source: trunk/www/lims/geometries/view_geometry.jsp @ 5943

Last change on this file since 5943 was 5943, checked in by Nicklas Nordborg, 11 years ago

References #1655: GUI improvements

Plate section of Array LIMS.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 10.8 KB
Line 
1<%-- $Id: view_geometry.jsp 5943 2012-02-01 14:49:04Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4
5  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
6  Available at http://base.thep.lu.se/
7
8  BASE is free software; you can redistribute it and/or
9  modify it under the terms of the GNU General Public License
10  as published by the Free Software Foundation; either version 3
11  of the License, or (at your option) any later version.
12
13  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
14  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
15  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
16  GNU General Public License for more details.
17
18  You should have received a copy of the GNU General Public License
19  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
20  ------------------------------------------------------------------
21
22  @author Nicklas
23  @version 2.0
24--%>
25<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
26  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
27  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
28  import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
29  import="net.sf.basedb.core.Item"
30  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
31  import="net.sf.basedb.core.Permission"
32  import="net.sf.basedb.core.PlateGeometry"
33  import="net.sf.basedb.core.PlateType"
34  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
35  import="net.sf.basedb.core.Include"
36  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
37  import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
38  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
39  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
40  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
42  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
43  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
44  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
45  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
46  import="net.sf.basedb.util.Values"
47  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
48  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
53  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
54  import="java.util.Date"
55  import="java.util.Map"
56  import="java.util.Set"
57  import="java.util.List"
58%>
59<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
60<%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
61<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
62<%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
63<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
64<%!
65  private static final Item itemType = Item.PLATEGEOMETRY;
66  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.ITEM);
67%>
68<%
69final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
70final String ID = sc.getId();
71final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
72final int itemId = cc.getId();
73final float scale = Base.getScale(sc);
74final DbControl dc = sc.newDbControl();
75try
76{
77  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
78  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
79
80  String title = null;
81  PlateGeometry geometry = PlateGeometry.getById(dc, itemId);
82 
83  final boolean usePermission = geometry.hasPermission(Permission.USE);
84  final boolean writePermission = geometry.hasPermission(Permission.WRITE);
85  final boolean deletePermission = geometry.hasPermission(Permission.DELETE);
86  final boolean sharePermission = geometry.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION);
87  final boolean isRemoved = geometry.isRemoved();
88  final boolean isUsed = isRemoved && geometry.isUsed();
89  final boolean deletePermanentlyPermission = deletePermission && !isUsed;
90  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, geometry);
91  ExtensionsInvoker invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
92  %>
93  <base:page title="<%=title%>">
94  <base:head scripts="table.js,tabcontrol.js" styles="toolbar.css,table.css,headertabcontrol.css,path.css">
95    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
96    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
97    <script language="JavaScript">
98    function editItem()
99    {
100      Main.viewOrEditItem('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>, true);
101    }
102    function deleteItem()
103    {
104      location.replace('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=DeleteItem&item_id=<%=itemId%>');
105    }
106    function restoreItem()
107    {
108      location.replace('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=RestoreItem&item_id=<%=itemId%>');
109    }
110    function deleteItemPermanently()
111    {
112      Main.deleteItemPermanently('<%=ID%>', true, '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>, '&callback=itemDeleted');
113    }
114    function itemDeleted()
115    {
116      Main.listItems('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>');
117    }
118    function showUsingItems()
119    {
120      Main.showUsingItems('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>);
121    }
122    function runPlugin(cmd)
123    {
124      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd='+cmd+'&item_id=<%=itemId%>', 'RunPlugin'+cmd, 750, 500);
125    }
126    function newPlateType()
127    {
128      Main.viewOrEditItem('<%=ID%>', 'PLATETYPE', 0, true, '&plategeometry_id=<%=itemId%>');
129    }
130    </script>
131  </base:head>
132  <base:body>
133    <p:path><p:pathelement 
134      title="Plate geometries" href="<%="index.jsp?ID="+ID%>" 
135      /><p:pathelement title="<%=HTML.encodeTags(geometry.getName())%>" 
136      /></p:path>
137   
138    <t:tabcontrol 
139      id="main" 
140      subclass="content mastertabcontrol" 
141      active="properties">
142    <t:tab id="properties" title="Properties">
143      <div>
144      <table class="fullform bottomborder">
145      <tr>
146        <th class="itemstatus">
147          <base:icon 
148            image="deleted.gif"
149            onclick="deleteItemPermanently()"
150            tooltip="This item has been flagged for deletion. Click to delete it now."
151            enabled="<%=deletePermanentlyPermission %>"
152            visible="<%=isRemoved%>" 
153          />
154          <base:icon image="used.gif" 
155            onclick="showUsingItems()"
156            tooltip="This item is used by other items and can't be permanently deleted. Show the items that are using this one"
157            visible="<%=isRemoved && isUsed%>" />
158        </th>
159        <td style="padding: 0px;">
160          <tbl:toolbar subclass="bottomborder">
161            <tbl:button 
162              disabled="<%=!writePermission%>" 
163              image="edit.gif" 
164              onclick="editItem()" 
165              title="Edit&hellip;" 
166              tooltip="<%=writePermission ? "Edit this plate geometry" : "You do not have permission to edit this plate geometry"%>" 
167            />
168            <tbl:button 
169              disabled="<%=!deletePermission%>" 
170              image="delete.gif" 
171              onclick="deleteItem()" 
172              title="Delete"
173              visible="<%=!geometry.isRemoved()%>"
174              tooltip="<%=deletePermission ? "Delete this plate geometry" : "You do not have permission to delete this plate geometry"%>" 
175            />
176            <tbl:button 
177              disabled="<%=!writePermission%>" 
178              image="restore.gif" 
179              onclick="restoreItem()" 
180              title="Restore"
181              visible="<%=geometry.isRemoved()%>"
182              tooltip="<%=writePermission ? "Restore this plate geometry" : "You do not have permission to restore this plate geometry"%>" 
183            />
184            <tbl:button
185              image="add.png"
186              onclick="newPlateType()"
187              title="New plate type&hellip;"
188              tooltip="Create a new plate type with this geometry"
189              visible="<%=sc.hasPermission(Permission.CREATE, Item.PLATETYPE) && usePermission%>"
190            />
191            <tbl:button 
192              image="import.gif" 
193              onclick="runPlugin('ImportItem')" 
194              title="Import&hellip;" 
195              tooltip="Import data" 
196              visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
197            />
198            <tbl:button 
199              image="export.gif" 
200              onclick="runPlugin('ExportItem')" 
201              title="Export&hellip;" 
202              tooltip="Export data" 
203              visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
204            />
205            <tbl:button 
206              image="runplugin.gif" 
207              onclick="runPlugin('RunPlugin')" 
208              title="Run plugin&hellip;" 
209              tooltip="Run a plugin" 
210              visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
211            />
212            <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
213              wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
214            <tbl:button
215              image="help.png"
216              onclick="<%="Main.openHelp('" + ID +"', 'plategeometry.view.properties')"%>"
217              title="Help&hellip;"
218              tooltip="Get help about this page"
219            />
220          </tbl:toolbar>
221        </td>
222      </tr>
223      <tr>
224        <th>Name</th>
225        <td><%=HTML.encodeTags(geometry.getName())%></td>
226      </tr>
227      <tr>
228        <th>Registered</th>
229        <td><%=dateFormatter.format(geometry.getEntryDate())%></td>
230      </tr>
231      <tr>
232        <th>Rows</th>
233        <td><%=geometry.getRows()%></td>
234      </tr>
235      <tr>
236        <th>Columns</th>
237        <td><%=geometry.getColumns()%></td>
238      </tr>
239      <tr>
240        <th>Permissions</th>
241        <td><%=PermissionUtil.getFullPermissionNames(geometry)%></td>
242      </tr>
243      <tr>
244        <th>Description</th>
245        <td><%=HTML.niceFormat(geometry.getDescription())%></td>
246      </tr>
247      </table>
248      </div>
249
250      <%
251      ItemQuery<PlateType> plateTypeQuery = geometry.getPlateTypes();
252      plateTypeQuery.include(Include.ALL);
253      plateTypeQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
254      ItemResultList<PlateType> plateTypes = plateTypeQuery.list(dc);
255      %>
256      <base:section 
257        id="types" 
258        title="<%="Plate types (" + plateTypes.size() + ")"%>"
259        context="<%=cc%>"
260        >
261        <%
262        if (plateTypes.size() == 0)
263        {
264          %>
265          <div class="messagecontainer note">
266          No plate types have this geometry
267          (or, you don't have permission to view them).
268          </div>
269          <%
270        }
271        else
272        {
273          %>
274          <tbl:table
275            id="plateTypes"
276            columns="all"
277            >
278          <tbl:columndef 
279            id="name"
280            title="Name"
281          />
282          <tbl:columndef 
283            id="description"
284            title="Description"
285          />
286          <tbl:data>
287            <tbl:headers>
288              <tbl:headerrow>
289                <tbl:columnheaders />
290              </tbl:headerrow>
291            </tbl:headers>
292            <tbl:rows>
293            <%
294            for (PlateType item : plateTypes)
295            {
296              %>
297              <tbl:row>
298                <tbl:cell column="name"><base:icon 
299                    image="deleted.gif" 
300                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
301                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
302                  /><%=Base.getLinkedName(ID, item, false, true)%></tbl:cell>
303                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
304              </tbl:row>
305              <%
306            }
307            %>
308            </tbl:rows>
309          </tbl:data>
310          </tbl:table>
311          <%
312        }
313        %>
314      </base:section>
315      <jsp:include page="../../common/anytoany/list_anytoany.jsp">
316        <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
317        <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
318        <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
319        <jsp:param name="title" value="Other items related to this geometry" />
320      </jsp:include>
321    </t:tab>
322    </t:tabcontrol>
323  </base:body>
324  </base:page>
325  <%
326}
327finally
328{
329  if (dc != null) dc.close();
330}
331
332%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.