source: trunk/www/views/reporterlists/list_reporterlists.jsp @ 6698

Last change on this file since 6698 was 6698, checked in by Nicklas Nordborg, 7 years ago

References #1912: Add more filter rows in list pages

Implemented in list pages on the lower half of 'View' menu (physical bioassays, derived bioassays, experiments, formulas, reporters and reporter lists).

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 15.4 KB
Line 
1<%-- $Id: list_reporterlists.jsp 6698 2015-01-30 09:38:36Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4  Copyright (C) 2007 Johan Enell, Martin Svensson
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page pageEncoding="UTF-8" session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.Item"
30  import="net.sf.basedb.core.ReporterList"
31  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
32  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
33  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
34  import="net.sf.basedb.core.Nameable"
35  import="net.sf.basedb.core.Permission"
36  import="net.sf.basedb.core.RawDataTypes"
37  import="net.sf.basedb.core.RawDataType"
38  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
39  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
40  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
41  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
42  import="net.sf.basedb.util.ShareableUtil"
43  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
44  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
45  import="net.sf.basedb.clients.web.PermissionUtil"
46  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
47  import="net.sf.basedb.util.Values"
48  import="net.sf.basedb.util.formatter.Formatter"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.formatter.FormatterFactory"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
52  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
53  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
54  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.list.ListColumnUtil"
55  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
56  import="java.util.Date"
57  import="java.util.Iterator"
58  import="java.util.List"
59  import="java.util.Map"
60%>
61<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
62<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
63<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
64<%!
65  private static final Item itemType = Item.REPORTERLIST;
66  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
67%>
68<%
69final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
70final String ID = sc.getId();
71final boolean createPermission = sc.hasPermission(Permission.CREATE, itemType);
72final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
73
74final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
75final String callback = request.getParameter("callback");
76final String title = mode.generateTitle("reporter list", "reporter lists");
77final DbControl dc = sc.newDbControl();
78ItemResultIterator<ReporterList> reporterLists = null;
79try
80{
81  Formatter<Date> dateFormatter = FormatterFactory.getDateFormatter(sc);
82  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
83  try
84  {
85    final ItemQuery<ReporterList> query = Base.getConfiguredQuery(dc, cc, true, ReporterList.getQuery(), mode);
86    reporterLists = query.iterate(dc);
87  }
88  catch (Throwable t)
89  {
90    cc.setMessage(t.getMessage());
91  }
92  int numListed = 0;
93  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, null);
94  ExtensionsInvoker invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
95  ExtensionsInvoker columnsInvoker = ListColumnUtil.useExtensions(jspContext);
96  %>
97  <base:page title="<%=title==null ? "Reporter lists" : title%>" type="<%=mode.getPageType()%>" id="list-page">
98  <base:head scripts="table.js,~reporterlists.js" styles="table.css,toolbar.css">
99    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
100    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
101  </base:head>
102 
103  <base:body>
104    <h1><%=title==null ? "Reporter lists" : title%></h1>
105    <div class="content">
106    <tbl:table 
107      id="reporterLists" 
108      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
109      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
110      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
111      action="index.jsp"
112      sc="<%=sc%>"
113      item="<%=itemType%>"
114      filterrows="<%=cc.getFilterRows()%>"
115      subclass="fulltable"
116      >
117      <tbl:hidden 
118        name="mode" 
119        value="<%=mode.getName()%>" 
120      />
121      <tbl:hidden 
122        name="callback" 
123        value="<%=callback%>" 
124        skip="<%=callback == null%>" 
125      />
126      <tbl:columndef 
127        id="name"
128        property="name"
129        datatype="string"
130        title="Name"
131        sortable="true" 
132        filterable="true"
133        exportable="true"
134        show="always" 
135      />
136      <tbl:columndef 
137        id="id"
138        clazz="uniquecol"
139        property="id"
140        datatype="int"
141        title="ID"
142        sortable="true"
143        filterable="true"
144        exportable="true"
145      />
146      <tbl:columndef 
147        id="entryDate"
148        property="entryDate"
149        datatype="date"
150        title="Registered"
151        sortable="true" 
152        filterable="true"
153        exportable="true"
154        formatter="<%=dateFormatter%>"
155      />
156      <tbl:columndef 
157        id="externalId"
158        property="externalId"
159        datatype="string"
160        title="External ID"
161        sortable="true" 
162        filterable="true"
163        exportable="true"
164      />
165      <tbl:columndef 
166        id="numReporters"
167        property="size"
168        datatype="int"
169        title="Size"
170        sortable="true" 
171        filterable="true"
172        exportable="true"
173      />
174      <tbl:columndef 
175        id="owner"
176        property="owner.name"
177        datatype="string"
178        title="Owner"
179        sortable="true" 
180        filterable="true"
181        exportable="true"
182      />
183      <tbl:columndef 
184        id="experiment"
185        property="experiment"
186        datatype="string"
187        title="Experiment"
188        sortable="true" 
189        filterable="true"
190        exportable="true"
191      />
192      <tbl:columndef 
193        id="description"
194        property="description"
195        datatype="string"
196        title="Description" 
197        sortable="true" 
198        filterable="true" 
199        exportable="true"
200      />
201      <tbl:columndef
202        id="permission"
203        title="Permission"
204      />
205      <tbl:columndef
206        id="sharedTo"
207        title="Shared to"
208        filterable="true"
209        filterproperty="!sharedTo.name"
210        datatype="string"
211      />
212      <tbl:columndef 
213        id="xt-columns" 
214        extensions="<%=columnsInvoker%>" 
215        jspcontext="<%=jspContext%>" 
216      />
217      <div class="panelgroup bg-filled-50 bottomborder">
218        <tbl:toolbar
219          subclass="bottomborder"
220          visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
221          >
222          <tbl:button 
223            id="btnNewItem"
224            disabled="<%=!createPermission%>" 
225            image="new.png" 
226            title="New&hellip;" 
227            tooltip="<%=createPermission ? "Create new reporter list" : "You do not have permission to create reporter lists"%>" 
228          />
229          <tbl:button 
230            id="btnDeleteItems"
231            image="delete.png"
232            title="Delete" 
233            tooltip="Delete the selected items" 
234          />
235          <tbl:button 
236            id="btnRestoreItems"
237            image="restore.png"
238            title="Restore" 
239            tooltip="Restore the selected (deleted) items"
240          />
241          <tbl:button 
242            id="btnShareItems"
243            image="share.png"
244            title="Share&hellip;" 
245            tooltip="Share the selected items"
246          />
247          <tbl:button 
248            id="btnSetOwner"
249            image="take_ownership.png"
250            title="Set owner&hellip;"
251            tooltip="Change owner of the selected items"
252          />
253          <tbl:button 
254            id="btnColumns"
255            image="columns.png" 
256            title="Columns&hellip;" 
257            tooltip="Show, hide and re-order columns" 
258          />
259          <tbl:button 
260            id="btnImport"
261            data-plugin-type="IMPORT"
262            image="import.png" 
263            title="Import&hellip;" 
264            tooltip="Import data" 
265            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
266          />
267          <tbl:button 
268            id="btnExport"
269            data-plugin-type="EXPORT"
270            image="export.png" 
271            title="Export&hellip;" 
272            tooltip="Export data" 
273            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
274          />
275          <tbl:button 
276            id="btnRunPlugin"
277            data-plugin-type="OTHER"
278            image="runplugin.png" 
279            title="Run plugin&hellip;" 
280            tooltip="Run a plugin" 
281            visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
282          />
283          <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
284            wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
285        </tbl:toolbar>
286        <tbl:panel>
287          <tbl:presetselector />
288          <tbl:navigator
289            page="<%=cc.getPage()%>" 
290            rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
291            totalrows="<%=reporterLists == null ? 0 : reporterLists.getTotalCount()%>" 
292            visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
293          />
294        </tbl:panel>
295      </div>
296      <tbl:data>
297        <tbl:headers>
298          <tbl:headerrow>
299            <tbl:header colspan="3" />
300            <tbl:columnheaders />
301          </tbl:headerrow>
302          <%
303          int numFilters = cc.getNumPropertyFilters();
304          int numRows = cc.getFilterRows();
305          for (int filterNo = 0; filterNo < numRows; filterNo++)
306          {
307            boolean lastRow = filterNo == numRows-1;
308            %>
309            <tbl:headerrow>
310              <tbl:header subclass="index" />
311              <tbl:header 
312                subclass="check" 
313                visible="<%=mode.hasCheck()%>"
314                ><base:icon 
315                  id="check.uncheck"
316                  image="check_uncheck.png" 
317                  tooltip="Check/uncheck all" 
318                  visible="<%=lastRow%>"
319                /></tbl:header>
320              <tbl:header 
321                subclass="check" 
322                visible="<%=mode.hasRadio()%>"
323                />
324              <tbl:header 
325                subclass="icons" 
326                visible="<%=mode.hasIcons()%>"
327                >
328                <base:icon
329                  id="table-add-filter-row"
330                  image="add.png"
331                  tooltip="Add extra filter row"
332                  visible="<%=lastRow%>"
333                /><base:icon
334                  id="<%="remove-filter-row-"+filterNo %>"
335                  subclass="table-remove-filter-row"
336                  image="remove.png"
337                  tooltip="Remove this filter row"
338                  visible="<%=numRows > 1 || numFilters > 0 %>"
339                  data-filter-index="<%=filterNo%>"
340                />
341              </tbl:header>
342              <tbl:propertyfilter row="<%=filterNo%>" />
343            </tbl:headerrow>
344            <%
345          }
346          %>
347        </tbl:headers>
348        <tbl:rows>
349          <%
350          if (cc.getMessage() != null)
351          {
352            %>
353            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
354              <div class="messagecontainer error"><%=cc.getMessage()%></div>
355            </tbl:panel>
356            <%
357            cc.setMessage(null);
358          }
359          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
360          int selectedItemId = cc.getId();
361          if (reporterLists != null)
362          {           
363            while (reporterLists.hasNext())
364            {
365              ReporterList item = reporterLists.next();
366              int itemId = item.getId();
367             
368             
369              boolean deletePermission = item.hasPermission(Permission.DELETE);
370              boolean sharePermission = item.hasPermission(Permission.SET_PERMISSION);
371              boolean writePermission = item.hasPermission(Permission.WRITE);
372              String tooltip = mode.isSelectionMode() ?
373                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
374              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
375              index++;
376              numListed++;
377              %>
378              <tbl:row>
379                <tbl:header 
380                  clazz="index"
381                  ><%=index%></tbl:header>
382                <tbl:header 
383                  clazz="check" 
384                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
385                  ><input 
386                    type="checkbox" 
387                    name="<%=itemId%>" 
388                    value="<%=itemId%>" 
389                    title="<%=name%>" 
390                    <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%> 
391                  ></tbl:header>
392                <tbl:header 
393                  clazz="check" 
394                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
395                  ><input 
396                    type="radio" 
397                    name="item_id" 
398                    value="<%=itemId%>" 
399                    title="<%=name%>" 
400                    <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
401                  ></tbl:header>
402                <tbl:header 
403                  clazz="icons" 
404                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
405                  ><base:icon 
406                    image="deleted.png"
407                    id="<%="delete."+itemId %>"
408                    subclass="<%=deletePermission ? "table-delete-item" : null %>"
409                    data-item-id="<%=itemId%>"
410                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
411                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
412                  /><base:icon 
413                    image="shared.png" 
414                    id="<%="share."+itemId %>"
415                    subclass="<%=sharePermission ? "table-share-item" : null %>"
416                    data-item-id="<%=itemId%>"
417                    tooltip="This item is shared to other users, groups and/or projects" 
418                    visible="<%=item.isShared()%>"
419                  />&nbsp;</tbl:header>
420                <tbl:cell column="name"><div
421                  class="link table-item"
422                  data-item-id="<%=itemId%>"
423                  data-no-edit="<%=writePermission ? 0 : 1 %>" 
424                  tabindex="0"
425                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
426                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
427                <tbl:cell column="entryDate" value="<%=item.getEntryDate()%>" />
428                <tbl:cell column="owner"
429                  ><base:propertyvalue 
430                    item="<%=item%>" 
431                    property="owner"
432                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
433                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
434                  /></tbl:cell>
435                <tbl:cell column="experiment"
436                  ><base:propertyvalue 
437                    item="<%=item%>" 
438                    property="experiment"
439                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
440                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
441                  /></tbl:cell>
442                <tbl:cell column="externalId"><%=HTML.encodeTags(item.getExternalId())%></tbl:cell>
443                <tbl:cell column="numReporters"><%=item.getSize()%></tbl:cell>
444                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
445                <tbl:cell column="permission"><%=PermissionUtil.getShortPermissions(item)%></tbl:cell>
446                <tbl:cell column="sharedTo">
447                  <%
448                  Iterator<Nameable> sharees = ShareableUtil.getSharedTo(dc, item).iterator();
449                  while(sharees.hasNext())
450                  {
451                    Nameable n = sharees.next();
452                    if (mode.hasPropertyLink())
453                    {
454                      out.write(Base.getLinkedName(ID, n, false, mode.hasEditLink()));
455                    }
456                    else
457                    {
458                      out.write(HTML.encodeTags(n.getName()));
459                    }
460                    out.write(sharees.hasNext() ? ", " : "");
461                  }
462                  %>
463                </tbl:cell>
464                <tbl:xt-cells dc="<%=dc%>" item="<%=item%>">
465                  <tbl:cell column="xt-columns" />
466                </tbl:xt-cells>
467              </tbl:row>
468              <%
469              }
470            }
471          if (numListed == 0)
472          {
473            %>
474            <tbl:panel subclass="bg-filled-50">
475              <div class="messagecontainer note">
476              <%=reporterLists == null || reporterLists.getTotalCount() == 0 ? "No reporter lists were found" : "No reporter lists on this page. Please select another page!" %>
477              </div>
478            </tbl:panel>
479            <%
480          }
481          %>
482          </tbl:rows>
483      </tbl:data>
484    </tbl:table>
485    </div>
486   
487    <base:buttongroup subclass="dialogbuttons">
488      <base:button id="btnOk" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
489      <base:button id="close" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
490      <base:button id="close" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
491    </base:buttongroup>
492   
493  </base:body>
494  </base:page>
495  <%
496}
497finally
498{
499  if (reporterLists != null) reporterLists.close();
500  if (dc != null) dc.close();
501}
502%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.