source: trunk/www/views/rawbioassays/edit_rawbioassay.jsp @ 3400

Last change on this file since 3400 was 3400, checked in by Nicklas Nordborg, 14 years ago

Fixes #534.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 20.4 KB
Line 
1<%-- $Id: edit_rawbioassay.jsp 3400 2007-05-29 06:47:04Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) Authors contributing to this file.
4
5  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
6  Available at http://base.thep.lu.se/
7
8  BASE is free software; you can redistribute it and/or
9  modify it under the terms of the GNU General Public License
10  as published by the Free Software Foundation; either version 2
11  of the License, or (at your option) any later version.
12
13  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
14  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
15  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
16  GNU General Public License for more details.
17
18  You should have received a copy of the GNU General Public License
19  along with this program; if not, write to the Free Software
20  Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330,
21  Boston, MA  02111-1307, USA.
22  ------------------------------------------------------------------
23
24
25  @author Nicklas
26  @version 2.0
27--%>
28<%@ page session="false"
29  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
30  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
31  import="net.sf.basedb.core.Item"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
33  import="net.sf.basedb.core.SystemItems"
34  import="net.sf.basedb.core.Permission"
35  import="net.sf.basedb.core.RawBioAssay"
36  import="net.sf.basedb.core.Affymetrix"
37  import="net.sf.basedb.core.Scan"
38  import="net.sf.basedb.core.Protocol"
39  import="net.sf.basedb.core.ProtocolType"
40  import="net.sf.basedb.core.Project"
41  import="net.sf.basedb.core.Software"
42  import="net.sf.basedb.core.SoftwareType"
43  import="net.sf.basedb.core.ArrayDesign"
44  import="net.sf.basedb.core.File"
45  import="net.sf.basedb.core.FileType"
46  import="net.sf.basedb.core.RawDataType"
47  import="net.sf.basedb.core.RawDataTypes"
48  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
49  import="net.sf.basedb.core.ItemResultList"
50  import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
51  import="net.sf.basedb.core.BaseException"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
54  import="net.sf.basedb.util.Values"
55  import="java.util.List"
56  import="java.util.Set"
57  import="java.util.HashSet"
58%>
59<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
60<%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
61<%
62final Item itemType = Item.RAWBIOASSAY;
63final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, true);
64final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
65final int itemId = cc.getId();
66final String ID = sc.getId();
67final float scale = Base.getScale(sc);
68final DbControl dc = sc.newDbControl();
69try
70{
71  String title = null;
72  RawBioAssay rawBioAssay = null;
73  String name = null;
74  boolean readCurrentCelFile = true;
75  File currentCelFile = null; 
76  boolean readCurrentScan = true;
77  Scan currentScan = null;
78  boolean readCurrentProtocol = true;
79  Protocol currentProtocol = null;
80  Protocol defaultProtocol = null;
81  boolean readCurrentSoftware = true;
82  Software currentSoftware = null;
83  Software defaultSoftware = null;
84  boolean readCurrentArrayDesign = true;
85  ArrayDesign currentArrayDesign = null;
86  ArrayDesign defaultArrayDesign = null;
87  RawDataType currentRawDataType = null;
88  RawDataType defaultRawDataType = null;
89
90  // Load recently used items
91  List<Protocol> recentProtocols = (List<Protocol>)cc.getRecent(dc, Item.PROTOCOL);
92  List<Scan> recentScans = (List<Scan>)cc.getRecent(dc, Item.SCAN);
93  List<Software> recentSoftware = (List<Software>)cc.getRecent(dc, Item.SOFTWARE);
94  List<ArrayDesign> recentArrayDesigns = (List<ArrayDesign>)cc.getRecent(dc, Item.ARRAYDESIGN);
95  List<File> recentFiles = (List<File>)cc.getRecent(dc, Item.FILE);
96 
97  int activeProjectId = sc.getActiveProjectId();
98  if (activeProjectId > 0)
99  {
100    Project activeProject = Project.getById(dc, activeProjectId);
101    try
102    {
103      defaultProtocol = (Protocol)activeProject.getDefaultItem(dc, Project.Default.FEATURE_EXTRACTION_PROTOCOL);     
104    }
105    catch (PermissionDeniedException pdex)
106    {
107      defaultProtocol = null;
108    }
109    try
110    {
111      defaultSoftware = (Software)activeProject.getDefaultItem(dc, Project.Default.SOFTWARE);     
112    }
113    catch (PermissionDeniedException pdex)
114    {
115      defaultSoftware = null;
116    }
117    try
118    {
119      defaultArrayDesign = (ArrayDesign)activeProject.getDefaultItem(dc, Project.Default.ARRAYDESIGN);     
120    }
121    catch (PermissionDeniedException pdex)
122    {
123      defaultArrayDesign = null;
124    }
125    defaultRawDataType = activeProject.getDefaultRawDataType();
126  }
127  if (itemId == 0)
128  {
129    title = "Create raw bioassay";
130    cc.removeObject("item");
131    currentRawDataType = RawDataTypes.getRawDataType(cc.getPropertyValue("rawDataType"));
132    if (currentRawDataType == null)
133    {
134      currentRawDataType = RawDataTypes.getRawDataType(cc.getRecent("RawDataType", 0));
135    }
136
137    int scanId = Values.getInt(request.getParameter("scan_id"));
138    if (scanId != 0)
139    {
140      currentScan = Scan.getById(dc, scanId);
141    }
142    else if (cc.getPropertyFilter("scan.name") != null)
143    {
144      currentScan = Base.getFirstMatching(dc, Scan.getQuery(), "name", cc.getPropertyFilter("scan.name"));
145    }
146
147    if (currentScan != null)
148    {
149      name = currentScan.getName() + ".r" + (currentScan.countRawBioAssays() + 1);
150    }
151    else
152    {
153      name = Values.getString(cc.getPropertyValue("name"), "New raw bioassay");
154    }
155    if (cc.getPropertyFilter("protocol.name") != null)
156    {
157      currentProtocol = Base.getFirstMatching(dc, Protocol.getQuery(), "name", cc.getPropertyFilter("protocol.name"));
158    }
159   
160    if (cc.getPropertyFilter("software.name") != null)
161    {
162      currentSoftware = Base.getFirstMatching(dc, Software.getQuery(), "name", cc.getPropertyFilter("software.name"));
163    }
164    if (currentScan != null)
165    {
166      try
167      {
168        currentArrayDesign = currentScan.getArrayDesign();
169      }
170      catch (PermissionDeniedException ex)
171      {}
172    }
173    if (currentArrayDesign == null && cc.getPropertyFilter("arrayDesign.name") != null)
174    {
175      currentArrayDesign = Base.getFirstMatching(dc, ArrayDesign.getQuery(), "name", cc.getPropertyFilter("arrayDesign.name"));
176    } 
177    currentRawDataType = currentRawDataType != null ? currentRawDataType : defaultRawDataType;
178  }
179  else
180  {
181    rawBioAssay = RawBioAssay.getById(dc, itemId);
182    cc.setObject("item", rawBioAssay);
183    name = rawBioAssay.getName();
184    currentRawDataType = rawBioAssay.getRawDataType();
185    title = "Edit raw bioassay -- " + HTML.encodeTags(rawBioAssay.getName());
186   
187    if (currentRawDataType.isAffymetrix())
188    {
189      try
190      {
191        currentCelFile = Affymetrix.getCelFile(rawBioAssay);
192      }
193      catch (PermissionDeniedException ex)
194      {
195        readCurrentCelFile = false;
196      }
197    }
198   
199    try
200    {
201      currentScan = rawBioAssay.getScan();
202    }
203    catch (PermissionDeniedException ex)
204    {
205      readCurrentScan = false;
206    }
207    try
208    {
209      currentProtocol = rawBioAssay.getProtocol();
210    }
211    catch (PermissionDeniedException ex)
212    {
213      readCurrentProtocol = false;
214    }
215    try
216    {
217      currentSoftware = rawBioAssay.getSoftware();
218    }
219    catch (PermissionDeniedException ex)
220    {
221      readCurrentSoftware = false;
222    }
223    try
224    {
225      currentArrayDesign = rawBioAssay.getArrayDesign();
226    }
227    catch (PermissionDeniedException ex)
228    {
229      readCurrentArrayDesign = false;
230    }
231  }
232  if (rawBioAssay != null) rawBioAssay.checkPermission(Permission.WRITE);
233  final String clazz = "class=\"text\"";
234  final String requiredClazz = "class=\"text required\"";
235  %>
236
237  <base:page type="popup" title="<%=title%>">
238  <base:head scripts="tabcontrol.js,annotations.js" styles="tabcontrol.css">
239    <script language="JavaScript">
240    // Validate the "RawBioAssay" tab
241    function validateRawBioAssay()
242    {
243      var frm = document.forms['rawbioassay'];
244      if (Main.trimString(frm.name.value) == '')
245      {
246        alert("You must enter a name");
247        frm.name.focus();
248        return false;
249      }
250      if (frm.rawdatatype)
251      {
252        var rawDataType = frm.rawdatatype[frm.rawdatatype.selectedIndex].value;
253        if (isAffymetrix[rawDataType])
254        {
255          var celFileId = frm.celfile_id[frm.celfile_id.selectedIndex].value;
256          var arrayDesignId = frm.arraydesign_id[frm.arraydesign_id.selectedIndex].value;
257          if (celFileId != 0 && arrayDesignId == 0)
258          {
259            alert('You must select an array design if a CEL file is specified');
260            return false;
261          }
262        }
263      }
264      return true;
265    }
266
267    // Submit the form
268    function saveSettings()
269    {
270      var frm = document.forms['rawbioassay'];
271      if (TabControl.validateActiveTab('settings'))
272      {
273        if (annotationsLoaded)
274        {
275          Annotations.addModifiedAnnotationsToForm(frames.annotations, frm);
276        }
277        if (inheritedAnnotationsLoaded)
278        {
279          Annotations.addInheritedAnnotationsToForm(frames.inheritedAnnotations, frm);
280        }
281        frm.submit();
282      }
283    }
284   
285    var annotationsLoaded = false;
286    var inheritedAnnotationsLoaded = false;
287    var parentsChanged = false;
288    var protocolChanged = false;
289    function switchTab(tabControlId, tabId)
290    {
291      if (TabControl.setActiveTab(tabControlId, tabId))
292      {
293        if (tabId == 'annotations' && (protocolChanged || !annotationsLoaded))
294        {
295          Annotations.loadAnnotateFrame(frames.annotations, '<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=rawBioAssay == null ? 0 : rawBioAssay.getId()%>, getProtocolId());
296          annotationsLoaded = true;
297          protocolChanged = false;
298        }
299        else if (tabId == 'inheritedAnnotations' && 
300          (parentsChanged || !inheritedAnnotationsLoaded))
301        {
302          Annotations.loadInheritFrame(frames.inheritedAnnotations, '<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', <%=itemId%>, getParents());
303          inheritedAnnotationsLoaded = true;
304          parentsChanged = false;
305        }
306      }
307    }
308   
309    function getProtocolId()
310    {
311      var frm = document.forms['rawbioassay'];
312      var protocolId = 0;
313      if (frm.protocol_id.length > 0 && !frm.protocol_id.disabled)
314      {
315        protocolId = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id[frm.protocol_id.selectedIndex].value));       
316      }
317      return protocolId;
318    }
319
320    function getParents()
321    {
322      var frm = document.forms['rawbioassay'];
323      var parents = new Array();
324
325      var scanId = Math.abs(parseInt(frm.scan_id[frm.scan_id.selectedIndex].value));
326      if (scanId > 0) parents[parents.length] = 'SCAN:'+scanId;
327      if (frm.arraydesign_id)
328      {
329        var arrayDesignId = Math.abs(parseInt(frm.arraydesign_id[frm.arraydesign_id.selectedIndex].value));
330        if (arrayDesignId > 0) parents[parents.length] = 'ARRAYDESIGN:'+arrayDesignId;
331      }
332      return parents;
333    }
334
335    function selectProtocolOnClick()
336    {
337      var frm = document.forms['rawbioassay'];
338      var url = '../../admin/protocols/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=UpdateContext&mode=selectone&callback=setProtocolCallback';
339      if (frm.protocol_id.length > 1)
340      {
341        var id = Math.abs(parseInt(frm.protocol_id[1].value));
342        url += '&item_id='+id;
343      }
344      url += '&filter:INT:protocolType=<%=SystemItems.getId(ProtocolType.FEATURE_EXTRACTION)%>';
345      Main.openPopup(url, 'SelectProtocol', 1000, 700);
346    }
347    function setProtocolCallback(id, name)
348    {
349      var frm = document.forms['rawbioassay'];
350      var list = frm.protocol_id;
351      if (list.length < 2 || list[1].value == '0') // >
352      {
353        Forms.addListOption(list, 1, new Option());
354      }
355      list[1].value = id;
356      list[1].text = name;
357      list.selectedIndex = 1;
358      protocolChanged = true;
359    }
360    function protocolOnChange()
361    {
362      protocolChanged = true;
363    }
364   
365    function scanOnChange()
366    {
367      parentsChanged = true;
368    }
369    function selectScanOnClick()
370    {
371      var frm = document.forms['rawbioassay'];
372      var url = '../scans/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=UpdateContext&mode=selectone&callback=setScanCallback';
373      if (frm.scan_id.length > 1)
374      {
375        var id = Math.abs(parseInt(frm.scan_id[1].value));
376        url += '&item_id='+id;
377      }
378      Main.openPopup(url, 'SelectScan', 1000, 700);
379    }
380    function setScanCallback(id, name)
381    {
382      var frm = document.forms['rawbioassay'];
383      var list = frm.scan_id;
384      if (list.length < 2 || list[1].value == '0') // >
385      {
386        Forms.addListOption(list, 1, new Option());
387      }
388      list[1].value = id;
389      list[1].text = name;
390      list.selectedIndex = 1;
391      parentsChanged = true;
392    }
393   
394    function selectSoftwareOnClick()
395    {
396      var frm = document.forms['rawbioassay'];
397      var url = '../../admin/software/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=UpdateContext&mode=selectone&callback=setSoftwareCallback';
398      if (frm.software_id.length > 1)
399      {
400        var id = Math.abs(parseInt(frm.software_id[1].value));       
401        url += '&item_id='+id;
402      }
403      url += '&filter:INT:softwareType=<%=SystemItems.getId(SoftwareType.FEATURE_EXTRACTION)%>';
404      Main.openPopup(url, 'SelectSoftware', 1000, 700);
405    }
406    function setSoftwareCallback(id, name)
407    {
408      var frm = document.forms['rawbioassay'];
409      var list = frm.software_id;
410      if (list.length < 2 || list[1].value == '0') // >
411      {
412        Forms.addListOption(list, 1, new Option());
413      }
414      list[1].value = id;
415      list[1].text = name;
416      list.selectedIndex = 1;
417    }
418   
419    function arrayDesignOnChange()
420    {
421      parentsChanged = true;
422    }
423    function selectArrayDesignOnClick()
424    {
425      var frm = document.forms['rawbioassay'];
426      var url = '../../lims/arraydesigns/index.jsp?ID=<%=ID%>&mode=selectone&callback=setArrayDesignCallback';
427      if (frm.arraydesign_id.length > 1)
428      {
429        var id = Math.abs(parseInt(frm.arraydesign_id[1].value));       
430        url += '&item_id='+id;
431      }
432      Main.openPopup(url, 'SelectArrayDesign', 1000, 700);
433    }
434    function setArrayDesignCallback(id, name)
435    {
436      var frm = document.forms['rawbioassay'];
437      var list = frm.arraydesign_id;
438      if (list.length < 2 || list[1].value == '0') // >
439      {
440        Forms.addListOption(list, 1, new Option());
441      }
442      list[1].value = id;
443      list[1].text = name;
444      list.selectedIndex = 1;
445      parentsChanged = true;
446    }
447   
448    var isAffymetrix = new Array();
449    <%
450    for (RawDataType rdt : RawDataTypes.getRawDataTypes())
451    {
452      %>
453      isAffymetrix['<%=rdt.getId()%>'] = <%=rdt.isAffymetrix() ? "true" : "false" %>;
454      <%
455    }
456    %>
457   
458    function selectCelFileOnClick()
459    {
460      var frm = document.forms['rawbioassay'];
461     
462      if (frm.rawdatatype)
463      {
464        var rawDataType = frm.rawdatatype[frm.rawdatatype.selectedIndex].value;
465        if (!isAffymetrix[rawDataType])
466        {
467          alert('CEL-files are only used for Affymetrix data types.');
468          return;
469        }
470      }
471
472      var url = '../../filemanager/index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=SelectOne&callback=setCelFileCallback';
473      if (frm.celfile_id.length > 1)
474      {
475        var id = Math.abs(parseInt(frm.celfile_id[1].value));       
476        url += '&item_id='+id;
477      }
478      url += '&filter:STRING:name=%25.cel';
479      Main.openPopup(url, 'SelectFile', 1000, 700);
480    }
481    function setCelFileCallback(id, name)
482    {
483      var frm = document.forms['rawbioassay'];
484      var list = frm.celfile_id;
485      if (list.length < 2 || list[1].value == '0') // >
486      {
487        Forms.addListOption(list, 1, new Option());
488      }
489      list[1].value = id;
490      list[1].text = name;
491      list.selectedIndex = 1;
492    }
493
494    function rawDataTypeOnChange()
495    {
496      var frm = document.forms['rawbioassay'];
497      if (frm.rawdatatype)
498      {
499        var rawDataType = frm.rawdatatype[frm.rawdatatype.selectedIndex].value;
500        if (isAffymetrix[rawDataType])
501        {
502          frm.celfile_id.disabled = false;
503        }
504        else
505        {
506          frm.celfile_id.disabled = true;
507        }
508      }
509    }
510
511    function init()
512    {
513      <%
514      if (rawBioAssay == null)
515      {
516        %>
517        var frm = document.forms['rawbioassay'];
518        frm.name.focus();
519        frm.name.select();
520        <%
521      }
522      %>
523      rawDataTypeOnChange();
524    }
525    </script>
526  </base:head>
527  <base:body onload="init()">
528    <p>
529    <form action="index.jsp?ID=<%=ID%>" method="post" name="rawbioassay" onsubmit="return false;">
530    <input type="hidden" name="cmd" value="UpdateItem">
531
532    <h3 class="docked"><%=title%> <base:help tabcontrol="settings" /></h3>
533    <t:tabcontrol id="settings" contentstyle="<%="height: "+(int)(scale*370)+"px;"%>" 
534      position="bottom"  remember="<%=rawBioAssay != null%>" switch="switchTab">
535    <t:tab id="info" title="Raw bioassay" validate="validateRawBioAssay()" helpid="rawbioassay.edit">
536      <table class="form" cellspacing=0>
537      <tr>
538        <td class="prompt">Name</td>
539        <td><input <%=requiredClazz%> type="text" name="name" 
540          value="<%=HTML.encodeTags(name)%>" 
541          size="40" maxlength="<%=RawBioAssay.MAX_NAME_LENGTH%>"></td>
542      </tr>
543      <tr>
544        <td class="prompt">Raw data type</td>
545        <td>
546          <%
547          if (rawBioAssay == null || !rawBioAssay.hasData())
548          {
549            %>
550            <select name="rawdatatype" class="required" onchange="rawDataTypeOnChange()">
551            <%
552            for (RawDataType rdt : RawDataTypes.getRawDataTypes())
553            {
554              String selected = rdt.equals(currentRawDataType) ? "selected" : "";
555              %>
556              <option value="<%=rdt.getId()%>" <%=selected%>><%=HTML.encodeTags(rdt.getName())%>
557              <%
558            }
559            %>
560            </select>
561            <%
562          }
563          else
564          {
565            %>
566            <%=HTML.encodeTags(currentRawDataType.getName())%>
567            <%
568          }
569          %>
570       
571        </td>
572      </tr>
573     
574      <tr>
575        <td class="prompt">Array design</td>
576        <td>
577          <%
578          if (rawBioAssay == null || !rawBioAssay.hasData())
579          {
580            %>
581            <base:select 
582              id="arraydesign_id"
583              clazz="selectionlist"
584              required="false"
585              current="<%=currentArrayDesign%>"
586              denied="<%=!readCurrentArrayDesign%>"
587              recent="<%=recentArrayDesigns%>"
588              defaultitem="<%=defaultArrayDesign%>"
589              newitem="<%=rawBioAssay == null%>"
590              onselect="selectArrayDesignOnClick()"
591              onchange="arrayDesignOnChange()"
592            />
593            <%
594          }
595          else
596          {
597            %>
598            <%=readCurrentArrayDesign ? 
599              (currentArrayDesign != null ? HTML.encodeTags(currentArrayDesign.getName()) : "<i>- none -</i>") 
600              : "<i>- denied - </i>"%>
601            <%
602          }
603          %>
604        </td>
605      </tr>
606      <% 
607      if (rawBioAssay == null || !rawBioAssay.hasData() || rawBioAssay.getRawDataType().isAffymetrix())
608      {
609        %>
610        <tr id="celFile">
611          <td class="prompt">CEL file</td>
612          <td>
613            <base:select 
614              id="celfile_id"
615              clazz="selectionlist"
616              required="false"
617              current="<%=currentCelFile%>"
618              denied="<%=!readCurrentCelFile%>"
619              recent="<%=recentFiles%>"
620              newitem="<%=rawBioAssay == null%>"
621              onselect="selectCelFileOnClick()"
622            />
623          </td>
624        </tr>
625        <%
626      }
627      %>
628
629      <tr>
630        <td class="prompt">Protocol</td>
631        <td>
632          <base:select 
633            id="protocol_id"
634            clazz="selectionlist"
635            required="false"
636            current="<%=currentProtocol%>"
637            denied="<%=!readCurrentProtocol%>"
638            recent="<%=recentProtocols%>"
639            defaultitem="<%=defaultProtocol%>"
640            newitem="<%=rawBioAssay == null%>"
641            onselect="selectProtocolOnClick()"
642            onchange="protocolOnChange()"
643          />
644        </td>
645      </tr>
646      <tr>
647        <td class="prompt">Scan</td>
648        <td>
649          <base:select 
650            id="scan_id"
651            clazz="selectionlist"
652            required="false"
653            current="<%=currentScan%>"
654            denied="<%=!readCurrentScan%>"
655            recent="<%=recentScans%>"
656            newitem="<%=rawBioAssay == null%>"
657            onselect="selectScanOnClick()"
658          />
659        </td>
660      </tr>
661      <tr>
662        <td class="prompt">Software</td>
663        <td>
664          <base:select 
665            id="software_id"
666            clazz="selectionlist"
667            required="false"
668            current="<%=currentSoftware%>"
669            denied="<%=!readCurrentSoftware%>"
670            recent="<%=recentSoftware%>"
671            defaultitem="<%=defaultSoftware%>"
672            newitem="<%=rawBioAssay == null%>"
673            onselect="selectSoftwareOnClick()"
674          />
675        </td>
676      </tr>
677      <tr valign=top>
678        <td class="prompt">Description</td>
679        <td nowrap>
680          <textarea <%=clazz%> rows="4" cols="40" name="description" wrap="virtual"
681            ><%=HTML.encodeTags(rawBioAssay == null ? cc.getPropertyValue("description") : rawBioAssay.getDescription())%></textarea>
682          <a href="javascript:Main.zoom('Description', 'rawbioassay', 'description')"
683            title="Edit in larger window"><base:icon image="zoom.gif" /></a>
684        </td>
685      </tr>
686      </table>
687      <div align=right>&nbsp;<i><base:icon image="required.gif" /> = required information</i></div>
688    </t:tab>
689
690    <t:tab id="annotations" title="Annotations &amp; parameters" 
691      helpid="annotations.edit" tooltip="Enter values for annotations and protocol parameters">
692      <iframe name="annotations" id="idAnnotations" src="../../common/annotations/wait.jsp" 
693        width="100%"  height="<%=(int)(scale*370)%>" frameborder=0 vspace=0 hspace=0
694        marginwidth=0 marginheight=0 scrolling="auto" style="overflow: visible"></iframe>
695    </t:tab>
696   
697    <t:tab id="inheritedAnnotations" title="Inherited annotations" helpid="annotations.edit.inherited">
698      <iframe name="inheritedAnnotations" id="idInheritedAnnotations" src="../../common/annotations/wait.jsp" 
699        width="100%"  height="<%=(int)(scale*370)%>" frameborder=0 vspace=0 hspace=0
700        marginwidth=0 marginheight=0 scrolling="auto" style="overflow: visible"></iframe>
701    </t:tab>
702    </t:tabcontrol>
703
704    <table align="center">
705    <tr>
706      <td width="50%"><base:button onclick="saveSettings()" title="Save" /></td>
707      <td width="50%"><base:button onclick="window.close()" title="Cancel" /></td>
708    </tr>
709    </table>
710    </form>
711  </base:body>
712  </base:page>
713  <%
714}
715finally
716{
717  if (dc != null) dc.close();
718}
719%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.