source: trunk/www/lims/platetypes/view_platetype.jsp @ 5943

Last change on this file since 5943 was 5943, checked in by Nicklas Nordborg, 11 years ago

References #1655: GUI improvements

Plate section of Array LIMS.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 12.8 KB
Line 
1<%-- $Id: view_platetype.jsp 5943 2012-02-01 14:49:04Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4  Copyright (C) 2007 Martin Svensson
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
30  import="net.sf.basedb.core.Group"
31  import="net.sf.basedb.core.Item"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
33  import="net.sf.basedb.core.Permission"
34  import="net.sf.basedb.core.PlateType"
35  import="net.sf.basedb.core.Plate"
36  import="net.sf.basedb.core.PlateGeometry"
37  import="net.sf.basedb.core.User"
38  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
39  import="net.sf.basedb.core.Include" 
40  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
41  import="net.sf.basedb.core.MultiPermissions"
42  import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
43  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
44  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
45  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
46  import="net.sf.basedb.core.Project"
47  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
48  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
52  import="net.sf.basedb.util.Values"
53  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
55  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
58  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
59  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
60  import="java.util.Collections"
61  import="java.util.Date"
62  import="java.util.Map"
63  import="java.util.Set"
64  import="java.util.List"
65%>
66<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
67<%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
68<%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
69<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
70<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
71<%!
72  private static final Item itemType = Item.PLATETYPE;
73  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.ITEM);
74%>
75<%
76final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
77final String ID = sc.getId();
78final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
79final int itemId = cc.getId();
80final float scale = Base.getScale(sc);
81final DbControl dc = sc.newDbControl();
82try
83{
84  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
85  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
86
87  String title = null;
88  PlateType plateType = PlateType.getById(dc, itemId);
89 
90  final boolean usePermission = plateType.hasPermission(Permission.USE);
91  final boolean writePermission = plateType.hasPermission(Permission.WRITE);
92  final boolean deletePermission = plateType.hasPermission(Permission.DELETE);
93  final boolean sharePermission = plateType.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION);
94  final boolean setOwnerPermission = plateType.hasPermission(Permission.SET_OWNER);
95  final boolean isRemoved = plateType.isRemoved();
96  final boolean isUsed = isRemoved && plateType.isUsed();
97  final boolean deletePermanentlyPermission = deletePermission && !isUsed;
98  final boolean isOwner = plateType.isOwner();
99  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, plateType);
100  ExtensionsInvoker invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
101  %>
102  <base:page title="<%=title%>">
103  <base:head scripts="table.js,tabcontrol.js" styles="toolbar.css,headertabcontrol.css,path.css,table.css">
104    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
105    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
106    <script language="JavaScript">
107    function editItem()
108    {
109      Main.viewOrEditItem('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>, true);
110    }
111    function shareItem()
112    {
113      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=ShareItem&item_id=<%=itemId%>', 'SharePlateType', 600, 400);
114    }
115    function deleteItem()
116    {
117      location.replace('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=DeleteItem&item_id=<%=itemId%>');
118    }
119    function restoreItem()
120    {
121      location.replace('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=RestoreItem&item_id=<%=itemId%>');
122    }
123    function deleteItemPermanently()
124    {
125      Main.deleteItemPermanently('<%=ID%>', true, '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>, '&callback=itemDeleted');
126    }
127    function itemDeleted()
128    {
129      Main.listItems('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>');
130    }
131    function showUsingItems()
132    {
133      Main.showUsingItems('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>);
134    }
135    function setOwner()
136    {
137      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=SetOwnerOfItem&item_id=<%=itemId%>', 'SetOwnerOfItem', 450, 300);
138    }
139    function runPlugin(cmd)
140    {
141      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd='+cmd+'&item_id=<%=itemId%>', 'RunPlugin'+cmd, 750, 500);
142    }
143    function viewEventTypes()
144    {
145      location.href = 'eventtypes/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=List&platetype_id=<%=itemId%>';
146    }
147    function switchTab(tabControlId, tabId)
148    {
149      if (tabId == 'events')
150      {
151        viewEventTypes();
152      }
153      else
154      {
155        TabControl.setActiveTab(tabControlId, tabId);
156      }
157    }
158    </script>
159  </base:head>
160  <base:body>
161    <p:path><p:pathelement 
162      title="Plate types" href="<%="index.jsp?ID="+ID%>" 
163      /><p:pathelement title="<%=HTML.encodeTags(plateType.getName())%>" 
164      /></p:path>
165   
166    <t:tabcontrol 
167      id="main" 
168      subclass="content mastertabcontrol" 
169      active="properties" switch="switchTab">
170    <t:tab id="properties" title="Properties">
171      <div>
172      <table class="fullform bottomborder">
173      <tr>
174        <th class="itemstatus">
175          <base:icon 
176            image="shared.gif" 
177            visible="<%=plateType.isShared()%>"
178            tooltip="This item is shared to other users, groups and/or projects"
179          />
180          <base:icon 
181            image="deleted.gif"
182            onclick="deleteItemPermanently()"
183            tooltip="This item has been flagged for deletion. Click to delete it now."
184            enabled="<%=deletePermanentlyPermission %>"
185            visible="<%=isRemoved%>" 
186          />
187          <base:icon image="used.gif" 
188            onclick="showUsingItems()"
189            tooltip="This item is used by other items and can't be permanently deleted. Show the items that are using this one"
190            visible="<%=isRemoved && isUsed%>" />
191        </th>
192        <td style="padding: 0px;">
193          <tbl:toolbar subclass="bottomborder">
194            <tbl:button 
195              disabled="<%=!writePermission%>" 
196              image="edit.gif" 
197              onclick="editItem()" 
198              title="Edit&hellip;" 
199              tooltip="<%=writePermission ? "Edit this plate type" : "You do not have permission to edit this plate type"%>" 
200            />
201            <tbl:button 
202              disabled="<%=!deletePermission%>" 
203              image="delete.gif" 
204              onclick="deleteItem()" 
205              title="Delete"
206              visible="<%=!plateType.isRemoved()%>"
207              tooltip="<%=deletePermission ? "Delete this plate type" : "You do not have permission to delete this plate type"%>" 
208            />
209            <tbl:button 
210              disabled="<%=!writePermission%>" 
211              image="restore.gif" 
212              onclick="restoreItem()" 
213              title="Restore"
214              visible="<%=plateType.isRemoved()%>"
215              tooltip="<%=writePermission ? "Restore this plate type" : "You do not have permission to restore this plate type"%>" 
216            />
217            <tbl:button 
218              disabled="<%=!sharePermission%>"
219              image="share.gif"
220              onclick="shareItem()" 
221              title="Share&hellip;" 
222              tooltip="<%=sharePermission ? "Share this plate type to other user, groups and projects" : "You do not have permission to share this plate type"%>"
223            />
224            <tbl:button 
225              disabled="<%=!setOwnerPermission%>"
226              image="take_ownership.png"
227              onclick="setOwner()" 
228              title="Set owner&hellip;"
229              tooltip="<%=setOwnerPermission ? "Change owner of this item" : "You do not have permission to change ownership of this item"%>"
230            />
231            <tbl:button 
232              image="import.gif" 
233              onclick="runPlugin('ImportItem')" 
234              title="Import&hellip;" 
235              tooltip="Import data" 
236              visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
237            />
238            <tbl:button 
239              image="export.gif" 
240              onclick="runPlugin('ExportItem')" 
241              title="Export&hellip;" 
242              tooltip="Export data" 
243              visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
244            />
245            <tbl:button 
246              image="runplugin.gif" 
247              onclick="runPlugin('RunPlugin')" 
248              title="Run plugin&hellip;" 
249              tooltip="Run a plugin" 
250              visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
251            />
252            <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
253              wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
254            <tbl:button
255              image="help.png"
256              onclick="<%="Main.openHelp('" + ID +"', 'platetype.view.properties')"%>"
257              title="Help&hellip;"
258              tooltip="Get help about this page"
259            />
260          </tbl:toolbar>
261        </td>
262      </tr>
263      <tr>
264        <th>Name</th>
265        <td><%=HTML.encodeTags(plateType.getName())%></td>
266      </tr>
267      <tr>
268        <th>Registered</th>
269        <td><%=dateFormatter.format(plateType.getEntryDate())%></td>
270      </tr>
271      <tr>
272        <th>Geometry</th>
273        <td><base:propertyvalue item="<%=plateType%>" property="plateGeometry" /></td>
274      </tr>
275      <tr>
276        <th>Owner</th>
277        <td><base:propertyvalue item="<%=plateType%>" property="owner" /></td>
278      </tr>
279      <tr>
280        <th>Permissions</th>
281        <td><%=PermissionUtil.getFullPermissionNames(plateType)%></td>
282      </tr>
283      <tr>
284        <th>Description</th>
285        <td><%=HTML.niceFormat(plateType.getDescription())%></td>
286      </tr>
287      </table>
288      </div>
289
290      <%
291      ItemQuery<Plate> plateQuery = plateType.getPlates();
292      plateQuery.include(Include.ALL);
293      plateQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
294      ItemResultList<Plate> plates = plateQuery.list(dc);
295      %>
296      <base:section
297        id="plates"
298        title="<%="Plates (" + plates.size() + ")"%>"
299        context="<%=cc%>"
300        >
301        <%
302        if (plates.size() == 0)
303        {
304          %>
305          <div class="messagecontainer note">
306          No plate of this type exists
307          (or, you don't have permission to view them).
308          </div>
309          <%
310        }
311        else
312        {
313          %>
314          <tbl:table
315            id="plateTypes"
316            columns="all"
317            >
318          <tbl:columndef 
319            id="name"
320            title="Name"
321          />
322          <tbl:columndef 
323            id="barcode"
324            title="Barcode"
325          />
326          <tbl:columndef 
327            id="destroyed"
328            title="Destroyed"
329          />
330          <tbl:columndef 
331            id="description"
332            title="Description"
333          />
334          <tbl:data>
335            <tbl:headers>
336              <tbl:headerrow>
337                <tbl:columnheaders />
338              </tbl:headerrow>
339            </tbl:headers>
340            <tbl:rows>
341            <%
342            for (Plate item : plates)
343            {
344              %>
345              <tbl:row>
346                <tbl:cell column="name"><base:icon 
347                    image="deleted.gif" 
348                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
349                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
350                  /><%=Base.getLinkedName(ID, item, false, true)%></tbl:cell>
351                <tbl:cell column="barcode"><%=HTML.encodeTags(item.getBarcode())%></tbl:cell>
352                <tbl:cell column="destroyed"><%=item.isDestroyed() ? "yes" : "no" %></tbl:cell>
353                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
354              </tbl:row>
355              <%
356            }
357            %>
358            </tbl:rows>
359          </tbl:data>
360          </tbl:table>
361          <%
362        }
363        %>
364      </base:section>
365      <jsp:include page="../../common/anytoany/list_anytoany.jsp">
366        <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
367        <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
368        <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
369        <jsp:param name="title" value="Other items related to this plate type" />
370      </jsp:include>
371      <jsp:include page="../../common/share/list_share.jsp">
372        <jsp:param name="ID" value="<%=ID%>" />
373        <jsp:param name="item_type" value="<%=itemType.name()%>" />
374        <jsp:param name="item_id" value="<%=itemId%>" />
375        <jsp:param name="title" value="Shared to" />
376      </jsp:include>
377    </t:tab>
378    <t:tab id="events" title="Event types" />
379    </t:tabcontrol>
380  </base:body>
381  </base:page>
382  <%
383}
384finally
385{
386  if (dc != null) dc.close();
387}
388
389%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.