source: trunk/www/views/hybridizations/edit_hybridization.jsp @ 4133

Last change on this file since 4133 was 4133, checked in by Nicklas Nordborg, 15 years ago

References #868: Support for chips with multiple arrays

Fixed some input problems on Labeled extracts tab
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 21.5 KB
Line 
1<%-- $Id: edit_hybridization.jsp 4133 2008-02-08 10:54:05Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2005 Nicklas Nordborg, Gregory Vincic
4  Copyright (C) 2006 Johan Enell, Jari Hakkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 2
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with this program; if not, write to the Free Software
21  Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330,
22  Boston, MA  02111-1307, USA.
23  ------------------------------------------------------------------
24
25
26  @author Nicklas
27  @version 2.0
28--%>
29<%@ page session="false"
30  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
31  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
32  import="net.sf.basedb.core.Item"
33  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
34  import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
35  import="net.sf.basedb.core.Permission"
36  import="net.sf.basedb.core.Include"
37  import="net.sf.basedb.core.Hardware"
38  import="net.sf.basedb.core.HardwareType"
39  import="net.sf.basedb.core.Hybridization"
40  import="net.sf.basedb.core.BioMaterialEvent"
41  import="net.sf.basedb.core.ArraySlide"
42  import="net.sf.basedb.core.Protocol"
43  import="net.sf.basedb.core.ProtocolType"
44  import="net.sf.basedb.core.Project"
45  import="net.sf.basedb.core.LabeledExtract"
46  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
47  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
48  import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
49  import="net.sf.basedb.core.BaseException"
50  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
51  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
54  import="net.sf.basedb.util.Values"
55  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
56  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
57  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterSettings"
58  import="java.util.List"
59  import="java.util.Set"
60  import="java.util.HashSet"
61  import="java.util.Date"
62%>
63<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
64<%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
65<%
66final Item itemType = Item.HYBRIDIZATION;
67final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
68final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
69final int itemId = cc.getId();
70final String ID = sc.getId();
71final float scale = Base.getScale(sc);
72final DbControl dc = sc.newDbControl();
73try
74{
75  String title = null;
76  String name = null;
77  Hybridization hyb = null;
78  BioMaterialEvent creationEvent = null;
79  Date eventDate = null;
80  ItemQuery<LabeledExtract> labeledExtractsQuery = null;
81 
82  boolean readCurrentArraySlide = true;
83  ArraySlide currentArraySlide = null;
84 
85  boolean readCurrentProtocol = true;
86  Protocol currentProtocol = null;
87  Protocol defaultProtocol = null;
88 
89  boolean readCurrentHybStation = true;
90  Hardware currentHybStation = null;
91  Hardware defaultHybStation = null;
92
93  // Load recently used items
94  List<Protocol> recentProtocols = (List<Protocol>)cc.getRecent(dc, Item.PROTOCOL);
95  List<Hardware> recentStations = (List<Hardware>)cc.getRecent(dc, Item.HARDWARE);
96 
97  int activeProjectId = sc.getActiveProjectId();
98  if (activeProjectId > 0)
99  {
100    Project activeProject = Project.getById(dc, activeProjectId);
101    try
102    {
103      defaultProtocol = (Protocol)activeProject.getDefaultItem(dc, Project.Default.HYBRIDIZATION_PROTOCOL);
104    }
105    catch (PermissionDeniedException pdex)
106    {
107      defaultProtocol = null;
108    }
109    try
110    {
111      defaultHybStation = (Hardware)activeProject.getDefaultItem(dc, Project.Default.HYBRIDIZATION_HARDWARE);
112    }
113    catch (PermissionDeniedException pdex)
114    {
115      defaultHybStation = null;
116    }
117  }
118  if (itemId == 0)
119  {
120    title = "Create hybridization";
121    cc.removeObject("item");
122    if (cc.getPropertyFilter("creationEvent.protocol.name") != null)
123    {
124      currentProtocol = Base.getFirstMatching(dc, Protocol.getQuery(), "name", cc.getPropertyFilter("creationEvent.protocol.name"));
125    }
126    if (cc.getPropertyFilter("creationEvent.hardware.name") != null)
127    {
128      currentHybStation = Base.getFirstMatching(dc, Hardware.getQuery(), "name", cc.getPropertyFilter("creationEvent.hardware.name"));
129    }
130    if (cc.getPropertyFilter("arraySlide.name") != null)
131    {
132      currentArraySlide = Base.getFirstMatching(dc, ArraySlide.getQuery(), "name", cc.getPropertyFilter("arraySlide.name"));
133    }
134    name = Values.getString(cc.getPropertyValue("name"), "New hybridization");
135    eventDate = (Date)cc.getPropertyObject("creationEvent.eventDate");
136   
137    if (Values.getBoolean(request.getParameter("useParents")))
138    {
139      labeledExtractsQuery = LabeledExtract.getQuery();
140      labeledExtractsQuery.include(Include.ALL);
141      labeledExtractsQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
142    }
143   
144  }
145  else
146  {
147    hyb = Hybridization.getById(dc, itemId);
148    creationEvent = hyb.getCreationEvent();
149    eventDate = creationEvent.getEventDate();
150    cc.setObject("item", hyb);
151    title = "Edit hybridization -- " + HTML.encodeTags(hyb.getName());
152    name = hyb.getName();
153    try
154    {
155      currentArraySlide = hyb.getArraySlide();
156    }
157    catch (PermissionDeniedException ex)
158    {
159      readCurrentArraySlide = false;
160    }
161    try
162    {
163      currentProtocol = creationEvent.getProtocol();
164    }
165    catch (PermissionDeniedException ex)
166    {
167      readCurrentProtocol = false;
168    }
169    try
170    {
171      currentHybStation = creationEvent.getHardware();
172    }
173    catch (PermissionDeniedException ex)
174    {
175      readCurrentHybStation = false;
176    }
177   
178    // Query to retrieve source labeled extracts
179    labeledExtractsQuery = (ItemQuery<LabeledExtract>)creationEvent.getSources();
180    labeledExtractsQuery.include(Include.ALL);
181    labeledExtractsQuery.order(Orders.asc(Hql.property("name")));
182   
183  }
184  if (hyb != null) hyb.checkPermission(Permission.WRITE);
185
186  final String clazz = "class=\"text\"";
187  final String requiredClazz = "class=\"text required\"";
188  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
189  String dateFormat = FormatterSettings.getDateFormat(sc);
190  String jsDateFormat = HTML.javaScriptEncode(dateFormat);
191  String htmlDateFormat = HTML.encodeTags(dateFormat);
192  %>
193
194  <base:page type="popup" title="<%=title%>">
195  <base:head scripts="tabcontrol.js,annotations.js,linkitems.js" styles="tabcontrol.css">
196    <script language="JavaScript">
197    // Validate the "Hybridization" tab
198    function validateHybridization()
199    {
200      var frm = document.forms['hybridization'];
201      if (Main.trimString(frm.name.value) == '')
202      {
203        alert("You must enter a name");
204        frm.name.focus();
205        return false;
206      }
207      else if (!Numbers.isInteger(frm.numArrays.value))
208      {
209        alert("'" + frm.numArrays.value + "' is not a valid number");
210        frm.numArrays.focus();
211        return false;
212      }
213      else if (parseInt(frm.numArrays.value) <= 0)
214      {
215        alert("Number of arrays must be > 0");
216        frm.numArrays.focus();
217        return false;
218      }
219      return true;
220    }
221
222    // Submit the form
223    function saveSettings()
224    {
225      var frm = document.forms['hybridization'];
226      if (TabControl.validateActiveTab('settings'))
227      {
228        if (annotationsLoaded)
229        {
230          Annotations.addModifiedAnnotationsToForm(frames.annotations, frm);
231        }
232        if (inheritedAnnotationsLoaded)
233        {
234          Annotations.addInheritedAnnotationsToForm(frames.inheritedAnnotations, frm);
235        }
236        frm.modifiedLabeledExtracts.value = Link.exportModified(frm, 'L', true).join(',');
237        frm.removedLabeledExtracts.value = Link.getActionIds(-1, 'L').join(',');
238        frm.submit();
239      }
240    }
241   
242    var annotationsLoaded = false;
243    var inheritedAnnotationsLoaded = false;
244    var parentsChanged = false;
245    var protocolChanged = false;
246    function switchTab(tabControlId, tabId)
247    {
248      if (TabControl.setActiveTab(tabControlId, tabId))
249      {
250        if (tabId == 'annotations' && (protocolChanged || !annotationsLoaded))
251        {
252          Annotations.loadAnnotateFrame(frames.annotations, '<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=hyb == null ? 0 : hyb.getId()%>, getProtocolId());
253          annotationsLoaded = true;
254          protocolChanged = false;
255        }
256        else if (tabId == 'inheritedAnnotations' && 
257          (parentsChanged || !inheritedAnnotationsLoaded))
258        {
259          Annotations.loadInheritFrame(frames.inheritedAnnotations, '<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>, getParents());
260          inheritedAnnotationsLoaded = true;
261          parentsChanged = false;
262        }
263      }
264    }
265   
266    function getProtocolId()
267    {
268      var frm = document.forms['hybridization'];
269      var protocolId = 0;
270      if (frm.protocol_id.length > 0 && !frm.protocol_id.disabled)
271      {
272        protocolId = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id[frm.protocol_id.selectedIndex].value));       
273      }
274      return protocolId;
275    }
276
277    function getParents()
278    {
279      var frm = document.forms['hybridization'];
280      var parents = new Array();
281
282      var arraySlideId = Math.abs(parseInt(frm.arrayslide_id[frm.arrayslide_id.selectedIndex].value));
283      if (arraySlideId > 0) parents[parents.length] = 'ARRAYSLIDE:'+arraySlideId;
284
285      var ids = Link.getListIds(frm.labeled_extracts, 'L');
286      if (ids.length > 0)
287      {
288        parents[parents.length] = 'LABELEDEXTRACT:'+ids.join(':');
289      }
290      return parents;
291    }
292
293    function selectProtocolOnClick()
294    {
295      var frm = document.forms['hybridization'];
296      var url = '../../admin/protocols/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=UpdateContext&mode=selectone&callback=setProtocolCallback';
297      if (frm.protocol_id.length > 1)
298      {
299        var id = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id[1].value));       
300        url += '&item_id='+id;
301      }
302      url += '&filter:INT:protocolType=<%=SystemItems.getId(ProtocolType.HYBRIDIZATION)%>';
303      Main.openPopup(url, 'SelectProtocol', 1000, 700);
304    }
305    function setProtocolCallback(id, name)
306    {
307      var frm = document.forms['hybridization'];
308      var list = frm.protocol_id;
309      if (list.length < 2 || list[1].value == '0') // >
310      {
311        Forms.addListOption(list, 1, new Option());
312      }
313      list[1].value = id;
314      list[1].text = name;
315      list.selectedIndex = 1;
316      protocolChanged = true;
317    }
318    function protocolOnChange()
319    {
320      protocolChanged = true;
321    }
322   
323    function selectHybStationOnClick()
324    {
325      var frm = document.forms['hybridization'];
326      var url = '../../admin/hardware/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=UpdateContext&mode=selectone&callback=setHybStationCallback';
327      if (frm.hardware_id.length > 1)
328      {
329        var id = Math.abs(parseInt(frm.hardware_id[1].value));       
330        url += '&item_id='+id;
331      }
332      url += '&filter:INT:hardwareType=<%=SystemItems.getId(HardwareType.HYBRIDIZATION_STATION)%>';
333      Main.openPopup(url, 'SelectHybStation', 1000, 700);
334    }
335    function setHybStationCallback(id, name)
336    {
337      var frm = document.forms['hybridization'];
338      var list = frm.hardware_id;
339      if (list.length < 2 || list[1].value == '0') // >
340      {
341        Forms.addListOption(list, 1, new Option());
342      }
343      list[1].value = id;
344      list[1].text = name;
345      list.selectedIndex = 1;
346    }
347   
348    function arraySlideOnChange()
349    {
350      parentsChanged = true;
351    }
352    function selectArraySlideOnClick()
353    {
354      var frm = document.forms['hybridization'];
355      var url = '../../lims/arrayslides/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=UpdateContext&mode=selectone&callback=setArraySlideCallback';
356      if (frm.arrayslide_id.length > 1)
357      {
358        var id = Math.abs(parseInt(frm.arrayslide_id[1].value));       
359        url += '&item_id='+id;
360      }
361      url += '&filter:STRING:hybridization.name==';
362      url += '&filter:BOOLEAN:destroyed=false';
363      Main.openPopup(url, 'SelectArraySlide', 1000, 700);
364    }
365    function setArraySlideCallback(arraySlideId, name)
366    {
367      var frm = document.forms['hybridization'];
368      if (frm.arrayslide_id.length < 2) // >
369      {
370        frm.arrayslide_id[frm.arrayslide_id.length] = new Option();
371      }
372      frm.arrayslide_id[1].value = arraySlideId;
373      frm.arrayslide_id[1].text = name;
374      frm.arrayslide_id.selectedIndex = 1;
375      parentsChanged = true;
376    }
377
378    function addLabeledExtractsOnClick()
379    {
380      var frm = document.forms['hybridization'];
381      var ids = Link.getListIds(frm.labeled_extracts, 'L');
382      var excludes = ids.join(',');
383     
384      var url = '../../biomaterials/labeledextracts/index.jsp?ID=<%=ID%>&mode=selectmultiple&callback=addLabeledExtractCallback';
385      url += '&exclude='+excludes;
386      Main.openPopup(url, 'AddLabeledExtracts', 1000, 700);
387    }
388    function addLabeledExtractCallback(labeledExtractId, name)
389    {
390      var item = Link.getItem('L', labeledExtractId);
391      if (!item) item = new Item('L', labeledExtractId, '1: '+name+' [-]', '', '');
392      Link.addItem(document.forms['hybridization'].labeled_extracts, item);
393      parentsChanged = true;
394      labeledExtractsOnChange();
395    }
396    function labeledExtractsOnChange()
397    {
398      var frm = document.forms['hybridization'];
399      var item = frm.labeled_extracts[frm.labeled_extracts.selectedIndex].item;
400      if (item && item.id)
401      {
402        var i = item.value.indexOf(':');
403        frm.used_quantity.value = i >= 0 ? item.value.substring(0, i) : item.value;
404        frm.array_index.value = i > 0 ? item.value.substring(i+1) : '1';
405        frm.used_quantity.focus();
406      }
407      else
408      {
409        frm.used_quantity.value = '';
410        frm.array_index.value = '1';
411      }
412    }
413    function usedQuantityOnBlur()
414    {
415      var frm = document.forms['hybridization'];
416      var usedQuantity = frm.used_quantity.value;
417      var arrayIndex = frm.array_index.value;
418      var numArrays = parseInt(frm.numArrays.value);
419      if (arrayIndex != '' && (arrayIndex > numArrays || arrayIndex <= 0))
420      {
421        alert('Array index must be between 1 and ' + numArrays);
422        return;
423      }
424      if (arrayIndex == '') arrayIndex = 1;
425      var displayQuantity = usedQuantity == '' ? '-' : usedQuantity+' µg';
426      for (var i = 0; i < frm.labeled_extracts.length; i++) // >
427      {
428        var option = frm.labeled_extracts[i];
429        if (option.selected && option.item.id)
430        {
431          option.item.value = usedQuantity + ':' + arrayIndex;
432          var text = option.text.replace(/\[.*\]/, '['+displayQuantity+']');
433          text = text.replace(/\d*\:/, arrayIndex + ':');
434          option.text = text;
435        }
436      }
437    }
438    function arrayIndexOnBlur()
439    {
440      usedQuantityOnBlur();
441    }
442
443    function removeOnClick()
444    {
445      Link.removeSelected(document.forms['hybridization'].labeled_extracts);
446      parentsChanged = true;
447    }
448
449   
450    function init()
451    {
452      var frm = document.forms['hybridization'];
453      var labeledExtracts = frm.labeled_extracts;
454      <%
455      if (hyb == null)
456      {
457        %>
458        frm.name.focus();
459        frm.name.select();
460        <%
461      }
462      if (labeledExtractsQuery != null)
463      {
464        ItemResultList<LabeledExtract> labeledExtracts = labeledExtractsQuery.list(dc);
465        for (LabeledExtract le : labeledExtracts)
466        {
467          if (hyb == null)
468          {
469            %>
470            Link.addItem(labeledExtracts, new Item('L', <%=le.getId()%>, '1: <%=HTML.javaScriptEncode(le.getName())%> [-]', ':1'));
471            <%
472          }
473          else
474          {
475            Float used = creationEvent.getUsedQuantity(le);
476            String usedQuantity = Values.formatNumber(used, -1);
477            String usedWithUnit = used == null ? "-" : usedQuantity + " µg";
478            int arrayIndex = creationEvent.getSourceGroup(le);
479            %>
480            Link.addNewItem(labeledExtracts, new Item('L', <%=le.getId()%>, '<%=arrayIndex + ": " + HTML.javaScriptEncode(le.getName())%> [<%=usedWithUnit%>]', '<%=usedQuantity%>:<%=arrayIndex%>'));
481            <%
482          }
483        }
484      }
485      %>
486    }
487    </script>
488  </base:head>
489  <base:body onload="init()">
490    <p>
491    <form action="index.jsp?ID=<%=ID%>" method="post" name="hybridization" onsubmit="return false;">
492    <input type="hidden" name="cmd" value="UpdateItem">
493
494    <h3 class="docked"><%=title%> <base:help tabcontrol="settings" /></h3>
495    <t:tabcontrol id="settings" contentstyle="<%="height: "+(int)(scale*370)+"px;"%>" 
496      position="bottom"  remember="<%=hyb != null%>" switch="switchTab">
497    <t:tab id="info" title="Hybridization" validate="validateHybridization()" helpid="hybridization.edit">
498      <table class="form" cellspacing=0>
499      <tr>
500        <td class="prompt">Name</td>
501        <td><input <%=requiredClazz%> type="text" name="name" 
502          value="<%=name%>" 
503          size="40" maxlength="<%=Hybridization.MAX_NAME_LENGTH%>"></td>
504      </tr>
505      <tr>
506        <td class="prompt">Arrays</td>
507        <td><input <%=requiredClazz%> type="text" name="numArrays" 
508          value="<%=hyb == null ? Values.getString(cc.getPropertyValue("numArrays"), "1") : hyb.getNumArrays()%>" 
509          size="12" maxlength="10" onkeypress="return Numbers.integerOnly(event)"></td>
510      </tr>
511      <tr>
512        <td class="prompt">Created</td>
513        <td>
514          <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0">
515          <tr>
516          <td>
517            <input <%=clazz%> type="text" name="event_date" 
518              value="<%=HTML.encodeTags(dateFormatter.format(eventDate == null ? new Date() : eventDate))%>" 
519              size="20" maxlength="20" title="Enter date in format: <%=htmlDateFormat%>">
520            &nbsp;
521          </td>
522          <td>
523          <base:button 
524            onclick="<%="Dates.selectDate('Created', 'hybridization', 'event_date', null, '"+jsDateFormat+"')"%>"
525            image="calendar.png"
526            title="Calendar&hellip;" 
527            tooltip="Select a date from a calendar" 
528          />
529          </td>
530          </tr>
531          </table>
532        </td>
533      </tr>
534      <tr>
535        <td class="prompt">Registered</td>
536        <td><%=dateFormatter.format(creationEvent == null ? new Date() : creationEvent.getEntryDate())%></td>
537      </tr>
538      <tr>
539        <td class="prompt">Protocol</td>
540        <td>
541          <base:select 
542            id="protocol_id"
543            clazz="selectionlist"
544            required="false"
545            current="<%=currentProtocol%>"
546            denied="<%=!readCurrentProtocol%>"
547            recent="<%=recentProtocols%>"
548            defaultitem="<%=defaultProtocol%>"
549            newitem="<%=hyb == null%>"
550            onselect="selectProtocolOnClick()"
551            onchange="protocolOnChange()"
552          />
553        </td>
554      </tr>
555      <tr>
556        <td class="prompt">Hardware</td>
557        <td>
558          <base:select 
559            id="hardware_id"
560            clazz="selectionlist"
561            required="false"
562            current="<%=currentHybStation%>"
563            denied="<%=!readCurrentHybStation%>"
564            recent="<%=recentStations%>"
565            defaultitem="<%=defaultHybStation%>"
566            newitem="<%=hyb == null%>"
567            onselect="selectHybStationOnClick()"
568          />
569        </td>
570      </tr>
571      <tr>
572        <td class="prompt">Array slide</td>
573        <td>
574          <base:select 
575            id="arrayslide_id"
576            clazz="selectionlist"
577            required="false"
578            current="<%=currentArraySlide%>"
579            denied="<%=!readCurrentArraySlide%>"
580            newitem="<%=hyb == null%>"
581            onselect="selectArraySlideOnClick()"
582          />
583        </td>
584      </tr>
585      <tr valign=top>
586        <td class="prompt">Description</td>
587        <td nowrap>
588          <textarea <%=clazz%> rows="4" cols="40" name="description" wrap="virtual"
589            ><%=HTML.encodeTags(hyb == null ? cc.getPropertyValue("description") : hyb.getDescription())%></textarea>
590          <a href="javascript:Main.zoom('Description', 'hybridization', 'description')"
591            title="Edit in larger window"><base:icon image="zoom.gif" /></a>
592        </td>
593      </tr>
594      </table>
595      <div align=right>&nbsp;<i><base:icon image="required.gif" /> = required information</i></div>
596    </t:tab>
597   
598    <t:tab id="labeledExtracts" title="Labeled extracts" helpid="hybridization.labeledextracts">
599      <input type="hidden" name="modifiedLabeledExtracts" value="">
600      <input type="hidden" name="removedLabeledExtracts" value="">
601   
602      <table class="form" cellspacing=0>
603      <tr valign="top">
604        <td class="prompt">Labeled extracts</td>
605        <td>
606          <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0">
607          <tr valign="top">
608          <td>
609            <select name="labeled_extracts" size="5" multiple style="width: 20em;" 
610              onchange="labeledExtractsOnChange()">
611            </select>&nbsp;<br>
612          </td>
613          <td>
614            <table border="0">
615            <tr><td width="150"><base:button 
616              onclick="addLabeledExtractsOnClick()" 
617              title="Add&nbsp;labeled&nbsp;extracts&hellip;" 
618              tooltip="Add labeled extracts"
619              /></td></tr>
620            <tr><td width="150"><base:button 
621              onclick="removeOnClick()" 
622              title="Remove" 
623              tooltip="Remove the selected labeled extracts"
624            /></td></tr>
625            </table>
626          </td>
627          </tr>
628          </table>
629        </td>
630      </tr>
631     
632      <tr>
633        <td style="text-align: right; padding-right: 5px;">- used quantity</td>
634        <td>
635            <input <%=clazz%> type="text" name="used_quantity" value=""
636              size="12" maxlength="10" onkeypress="return Numbers.numberOnly(event)"
637              onkeyup="usedQuantityOnBlur()"
638            > (µg)
639        </td>
640      </tr>
641
642      <tr>
643        <td style="text-align: right; padding-right: 5px;">- array index</td>
644        <td>
645            <input <%=clazz%> type="text" name="array_index" value=""
646              size="12" maxlength="10" onkeypress="return Numbers.numberOnly(event)"
647              onkeyup="arrayIndexOnBlur()"
648            >
649        </td>
650      </tr>
651
652      </table>
653    </t:tab>
654
655    <t:tab id="annotations" title="Annotations &amp; parameters" 
656      helpid="annotations.edit" tooltip="Enter values for annotations and protocol parameters">
657      <iframe name="annotations" id="idAnnotations" src="../../common/annotations/wait.jsp" 
658        width="100%"  height="<%=(int)(scale*370)%>" frameborder=0 vspace=0 hspace=0
659        marginwidth=0 marginheight=0 scrolling="auto" style="overflow: visible"></iframe>
660    </t:tab>
661   
662    <t:tab id="inheritedAnnotations" title="Inherited annotations" helpid="annotations.edit.inherited">
663   
664      <iframe name="inheritedAnnotations" id="idInheritedAnnotations" src="../../common/annotations/wait.jsp" 
665        width="100%"  height="<%=(int)(scale*370)%>" frameborder=0 vspace=0 hspace=0
666        marginwidth=0 marginheight=0 scrolling="auto" style="overflow: visible"></iframe>
667    </t:tab>
668    </t:tabcontrol>
669
670    <table align="center">
671    <tr>
672      <td width="50%"><base:button onclick="saveSettings()" title="Save" /></td>
673      <td width="50%"><base:button onclick="window.close()" title="Cancel" /></td>
674    </tr>
675    </table>
676    </form>
677  </base:body>
678  </base:page>
679  <%
680}
681finally
682{
683  if (dc != null) dc.close();
684}
685%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.