149  int numListed = 0;
150  Formatter<Date> dateTimeFormatter = FormatterFactory.getDateTimeFormatter(sc);
151  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
152  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
153  ExtensionsInvoker invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
154  ExtensionsInvoker columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
155  %>
156  <base:page title="<%=title==null ? "Array designs" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
157  <base:head scripts="table.js,~designs.js" styles="table.css,toolbar.css">
158    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
159    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
160  </base:head>
161 
162  <base:body>
163    <h1><%=title==null ? "Array designs" : title%></h1>
164    <div class="content">
165    <tbl:table 
166      id="designs" 
167      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
168      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
169      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
170      action="index.jsp"
171      sc="<%=sc%>"
172      item="<%=itemType%>"
173      subclass="fulltable"
174      >
175      <tbl:hidden 
176        name="mode" 
177        value="<%=mode.getName()%>" 
178      />
179      <tbl:hidden 
180        name="callback" 
181        value="<%=callback%>" 
182        skip="<%=callback == null%>" 
183      />
184      <tbl:columndef 
185        id="name"
186        property="name"
187        datatype="string"
188        title="Name"
189        sortable="true" 
190        filterable="true"
191        exportable="true"
192        show="always" 
193      />
194      <tbl:columndef 
195        id="id"
196        clazz="uniquecol"
197        property="id"
198        datatype="int"
199        title="ID"
200        sortable="true"
201        filterable="true"
202        exportable="true"
203      />
204      <tbl:columndef 
205        id="entryDate"
206        property="entryDate"
207        datatype="date"
208        title="Registered"
209        sortable="true" 
210        filterable="true"
211        exportable="true"
212        formatter="<%=dateFormatter%>"
213      />
214      <tbl:columndef 
215        id="hasFeatures"
216        property="hasFeatures"
217        datatype="boolean"
218        title="Has features"
219        sortable="true" 
220        filterable="true"
221        exportable="true"
222      />
223      <tbl:columndef 
224        id="numDbFeatures"
225        property="numDbFeatures"
226        datatype="int"
227        title="Db features"
228        sortable="true" 
229        filterable="true"
230        exportable="true"
231      />
232      <tbl:columndef 
233        id="numFileFeatures"
234        property="numFileFeatures"
235        datatype="int"
236        title="File features"
237        sortable="true" 
238        filterable="true"
239        exportable="true"
240      />
241      <tbl:columndef 
242        id="platform"
243        property="platform"
244        sortproperty="platform.name"
245        exportproperty="platform.name:string"
246        datatype="int"
247        enumeration="<%=platforms%>"
248        title="Platform"
249        sortable="true" 
250        filterable="true"
251        exportable="true"
252      /> 
253      <tbl:columndef 
254        id="variant"
255        property="variant.name"
256        datatype="string"
257        title="Variant"
258        sortable="true" 
259        filterable="true"
260        exportable="true"
261      /> 
262      <tbl:columndef 
263        id="featureIdentificationMethod"
264        property="featureIdentificationMethod"
265        datatype="int"
266        title="Feature ID meth."
267        tooltip="Feature identification method"
268        sortable="true" 
269        filterable="true"
270        exportable="true"
271        enumeration="<%=fiMethods%>"
272      /> 
273      <tbl:columndef 
274        id="numArrays"
275        property="numArrays"
276        datatype="int"
277        title="Arrays/slide"
278        sortable="true" 
279        filterable="true"
280        exportable="true"
281      />
282      <tbl:columndef 
283        id="plugin"
284        property="job.pluginDefinition.name"
285        datatype="string"
286        title="Plugin"
287        sortable="true"
288        filterable="true"
289        exportable="true"
290        tooltip="The plug-in that was used to import features"
291      />
292      <tbl:columndef 
293        id="configuration"
294        property="job.pluginConfiguration.name"
295        datatype="string"
296        title="Configuration"
297        sortable="true"
298        filterable="true"
299        exportable="true" 
300        tooltip="The configuration/file format that was used to import features"
301      />
302      <tbl:columndef 
303        id="importdate"
304        property="job.ended"
305        datatype="date"
306        title="Import date"
307        sortable="true"
308        filterable="true"
309        exportable="true" 
310        tooltip="The date and time of the feature import"
311        formatter="<%=dateTimeFormatter%>"
312      />
313      <tbl:columndef
314        id="batches"
315        title="Batches"
316        property="&arrayBatches(name)"
317        datatype="string"
318        filterable="true"
319        exportable="true"
320      />
321      <tbl:columndef 
322        id="owner"
323        property="owner.name"
324        datatype="string"
325        title="Owner"
326        sortable="true" 
327        filterable="true"
328        exportable="true"
329      />
330      <tbl:columndef 
331        id="description"
332        property="description"
333        datatype="string"
334        title="Description" 
335        sortable="true" 
336        filterable="true" 
337        exportable="true"
338      />     
339      <%
340      for (AnnotationLoaderUtil loader : annotationLoaders)
341      {
342        AnnotationType at = loader.getAnnotationType();
343        Formatter formatter = FormatterFactory.getTypeFormatter(sc, at.getValueType());
344        Enumeration<String, String> annotationEnum = null;
345        if (at.isEnumeration())
346        {
347          annotationEnum = new Enumeration<String, String>();
348          if (!at.getDisplayAsList()) annotationEnum.add("", "-none-");
349          List<?> values = at.getValues();
350          for (Object value : values)
351          {
352            String encoded = formatter.format(value);
353            annotationEnum.add(encoded, encoded);
354          }
355        }
356        %>
357        <tbl:columndef 
358          id="<%="at"+at.getId()%>"
359          title="<%=HTML.encodeTags(at.getName())+" [A]"%>" 
360          property="<%="#"+at.getId()%>"
361          annotation="true"
362          datatype="<%=at.getValueType().getStringValue()%>"
363          enumeration="<%=annotationEnum%>"
364          smartenum="<%=at.getDisplayAsList() %>"
365          sortable="<%=at.getMultiplicity() == 1%>" 
366          filterable="true" 
367          exportable="true"
368          formatter="<%=formatter%>"
369          unit="<%=at.getDefaultUnit()%>"
370        />
371        <%
372      }
373      %>
374      <tbl:columndef
375        id="permission"
376        title="Permission"
377      />
378      <tbl:columndef
379        id="sharedTo"
380        title="Shared to"
381        filterable="true"
382        filterproperty="!sharedTo.name"
383        datatype="string"
384      />
385      <tbl:columndef 
386        id="xt-columns" 
387        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
388        jspcontext="<%=jspContext%>" 
389      />
390      <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
391        <tbl:toolbar
392          subclass="bottomborder"
393          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
394          >
395          <tbl:button 
396            id="btnNewItem"
397            disabled="<%=!createPermission%>" 
398            image="new.png" 
399            title="New&hellip;" 
400            tooltip="<%=createPermission ? "Create new array design" : "You do not have permission to create array designs"%>" 
401          />
402          <tbl:button 
403            id="btnDeleteItems"
404            image="delete.png"
405            title="Delete" 
406            tooltip="Delete the selected items" 
407          />
408          <tbl:button 
409            id="btnRestoreItems"
410            image="restore.png"
411            title="Restore" 
412            tooltip="Restore the selected (deleted) items"
413          />
414          <tbl:button 
415            id="btnShareItems"
416            image="share.png"
417            title="Share&hellip;" 
418            tooltip="Share the selected items"
419          />
420          <tbl:button 
421            id="btnSetOwner"
422            image="take_ownership.png"
423            title="Set owner&hellip;"
424            tooltip="Change owner of the selected items"
425          />
426          <tbl:button 
427            id="btnColumns"
428            image="columns.png" 
429            title="Columns&hellip;" 
430            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
431          />
432          <tbl:button 
433            id="btnImport"
434            data-plugin-type="IMPORT"
435            image="import.png" 
436            title="Import&hellip;" 
437            tooltip="Import data" 
438            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
439          />
440          <tbl:button 
441            id="btnExport"
442            data-plugin-type="EXPORT"
443            image="export.png" 
444            title="Export&hellip;" 
445            tooltip="Export data" 
446            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
447          />
448          <tbl:button 
449            id="btnRunPlugin"
450            data-plugin-type="OTHER"
451            image="runplugin.png" 
452            title="Run plugin&hellip;" 
453            tooltip="Run a plugin" 
454            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
455          />
456          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
457            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
458        </tbl:toolbar>
459        <tbl:panel>
460          <tbl:presetselector />
461          <tbl:navigator
462            page="<%=cc.getPage()%>" 
463            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
464            totalrows="<%=designs == null ? 0 : designs.getTotalCount()%>" 
465            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
466          />
467        </tbl:panel>
468      </div>
469      <tbl:data>
470        <tbl:headers>
471          <tbl:headerrow>
472            <tbl:header colspan="3" />
473            <tbl:columnheaders />
474          </tbl:headerrow>
475          <tbl:headerrow>
476            <tbl:header subclass="index" />
477            <tbl:header 
478              subclass="check" 
479              visible="<%=mode.hasCheck()%>"
480              ><base:icon 
481                id="check.uncheck"
482                image="check_uncheck.png" 
483                tooltip="Check/uncheck all" 
484                 
485              /></tbl:header>
486            <tbl:header 
487              subclass="check" 
488              visible="<%=mode.hasRadio()%>"
489              />
490            <tbl:header 
491              subclass="icons" 
492              visible="<%=mode.hasIcons()%>"
493              />
494            <tbl:propertyfilter />
495          </tbl:headerrow>
496        </tbl:headers>
497        <tbl:rows>
498          <%
499          if (cc.getMessage() != null)
500          {
501            %>
502            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
503              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
504            </tbl:panel>
505            <%
506            cc.setMessage(null);
507          }
508          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
509          int selectedItemId = cc.getId();
510          if (designs != null)
511          {           
512            while (designs.hasNext())
513            {
514              ArrayDesign item = designs.next();
515              Job job = null;
516              try
517              {
518                job = item.getJob();
519              }
520              catch (Throwable t)
521              {}
522              int itemId = item.getId();
523             
524             
525              boolean deletePermission = item.hasPermission(Permission.DELETE);
526              boolean sharePermission = item.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION);
527              boolean usePermission = item.hasPermission(Permission.USE);
528              boolean writePermission = item.hasPermission(Permission.WRITE);
529              String tooltip = mode.isSelectionMode() ? 
530                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
531              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
532              index++;
533              numListed++;
534              %>
535              <tbl:row>
536                <tbl:header 
537                  clazz="index"
538                  ><%=index%></tbl:header>
539                <tbl:header 
540                  clazz="check" 
541                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
542                  ><input 
543                    type="checkbox" 
544                    name="<%=itemId%>" 
545                    value="<%=itemId%>" 
546                    title="<%=name%>" 
547                    <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%> 
548                  ></tbl:header>
549                <tbl:header 
550                  clazz="check" 
551                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
552                  ><input 
553                    type="radio" 
554                    name="item_id" 
555                    value="<%=itemId%>" 
556                    title="<%=name%>" 
557                    <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
558                  ></tbl:header>
559                <tbl:header 
560                  clazz="icons" 
561                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
562                  ><base:icon 
563                    image="deleted.png"
564                    id="<%="delete."+itemId %>"
565                    subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : null %>"
566                    data-item-id="<%=itemId%>"
567                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
568                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
569                  /><base:icon 
570                    image="shared.png" 
571                    id="<%="share."+itemId %>"
572                    subclass="<%=sharePermission ? "table-share-item" : null %>"
573                    data-item-id="<%=itemId%>"
574                    tooltip="This item is shared to other users, groups and/or projects" 
575                    visible="<%=item.isShared()%>"
576                  />&nbsp;</tbl:header>
577                <tbl:cell column="name"><div
578                  class="link table-item"
579                  data-item-id="<%=itemId%>"
580                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
581                  tabindex="0"
582                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
583                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
584                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
585                <tbl:cell column="platform"
586                  ><base:propertyvalue 
587                    item="<%=item%>" 
588                    property="platform"
589                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
590                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
591                  /></tbl:cell>
592                <tbl:cell column="variant"
593                  ><base:propertyvalue 
594                    item="<%=item%>" 
595                    property="variant"
596                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
597                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
598                  /></tbl:cell>
599                <tbl:cell column="hasFeatures"><%=item.hasFeatures() ? "yes" : "no"%></tbl:cell>
600                <tbl:cell column="numDbFeatures"><%=item.getNumDbFeatures()%></tbl:cell>
601                <tbl:cell column="numFileFeatures"><%=item.getNumFileFeatures()%></tbl:cell>
602                <tbl:cell column="featureIdentificationMethod"><%=item.getFeatureIdentificationMethod()%></tbl:cell>
603                <tbl:cell column="numArrays"><%=item.getNumArrays()%></tbl:cell>
604                <tbl:cell column="plugin">
605                  <base:propertyvalue 
606                    item="<%=item%>"
607                    property="job.pluginDefinition" 
608                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
609                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
610                    />
611                </tbl:cell>
612                <tbl:cell column="configuration">
613                  <base:propertyvalue 
614                    item="<%=item%>"
615                    property="job.pluginConfiguration" 
616                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
617                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
618                  />
619                </tbl:cell>
620                <tbl:cell 
621                  column="importdate" 
622                  value="<%=job == null ? null : job.getEnded() %>" 
623                />
624                <tbl:cell column="batches">
625                  <%
626                  batchQuery.setParameter("arrayDesign", itemId, Type.INT);
627                  try
628                  {
629                    String separator = "";
630                    for (ArrayBatch ab : batchQuery.list(dc))
631                    {
632                      out.write(separator);
633                      if (mode.hasPropertyLink())
634                      {
635                        out.write(Base.getLinkedName(ID, ab, false, mode.hasEditLink()));
636                      }
637                      else
638                      {
639                        out.write(HTML.encodeTags(ab.getName()));
640                      }
641                      separator = ", ";
642                    }
643                  }
644                  catch (Throwable t)
645                  {
646                    %>
647                    <div class="error"><%=t.getMessage()%></div>
648                    <%
649                  }
650                  %>
651                  <base:icon
652                    subclass="link auto-init"
653                    data-auto-init="new-batch"
654                    data-item-id="<%=itemId %>"
655                    image="add.png" 
656                    tooltip="Create new batch" 
657                    visible="<%=mode.hasEditLink() && createBatchPermission && usePermission %>"
658                  />
659                </tbl:cell>
660                <tbl:cell column="owner"
661                  ><base:propertyvalue 
662                    item="<%=item%>" 
663                    property="owner"
664                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
665                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
666                  /></tbl:cell>
667                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>               
668                <%
669                if (item.isAnnotated())
670                {
671                  AnnotationSetSnapshot snapshot = manager.getSnapshot(dc, item.getAnnotationSet().getId());
672                  for (AnnotationLoaderUtil loader : annotationLoaders)
673                  {
674                    %>
675                    <tbl:cell 
676                      column="<%="at"+loader.getId()%>"
677                      ><%
678                      if (loader.find(snapshot)) 
679                      {
680                        %><tbl:cellvalue 
681                          list="<%=loader.getValues()%>"
682                          suffix="<%=loader.getUnitSymbol()%>"
683                        /><%
684                      }
685                      %></tbl:cell>
686                    <%
687                  }
688                }
689                %>
690                <tbl:cell column="permission"><%=PermissionUtil.getShortPermissions(item)%></tbl:cell>
691                <tbl:cell column="sharedTo">
692                  <%
693                  Iterator<Nameable> sharees = ShareableUtil.getSharedTo(dc, item).iterator();
694                  while(sharees.hasNext())
695                  {
696                    Nameable n = sharees.next();
697                    if (mode.hasPropertyLink())
698                    {
699                      out.write(Base.getLinkedName(ID, n, false, mode.hasEditLink()));
700                    }
701                    else
702                    {
703                      out.write(HTML.encodeTags(n.getName()));
704                    }
705                    out.write(sharees.hasNext() ? ", " : "");
706                  }
707                  %>
708                </tbl:cell>
709                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
710                  <tbl:cell column="xt-columns" />
711                </tbl:xt-cells>
712              </tbl:row>
713              <%
714              }
715            }
716          if (numListed == 0)
717          {
718            %>
719            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
720              <div class="messagecontainer note">
721              <%=designs == null || designs.getTotalCount() == 0 ? "No array designs were found" : "No array designs on this page. Please select another page!" %>
722              </div>
723            </tbl:panel>
724            <%
725          }
726          %>
727        </tbl:rows>
728      </tbl:data>
729    </tbl:table>
730    </div>
731   
732    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
733      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
734      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
735      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
736    </base:buttongroup>
737   
738  </base:body>
739  </base:page>
740  <%
741}
742finally
743{
744  if (designs != null) designs.close();
745  if (dc != null) dc.close();
746}
747%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.