source: trunk/www/biomaterials/tags/list_tags.jsp @ 6260

Last change on this file since 6260 was 6260, checked in by Nicklas Nordborg, 9 years ago

References #1729 and #1730. Fixed for all biomaterial list pages.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 14.5 KB
Line 
1<%-- $Id: list_tags.jsp 6260 2013-03-27 08:22:17Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4  Copyright (C) 2007 Johan Enell, Martin Svensson
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.Item"
30  import="net.sf.basedb.core.Tag"
31  import="net.sf.basedb.core.ItemSubtype"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
33  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
34  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
35  import="net.sf.basedb.core.Nameable"
36  import="net.sf.basedb.core.Permission"
37  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
38  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
39  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
40  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
42  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
43  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
44  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
45  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
46  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
47  import="net.sf.basedb.util.ShareableUtil"
48  import="net.sf.basedb.util.Values"
49  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
56  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
57  import="java.util.Date"
58  import="java.util.Iterator"
59  import="java.util.List"
60  import="java.util.Map"
61%>
62<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
63<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
64<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
65<%!
66  private static final Item itemType = Item.TAG;
67  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
68%>
69<%
70final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
71final String ID = sc.getId();
72final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
73final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
74
75final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
76final String callback = request.getParameter("callback");
77final String title = mode.generateTitle("tag", "tags");
78final DbControl dc = sc.newDbControl();
79ItemResultIterator<Tag> tags = null;
80try
81{
82  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
83
84  final ItemQuery<ItemSubtype> typeQuery = ItemSubtype.getQuery(itemType);
85  typeQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
86  typeQuery.setCacheResult(true);
87
88  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
89  try
90  {
91    final ItemQuery<Tag> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, true, Tag.getQuery(), mode);
92    tags = query.iterate(dc);
93  }
94  catch (Throwable t)
95  {
96    cc.setMessage(t.getMessage());
97  }
98  int numListed = 0;
99  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
100  ExtensionsInvoker invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
101  ExtensionsInvoker columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
102  %>
103  <base:page title="<%=title==null ? "Tags" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
104  <base:head scripts="table.js,~tags.js" styles="table.css,toolbar.css">
105    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
106    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
107  </base:head>
108 
109  <base:body>
110    <h1><%=title==null ? "Tags" : title%></h1>
111    <div class="content">
112    <tbl:table 
113      id="taglist" 
114      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
115      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
116      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
117      action="index.jsp"
118      sc="<%=sc%>"
119      item="<%=itemType%>"
120      subclass="fulltable"
121      >
122      <tbl:hidden 
123        name="mode" 
124        value="<%=mode.getName()%>" 
125      />
126      <tbl:hidden 
127        name="callback" 
128        value="<%=callback%>" 
129        skip="<%=callback == null%>" 
130      />
131      <tbl:columndef 
132        id="name"
133        property="name"
134        datatype="string"
135        title="Name"
136        sortable="true" 
137        filterable="true"
138        exportable="true"
139        show="always" 
140      />
141      <tbl:columndef 
142        id="id"
143        clazz="uniquecol"
144        property="id"
145        datatype="int"
146        title="ID"
147        sortable="true"
148        filterable="true"
149        exportable="true"
150      />
151      <tbl:columndef 
152        id="owner"
153        property="owner.name"
154        datatype="string"
155        title="Owner"
156        sortable="true" 
157        filterable="true"
158        exportable="true"
159      />
160      <tbl:columndef 
161        id="entryDate"
162        property="entryDate"
163        datatype="date"
164        title="Registered"
165        sortable="true" 
166        filterable="true"
167        exportable="true"
168        formatter="<%=dateFormatter%>"
169      />
170      <%
171      Enumeration<String, String> tagTypes = new Enumeration<String, String>();
172      for (ItemSubtype subtype : typeQuery.list(dc))
173      {
174        tagTypes.add(Integer.toString(subtype.getId()), HTML.encodeTags(subtype.getName()));
175      }
176      %>   
177      <tbl:columndef 
178        id="itemSubtype"
179        property="itemSubtype"
180        sortproperty="itemSubtype.name"
181        exportproperty="itemSubtype.name:string"
182        datatype="int"
183        enumeration="<%=tagTypes%>"
184        title="Type"
185        sortable="true" 
186        filterable="true"
187        exportable="true"
188      />
189      <tbl:columndef 
190        id="description"
191        property="description"
192        datatype="string"
193        title="Description" 
194        sortable="true" 
195        filterable="true" 
196        exportable="true"
197      />
198      <tbl:columndef
199        id="permission"
200        title="Permission"
201      />
202      <tbl:columndef
203        id="sharedTo"
204        title="Shared to"
205        filterable="true"
206        filterproperty="!sharedTo.name"
207        datatype="string"
208      />
209      <tbl:columndef 
210        id="xt-columns" 
211        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
212        jspcontext="<%=jspContext%>" 
213      />
214      <div class="panelgroup bottomborder">
215        <tbl:toolbar
216          subclass="bottomborder"
217          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
218          >
219          <tbl:button 
220            id="btnNewItem"
221            disabled="<%=!createPermission%>" 
222            image="new.png" 
223            title="New&hellip;" 
224            tooltip="<%=createPermission ? "Create new tag" : "You do not have permission to create tags"%>" 
225          />
226          <tbl:button 
227            id="btnDeleteItems"
228            image="delete.png"
229            title="Delete" 
230            tooltip="Delete the selected items" 
231          />
232          <tbl:button 
233            id="btnRestoreItems"
234            image="restore.png"
235            title="Restore" 
236            tooltip="Restore the selected (deleted) items"
237          />
238          <tbl:button 
239            id="btnShareItems"
240            image="share.png"
241            title="Share&hellip;" 
242            tooltip="Share the selected items"
243          />
244          <tbl:button 
245            id="btnSetOwner"
246            image="take_ownership.png"
247            title="Set owner&hellip;"
248            tooltip="Change owner of the selected items"
249          />
250          <tbl:button 
251            id="btnColumns"
252            image="columns.png" 
253            title="Columns&hellip;" 
254            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
255          />
256          <tbl:button 
257            id="btnImport"
258            data-plugin-type="IMPORT"
259            image="import.png" 
260            title="Import&hellip;" 
261            tooltip="Import data" 
262            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
263          />
264          <tbl:button 
265            id="btnExport"
266            data-plugin-type="EXPORT"
267            image="export.png" 
268            title="Export&hellip;" 
269            tooltip="Export data" 
270            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
271          />
272          <tbl:button 
273            id="btnRunPlugin"
274            data-plugin-type="OTHER"
275            image="runplugin.png" 
276            title="Run plugin&hellip;" 
277            tooltip="Run a plugin" 
278            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
279          />
280          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
281            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
282        </tbl:toolbar>
283        <tbl:panel>
284          <tbl:presetselector />
285          <tbl:navigator
286            page="<%=cc.getPage()%>" 
287            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
288            totalrows="<%=tags == null ? 0 : tags.getTotalCount()%>" 
289            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
290          />
291        </tbl:panel>
292      </div>
293      <tbl:data>
294        <tbl:headers>
295          <tbl:headerrow>
296            <tbl:header colspan="3" />
297            <tbl:columnheaders />
298          </tbl:headerrow>
299          <tbl:headerrow>
300            <tbl:header subclass="index" />
301            <tbl:header 
302              subclass="check" 
303              visible="<%=mode.hasCheck()%>"
304              ><base:icon 
305                id="check.uncheck"
306                image="check_uncheck.png" 
307                tooltip="Check/uncheck all" 
308                 
309              /></tbl:header>
310            <tbl:header 
311              subclass="check" 
312              visible="<%=mode.hasRadio()%>"
313              />
314            <tbl:header 
315              subclass="icons" 
316              visible="<%=mode.hasIcons()%>"
317              />
318            <tbl:propertyfilter />
319          </tbl:headerrow>
320        </tbl:headers>
321        <tbl:rows>
322          <%
323          if (cc.getMessage() != null)
324          {
325            %>
326            <tbl:panel clazz="messagepanel">
327              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
328            </tbl:panel>
329            <%
330            cc.setMessage(null);
331          }
332          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
333          int selectedItemId = cc.getId();
334          if (tags != null)
335          {           
336            while (tags.hasNext())
337            {
338              Tag item = tags.next();
339              int itemId = item.getId(); 
340             
341             
342              boolean deletePermission = item.hasPermission(Permission.DELETE);
343              boolean sharePermission = item.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION); 
344              boolean usePermission = item.hasPermission(Permission.USE);
345              boolean writePermission = item.hasPermission(Permission.WRITE);
346              String tooltip = mode.isSelectionMode() ? 
347                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
348              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
349              index++;
350              numListed++;
351              %>
352              <tbl:row>
353                <tbl:header 
354                  clazz="index"
355                  ><%=index%></tbl:header>
356                <tbl:header 
357                  clazz="check" 
358                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
359                  ><input 
360                    type="checkbox" 
361                    name="<%=itemId%>" 
362                    value="<%=itemId%>" 
363                    title="<%=name%>" 
364                    <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%> 
365                  ></tbl:header>
366                <tbl:header 
367                  clazz="check" 
368                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
369                  ><input 
370                    type="radio" 
371                    name="item_id" 
372                    value="<%=itemId%>" 
373                    title="<%=name%>" 
374                    <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
375                  ></tbl:header>
376                <tbl:header 
377                  clazz="icons" 
378                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
379                  ><base:icon 
380                    image="deleted.png"
381                    id="<%="delete."+itemId %>"
382                    subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : null %>"
383                    data-item-id="<%=itemId%>"
384                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
385                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
386                  /><base:icon 
387                    image="shared.png" 
388                    id="<%="share."+itemId %>"
389                    subclass="<%=sharePermission ? "table-share-item" : null %>"
390                    data-item-id="<%=itemId%>"
391                    tooltip="This item is shared to other users, groups and/or projects" 
392                    visible="<%=item.isShared()%>"
393                  />&nbsp;</tbl:header>
394                <tbl:cell column="name"><div
395                  class="link table-item"
396                  data-item-id="<%=itemId%>"
397                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
398                  tabindex="0"
399                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
400                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
401                <tbl:cell column="owner"
402                  ><base:propertyvalue 
403                    item="<%=item%>" 
404                    property="owner"
405                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
406                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
407                  /></tbl:cell>
408                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
409                <tbl:cell column="itemSubtype"
410                  ><base:propertyvalue 
411                    item="<%=item%>" 
412                    property="itemSubtype"
413                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
414                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
415                  /></tbl:cell>
416                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
417                <tbl:cell column="permission"><%=PermissionUtil.getShortPermissions(item)%></tbl:cell>
418                <tbl:cell column="sharedTo">
419                  <%
420                  Iterator<Nameable> sharees = ShareableUtil.getSharedTo(dc, item).iterator();
421                  while(sharees.hasNext())
422                  {
423                    Nameable n = sharees.next();
424                    if (mode.hasPropertyLink())
425                    {
426                      out.write(Base.getLinkedName(ID, n, false, mode.hasEditLink()));
427                    }
428                    else
429                    {
430                      out.write(HTML.encodeTags(n.getName()));
431                    }
432                    out.write(sharees.hasNext() ? ", " : "");
433                  }
434                  %>
435                </tbl:cell>
436                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
437                  <tbl:cell column="xt-columns" />
438                </tbl:xt-cells>
439              </tbl:row>
440              <%
441              }
442            }
443          if (numListed == 0)
444          {
445            %>
446            <tbl:panel clazz="messagepanel">
447              <div class="messagecontainer note">
448                <%=tags == null || tags.getTotalCount() == 0 ? "No tags were found" : "No tags on this page. Please select another page!" %>
449              </div>
450            </tbl:panel>
451            <%
452          }
453          %>
454        </tbl:rows>
455      </tbl:data>
456    </tbl:table>
457    </div>
458    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
459      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
460      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
461      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
462    </base:buttongroup>
463  </base:body>
464  </base:page>
465  <%
466}
467finally
468{
469  if (tags != null) tags.close();
470  if (dc != null) dc.close();
471}
472%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.