source: trunk/www/biomaterials/samples/view_sample.jsp @ 4882

Last change on this file since 4882 was 4882, checked in by Nicklas Nordborg, 13 years ago

References #1271: Add extension points to all toolbars

Added code for displaying extensions to all biomaterial pages.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 22.0 KB
Line 
1<%-- $Id: view_sample.jsp 4882 2009-04-03 10:53:42Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Johan Enell, Jari Hakkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4  Copyright (C) 2007 Martin Svensson
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
30  import="net.sf.basedb.core.Extract"
31  import="net.sf.basedb.core.Item"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
33  import="net.sf.basedb.core.Permission"
34  import="net.sf.basedb.core.Sample"
35  import="net.sf.basedb.core.BioSource"
36  import="net.sf.basedb.core.BioMaterialEvent"
37  import="net.sf.basedb.core.BioWell"
38  import="net.sf.basedb.core.Protocol"
39  import="net.sf.basedb.core.User"
40  import="net.sf.basedb.core.Group"
41  import="net.sf.basedb.core.ItemProxy"
42  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
43  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
44  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
45  import="net.sf.basedb.core.Include"
46  import="net.sf.basedb.core.MultiPermissions"
47  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
48  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
49  import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
50  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
51  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
52  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
53  import="net.sf.basedb.core.Project"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
57  import="net.sf.basedb.util.Values"
58  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
59  import="net.sf.basedb.util.formatter.WellCoordinateFormatter"
60  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
61  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
62  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
63  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
64  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
65  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
66  import="java.util.ArrayList"
67  import="java.util.Collections"
68  import="java.util.Date"
69  import="java.util.Map"
70  import="java.util.Set"
71  import="java.util.List"
72%>
73<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
74<%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
75<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
76<%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
77<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
78<%!
79  private static final Item itemType = Item.SAMPLE;
80  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.ITEM);
81%>
82<%
83final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
84final String ID = sc.getId();
85final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
86final int itemId = cc.getId();
87final String tab = Values.getString(request.getParameter("tab"), "properties");
88final float scale = Base.getScale(sc);
89final DbControl dc = sc.newDbControl();
90try
91{
92  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
93  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
94
95  WellCoordinateFormatter rowFormatter = new WellCoordinateFormatter(true);
96  WellCoordinateFormatter columnFormatter = new WellCoordinateFormatter(false);
97 
98  String title = null;
99  Sample sample = Sample.getById(dc, itemId);
100  BioMaterialEvent creationEvent = sample.getCreationEvent();
101 
102  final boolean usePermission = sample.hasPermission(Permission.USE);
103  final boolean writePermission = sample.hasPermission(Permission.WRITE);
104  final boolean deletePermission = sample.hasPermission(Permission.DELETE);
105  final boolean sharePermission = sample.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION);
106  final boolean setOwnerPermission = sample.hasPermission(Permission.SET_OWNER);
107  final boolean isRemoved = sample.isRemoved();
108  final boolean isUsed = isRemoved && sample.isUsed();
109  final boolean deletePermanentlyPermission = deletePermission && !isUsed;
110  final boolean isOwner = sample.isOwner();
111  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, sample);
112  ExtensionsInvoker invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
113  %>
114  <base:page title="<%=title%>">
115  <base:head scripts="table.js,tabcontrol.js" styles="table.css,toolbar.css,headertabcontrol.css,path.css">
116    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
117    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
118    <script language="JavaScript">
119    function editItem()
120    {
121      Main.viewOrEditItem('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>, true);
122    }
123    function shareItem()
124    {
125      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=ShareItem&item_id=<%=itemId%>', 'ShareSample', 600, 400);
126    }
127    function newExtract()
128    {
129      Main.viewOrEditItem('<%=ID%>', 'EXTRACT', 0, true, '&sample_id=<%=itemId%>');
130    }
131    function deleteItem()
132    {
133      location.replace('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=DeleteItem&item_id=<%=itemId%>');
134    }
135    function restoreItem()
136    {
137      location.replace('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=RestoreItem&item_id=<%=itemId%>');
138    }
139    function deleteItemPermanently()
140    {
141      Main.deleteItemPermanently('<%=ID%>', true, '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>, '&callback=itemDeleted');
142    }
143    function itemDeleted()
144    {
145      Main.listItems('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>');
146    }
147    function showUsingItems()
148    {
149      Main.showUsingItems('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>);
150    }
151    function setOwner()
152    {
153      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=SetOwnerOfItem&item_id=<%=itemId%>', 'SetOwnerOfItem', 450, 150);
154    }
155    function runPlugin(cmd)
156    {
157      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd='+cmd+'&item_id=<%=itemId%>', 'RunPlugin'+cmd, 740, 540);
158    }
159    function viewEvents()
160    {
161      location.href = '../events/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=List&biomaterial_id=<%=itemId%>&biomaterial_type=<%=itemType.name()%>';
162    }
163    function switchTab(tabControlId, tabId)
164    {
165      if (TabControl.isActive(tabControlId, tabId)) return;
166      if (tabId == 'overview' && tabId != '<%=tab%>')
167      {
168        location.href = 'index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=ViewItem&item_id=<%=itemId%>&tab='+tabId;
169      }
170      else if (tabId == 'events')
171      {
172        viewEvents();
173      }
174      else
175      {
176        TabControl.setActiveTab(tabControlId, tabId);
177      }
178    }
179    </script>
180  </base:head>
181  <base:body>
182    <p>
183    <p:path>
184      <p:pathelement title="Samples" href="<%="index.jsp?ID="+ID%>" />
185      <p:pathelement title="<%=HTML.encodeTags(sample.getName())%>" />
186    </p:path>
187   
188    <t:tabcontrol id="main" active="<%=tab%>" switch="switchTab" remember="false">
189    <t:tab id="properties" title="Properties">
190
191    <tbl:toolbar
192      >
193      <tbl:button 
194        disabled="<%=writePermission ? false : true%>" 
195        image="<%=writePermission ? "edit.gif" : "edit_disabled.gif"%>" 
196        onclick="editItem()" 
197        title="Edit&hellip;" 
198        tooltip="<%=writePermission ? "Edit this sample" : "You do not have permission to edit this sample"%>" 
199      />
200      <tbl:button 
201        disabled="<%=deletePermission ? false : true%>" 
202        image="<%=deletePermission ? "delete.gif" : "delete_disabled.gif"%>" 
203        onclick="deleteItem()" 
204        title="Delete"
205        visible="<%=!sample.isRemoved()%>"
206        tooltip="<%=deletePermission ? "Delete this sample" : "You do not have permission to delete this sample"%>" 
207      />
208      <tbl:button 
209        disabled="<%=writePermission ? false : true%>" 
210        image="<%=writePermission ? "restore.gif" : "restore_disabled.gif"%>" 
211        onclick="restoreItem()" 
212        title="Restore"
213        visible="<%=sample.isRemoved()%>"
214        tooltip="<%=writePermission ? "Restore this sample" : "You do not have permission to restore this sample"%>" 
215      />
216      <tbl:button 
217        disabled="<%=sharePermission ? false : true%>"
218        image="<%=sharePermission ? "share.gif" : "share_disabled.gif"%>"
219        onclick="shareItem()" 
220        title="Share&hellip;" 
221        tooltip="<%=sharePermission ? "Share this sample to other user, groups and projects" : "You do not have permission to share this sample"%>"
222      />
223      <tbl:button 
224        disabled="<%=setOwnerPermission ? false : true%>"
225        image="<%=setOwnerPermission ? "take_ownership.png" : "take_ownership_disabled.png"%>"
226        onclick="setOwner()" 
227        title="Set owner&hellip;"
228        tooltip="<%=setOwnerPermission ? "Change owner of this item" : "You do not have permission to change ownership of this item"%>"
229      />
230      <tbl:button
231        image="add.png"
232        onclick="newExtract()"
233        title="New extract&hellip;"
234        tooltip="Create a new extract from this sample"
235        visible="<%=sc.hasPermission(Permission.CREATE, Item.EXTRACT) && usePermission%>"
236      />
237      <tbl:button 
238        image="import.gif" 
239        onclick="runPlugin('ImportItem')" 
240        title="Import&hellip;" 
241        tooltip="Import data" 
242        visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
243      />
244      <tbl:button 
245        image="export.gif" 
246        onclick="runPlugin('ExportItem')" 
247        title="Export&hellip;" 
248        tooltip="Export data" 
249        visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
250      />
251      <tbl:button 
252        image="runplugin.gif" 
253        onclick="runPlugin('RunPlugin')" 
254        title="Run plugin&hellip;" 
255        tooltip="Run a plugin" 
256        visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
257      /> 
258      <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
259        wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
260      <tbl:button
261        image="help.gif"
262        onclick="<%="Main.openHelp('" + ID +"', 'sample.view.properties')"%>"
263        title="Help&hellip;"
264        tooltip="Get help about this page"
265      />   
266      </tbl:toolbar>
267    <div class="boxedbottom">
268      <div class="itemstatus">Permissions on this item: <i><%=PermissionUtil.getFullPermissionNames(sample)%></i></div>
269      <%
270      if (sample.isRemoved() || sample.isShared())
271      {
272        %>
273        <div class="itemstatus">
274          <base:icon 
275            image="<%=deletePermanentlyPermission ? "deleted.gif" : "deleted_disabled.gif"%>"
276            onclick="<%=deletePermanentlyPermission ? "deleteItemPermanently()" : null%>"
277            tooltip="<%=deletePermanentlyPermission ? "Permanently delete this item" : null%>"
278            visible="<%=isRemoved%>"> This item has been flagged for deletion<br></base:icon>
279          <base:icon image="used.gif" 
280            onclick="showUsingItems()"
281            tooltip="Show the items that are using this one"
282            visible="<%=isUsed%>"> This item is used by other items and can't be permanently deleted<br></base:icon>
283          <base:icon image="shared.gif" 
284            visible="<%=sample.isShared()%>"> This item is shared to other users, groups and/or projects</base:icon>
285        </div>
286        <%
287      }
288      %>
289      <table class="form" cellspacing="0">
290      <tr>
291        <td class="prompt">Name</td>
292        <td><%=HTML.encodeTags(sample.getName())%></td>
293      </tr>
294      <tr>
295        <td class="prompt">External ID</td>
296        <td><%=HTML.encodeTags(sample.getExternalId())%></td>
297      </tr>
298      <tr>
299        <td class="prompt">Created</td>
300        <td><%=dateFormatter.format(creationEvent.getEventDate())%></td>
301      </tr>
302      <tr>
303        <td class="prompt">Registered</td>
304        <td><%=dateFormatter.format(creationEvent.getEntryDate())%></td>
305      </tr>
306      <%
307      if (!sample.isPooled())
308      {
309        %>
310        <tr>
311          <td class="prompt">Biosource</td>
312          <td><base:propertyvalue item="<%=sample%>" property="parent" /></td>
313        </tr>
314        <%
315      }
316      %>
317      <tr>
318        <td class="prompt">Protocol</td>
319        <td><base:propertyvalue item="<%=creationEvent%>" property="protocol" /></td>
320      </tr>
321      <tr>
322        <td class="prompt">Original quantity</td>
323        <td><%=Values.formatNumber(sample.getOriginalQuantity(), 2, " µg")%></td>
324      </tr>
325      <tr>
326        <td class="prompt">Remaining quantity</td>
327        <td><%=Values.formatNumber(sample.getRemainingQuantity(), 2, " µg")%></td>
328      </tr>
329      <tr>
330        <td class="prompt">Bioplate</td>
331        <td>
332          <base:propertyvalue item="<%=sample%>" property="bioWell.bioPlate" />
333          <%
334          try
335          {
336            if (sample.getBioWell() != null)
337            {
338              BioWell bw = sample.getBioWell();
339              %>
340              [<%=rowFormatter.format(bw.getRow())%>,<%=columnFormatter.format(bw.getColumn())%>]
341            <%
342            }
343          }
344          catch (PermissionDeniedException ex)
345          {}
346          %>
347        </td>
348      </tr>
349      <tr>
350        <td class="prompt">Owner</td>
351        <td><base:propertyvalue item="<%=sample%>" property="owner" /></td>
352      </tr>
353      <tr valign="baseline">
354        <td class="prompt">Description</td>
355        <td><%=HTML.niceFormat(sample.getDescription())%></td>
356      </tr>
357      </table>
358 
359      <%
360      if (sample.isPooled())
361      {
362        ItemQuery<Sample> samplesQuery = (ItemQuery<Sample>)creationEvent.getSources();
363        samplesQuery.include(Include.ALL);
364        samplesQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
365        ItemResultList<Sample> samples = samplesQuery.list(dc);
366        %>
367        <h4 class="docked">Pooled from samples</h4>
368        <tbl:table
369          id="pooled"
370          clazz="itemlist"
371          columns="all"
372          >
373        <tbl:columndef 
374          id="name"
375          title="Name"
376        />
377        <tbl:columndef 
378          id="quantity"
379          title="Used quantity (µg)"
380        />
381        <tbl:columndef 
382          id="description"
383          title="Description"
384        />
385        <tbl:data>
386          <tbl:columns>
387          </tbl:columns>
388          <tbl:rows>
389          <%
390          for (Sample item : samples)
391          {
392            %>
393            <tbl:row>
394              <tbl:cell column="name"><base:icon 
395                  image="deleted.gif" 
396                  tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
397                  visible="<%=item.isRemoved()%>"
398                /><%=Base.getLinkedName(ID, item, false, true)%></tbl:cell>
399              <tbl:cell column="quantity"><%=Values.formatNumber(creationEvent.getUsedQuantity(item), 2)%></tbl:cell>
400              <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
401            </tbl:row>
402            <%
403          }
404          %>
405          </tbl:rows>
406        </tbl:data>
407        </tbl:table>
408        <%
409      }
410     
411      // Samples this item is pooled in.
412      ItemQuery<BioMaterialEvent> poolingQuery = sample.getPoolingEvents();
413      ItemResultList<BioMaterialEvent> poolingEvents = poolingQuery.list(dc);
414      if (poolingEvents.size() == 0)
415      {
416        %>
417        <h4>Pooled in samples</h4>
418        No samples have been pooled from this sample
419        (or, you don't have permission to view them).
420        <%
421      }
422      else
423      {
424        %>
425        <h4 class="docked">Pooled in samples</h4>
426        <tbl:table 
427          id="poolChilds"
428          clazz="itemlist"
429          columns="all"
430          >
431          <tbl:columndef 
432            id="name"
433            title="Name"
434          />
435          <tbl:columndef 
436            id="quantity"
437            title="Original quantity (µg)"
438          />
439          <tbl:columndef 
440            id="parents"
441            title="Used samples[quantity]" 
442          />
443          <tbl:columndef 
444            id="description"
445            title="Description"
446          />
447          <tbl:data>
448            <tbl:columns></tbl:columns>
449            <tbl:rows>
450            <%
451            for (BioMaterialEvent poolingEvt : poolingEvents)
452            {
453              Sample child = (Sample)poolingEvt.getBioMaterial();
454              ItemQuery<Sample> samplesQuery = (ItemQuery<Sample>)poolingEvt.getSources();
455              samplesQuery.include(Include.ALL);
456              samplesQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
457              ItemResultList<Sample> parentSamples = samplesQuery.list(dc);
458              %>
459              <tbl:row>
460                <tbl:cell column="name">
461                  <base:icon 
462                    image="deleted.gif" 
463                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
464                    visible="<%=child.isRemoved()%>"
465                  />
466                  <%=Base.getLinkedName(ID, child, false, true)%>
467                </tbl:cell>
468                <tbl:cell column="quantity"><%=Values.formatNumber(child.getOriginalQuantity(), 2)%></tbl:cell>
469                <tbl:cell column="parents">
470                <%
471                String separator = "";
472                for (Sample parent : parentSamples)
473                {
474                  out.write(separator);
475                  if (parent.equals(sample))
476                      out.write(HTML.encodeTags(parent.getName()));
477                  else                   
478                    out.write(Base.getLinkedName(ID, parent, false, true));
479                  out.write("[" + Values.formatNumber(poolingEvt.getUsedQuantity(parent), 2) + "µg]");
480                  separator = ", ";
481                }
482                %>
483                </tbl:cell>
484                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(child.getDescription())%></tbl:cell>
485              </tbl:row>
486              <%
487            }
488            %>           
489            </tbl:rows>
490          </tbl:data>
491        </tbl:table>
492        <%
493      }
494       
495      // Extracts created from this sample
496      ItemQuery<Extract> extractQuery = sample.getExtracts();
497      extractQuery.include(Include.ALL);
498      extractQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
499      ItemResultList<Extract> extracts = extractQuery.list(dc);
500      if (extracts.size() == 0)
501      {
502        %>
503        <h4>Extracts</h4>
504        No extracts have been created from this sample
505        (or, you don't have permission to view them).
506        <%
507      }
508      else
509      {
510        %>
511        <h4 class="docked">Extracts</h4>
512        <tbl:table
513          id="extracts"
514          clazz="itemlist"
515          columns="all"
516          >
517          <tbl:columndef
518            id="name"
519            title="Name"
520          />
521          <tbl:columndef 
522            id="quantity"
523            title="Used quantity (µg)"
524          />
525          <tbl:columndef
526            id="description"
527            title="Description"
528          />
529          <tbl:data>
530            <tbl:columns></tbl:columns>
531            <tbl:rows>
532              <%
533              for (Extract e : extracts)
534              {
535                %>
536                <tbl:row>
537                  <tbl:cell column="name"><base:icon 
538                  image="deleted.gif" 
539                  tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
540                  visible="<%=e.isRemoved()%>"
541                /><%=Base.getLinkedName(ID, e, false, true)%></tbl:cell>
542                  <tbl:cell column="quantity"><%=Values.formatNumber(e.getCreationEvent().getUsedQuantity(sample), 2)%></tbl:cell>
543                  <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(e.getDescription())%></tbl:cell>
544                </tbl:row>
545                <%
546              }
547              %>
548            </tbl:rows>
549          </tbl:data>
550        </tbl:table>
551        <%
552      }     
553     
554      // Tables with users/groups/projects that this item is shared to
555      MultiPermissions mp = new MultiPermissions(Collections.singleton(sample));
556      ItemResultIterator<User> users = mp.getUsers().iterate(dc);
557      ItemResultIterator<Group> groups = mp.getGroups().iterate(dc);
558      ItemResultIterator<Project> projects = mp.getProjects().iterate(dc);
559     
560      if (users.hasNext() || groups.hasNext() || projects.hasNext())
561      {
562        %>
563        <h4 class="docked">Shared to</h4>
564        <tbl:table 
565          id="itemsSharedTo"
566          clazz="itemlist"
567          columns="all"
568        >
569          <tbl:columndef 
570            id="itemType"
571            title="Item type"
572          />
573          <tbl:columndef 
574            id="name"
575            title="Name"
576          />
577          <tbl:columndef 
578            id="permissions"
579            title="Permissions"
580          />
581          <tbl:data>
582            <tbl:columns>
583            </tbl:columns>
584            <tbl:rows>
585            <%
586            while(projects.hasNext())
587            {
588              Project project = projects.next();
589              Set<Permission> permissions = mp.getPermissions(project).values().iterator().next();
590              %>     
591              <tbl:row>
592                <tbl:cell column="itemType"><%=project.getType()%></tbl:cell>
593                <tbl:cell column="name"><base:icon 
594                  image="deleted.gif" 
595                  tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
596                  visible="<%=project.isRemoved()%>"
597                /><%=Base.getLinkedName(ID, project, false, true)%></tbl:cell>
598                <tbl:cell column="permissions">
599                  <%=PermissionUtil.translatePermissionsToString(permissions)%>
600                </tbl:cell>
601              </tbl:row>
602              <%
603            }
604            while(groups.hasNext())
605            {
606              Group group = groups.next();
607              Set<Permission> permissions = mp.getPermissions(group).values().iterator().next();
608              %>
609              <tbl:row>             
610                <tbl:cell column="itemType"><%=group.getType()%></tbl:cell>
611                <tbl:cell column="name"><base:icon 
612                  image="deleted.gif" 
613                  tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
614                  visible="<%=group.isRemoved()%>"
615                /><%=Base.getLinkedName(ID, group, false, true)%></tbl:cell>
616                <tbl:cell column="permissions">
617                  <%=PermissionUtil.translatePermissionsToString(permissions)%>
618                </tbl:cell>
619              </tbl:row>
620              <% 
621            }
622            while (users.hasNext())
623            {
624              User user = users.next();
625              Set<Permission> permissions = mp.getPermissions(user).values().iterator().next();
626              %>
627              <tbl:row>             
628                <tbl:cell column="itemType"><%=user.getType()%></tbl:cell>
629                <tbl:cell column="name"><base:icon 
630                  image="deleted.gif" 
631                  tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
632                  visible="<%=user.isRemoved()%>"
633                /><%=Base.getLinkedName(ID, user, false, true)%></tbl:cell>
634                <tbl:cell column="permissions">
635                  <%=PermissionUtil.translatePermissionsToString(permissions)%>
636                </tbl:cell>
637              </tbl:row>
638              <%
639            }
640            %>
641            </tbl:rows>
642          </tbl:data>
643        </tbl:table>
644        <%
645      }
646      else
647      {
648        %>
649        <h4>Shared to</h4>
650        This sample is not shared
651        (or, you don't have permission to view the ones it is shared to).
652        <%
653      }
654      %>     
655    </div>
656      </t:tab>
657     
658      <t:tab id="annotations" title="Annotations &amp; parameters" 
659        tooltip="View annotation values and protocol parameters">
660        <div class="boxed">
661        <jsp:include page="../../common/annotations/list_annotations.jsp">
662          <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
663          <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
664          <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
665        </jsp:include>
666        </div>
667      </t:tab>
668      <t:tab id="events" title="Events" />
669      <t:tab id="overview" title="Overview" 
670        tooltip="Display a tree overview of related items">
671        <%
672        if ("overview".equals(tab))
673        {
674          %>
675          <jsp:include page="../../common/overview/overview.jsp">
676            <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
677            <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
678            <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
679          </jsp:include>
680          <%
681        }
682        %>
683      </t:tab>     
684      </t:tabcontrol>
685
686  </base:body>
687  </base:page>
688  <%
689}
690finally
691{
692  if (dc != null) dc.close();
693}
694
695%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.