source: trunk/www/views/scans/images/list_images.jsp @ 4889

Last change on this file since 4889 was 4889, checked in by Nicklas Nordborg, 14 years ago

References #1290: Change source files to UTF-8

Changed 'Hakkinen' to 'Häkkinen'.
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Id
File size: 15.2 KB
Line 
1<%-- $Id: list_images.jsp 4889 2009-04-06 12:52:39Z nicklas $
2  ------------------------------------------------------------------
3  Copyright (C) 2006 Jari Häkkinen, Nicklas Nordborg, Martin Svensson
4  Copyright (C) 2007 Johan Enell
5
6  This file is part of BASE - BioArray Software Environment.
7  Available at http://base.thep.lu.se/
8
9  BASE is free software; you can redistribute it and/or
10  modify it under the terms of the GNU General Public License
11  as published by the Free Software Foundation; either version 3
12  of the License, or (at your option) any later version.
13
14  BASE is distributed in the hope that it will be useful,
15  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
17  GNU General Public License for more details.
18
19  You should have received a copy of the GNU General Public License
20  along with BASE. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
21  ------------------------------------------------------------------
22
23  @author Nicklas
24  @version 2.0
25--%>
26<%@ page session="false"
27  import="net.sf.basedb.core.SessionControl"
28  import="net.sf.basedb.core.DbControl"
29  import="net.sf.basedb.core.Item"
30  import="net.sf.basedb.core.ItemContext"
31  import="net.sf.basedb.core.Scan"
32  import="net.sf.basedb.core.Image"
33  import="net.sf.basedb.core.ItemQuery"
34  import="net.sf.basedb.core.ItemResultIterator"
35  import="net.sf.basedb.core.Permission"
36  import="net.sf.basedb.core.PluginDefinition"
37  import="net.sf.basedb.core.PermissionDeniedException"
38  import="net.sf.basedb.core.query.Restrictions"
39  import="net.sf.basedb.core.query.Expressions"
40  import="net.sf.basedb.core.query.Orders"
41  import="net.sf.basedb.core.query.Hql"
42  import="net.sf.basedb.core.plugin.GuiContext"
43  import="net.sf.basedb.core.plugin.Plugin"
44  import="net.sf.basedb.util.Enumeration"
45  import="net.sf.basedb.clients.web.Base"
46  import="net.sf.basedb.clients.web.ModeInfo"
47  import="net.sf.basedb.clients.web.util.HTML"
48  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.ExtensionsControl"
49  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.JspContext"
50  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.renderer.PrefixSuffixRenderer"
51  import="net.sf.basedb.clients.web.extensions.toolbar.ToolbarUtil"
52  import="net.sf.basedb.util.extensions.ExtensionsInvoker"
53  import="net.sf.basedb.util.Values"
54  import="java.util.List"
55  import="java.util.Map"
56%>
57<%@ taglib prefix="base" uri="/WEB-INF/base.tld" %>
58<%@ taglib prefix="tbl" uri="/WEB-INF/table.tld" %>
59<%@ taglib prefix="t" uri="/WEB-INF/tab.tld" %>
60<%@ taglib prefix="p" uri="/WEB-INF/path.tld" %>
61<%@ taglib prefix="ext" uri="/WEB-INF/extensions.tld" %>
62<%!
63  private static final Item itemType = Item.IMAGE;
64  private static final GuiContext guiContext = new GuiContext(itemType, GuiContext.Type.LIST);
65%>
66<%
67final int scanId = Values.getInt(request.getParameter("scan_id"));
68final SessionControl sc = Base.getExistingSessionControl(pageContext, Permission.DENIED, itemType);
69final String ID = sc.getId();
70final ItemContext cc = Base.getAndSetCurrentContext(sc, itemType, null, null);
71
72final ModeInfo mode = ModeInfo.get(request.getParameter("mode"));
73final String callback = request.getParameter("callback");
74final String title = mode.generateTitle("image", "images");
75final DbControl dc = sc.newDbControl();
76ItemResultIterator<Image> images = null;
77try
78{
79  final Scan scan = Scan.getById(dc, scanId);
80  final boolean createPermission = scan.hasPermission(Permission.WRITE);
81  final boolean writePermission = createPermission;
82  final boolean deletePermission = createPermission;
83
84  final ItemQuery<Image> query = scan.getImages();
85  cc.configureQuery(query, true);
86
87  Map<Plugin.MainType, Integer> pluginCount = PluginDefinition.countPlugins(dc, guiContext);
88  try
89  {
90    images = query.iterate(dc);
91  }
92  catch (Throwable t)
93  {
94    cc.setMessage(t.getMessage());
95  }
96  int numListed = 0;
97  JspContext jspContext = ExtensionsControl.createContext(dc, pageContext, guiContext, scan);
98  ExtensionsInvoker invoker = ToolbarUtil.useExtensions(jspContext);
99  %>
100  <base:page title="<%=title%>" type="<%=mode.getPageType()%>">
101  <base:head scripts="table.js,tabcontrol.js" styles="table.css,headertabcontrol.css,path.css">
102    <ext:scripts context="<%=jspContext%>" />
103    <ext:stylesheets context="<%=jspContext%>" />
104    <script language="JavaScript">
105    var submitPage = 'index.jsp';
106    var formId = 'images';
107    function newItem()
108    {
109      Main.viewOrEditItem('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', 0, true, '&scan_id=<%=scanId%>');
110//      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=NewItem&scan_id=<%=scanId%>', 'NewImage', 500, 340);
111    }
112    function editItem(itemId)
113    {
114      Main.viewOrEditItem('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', itemId, true);
115//      Main.openPopup('index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=EditItem&scan_id=<%=scanId%>&item_id='+itemId, 'EditImage', 500, 340);
116    }
117    function viewItem(itemId)
118    {
119      Main.viewOrEditItem('<%=ID%>', '<%=itemType.name()%>', itemId, false);
120//      location.href = 'index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=ViewItem&scan_id=<%=scanId%>&item_id='+itemId;
121    }
122    function itemOnClick(evt, itemId)
123    {
124      Table.itemOnClick(formId, evt, itemId, '<%=mode.getName()%>', viewItem, editItem, returnSelected);
125    }
126    function deleteItems()
127    {
128      var frm = document.forms[formId];
129      if (Forms.numChecked(frm) == 0)
130      {
131        alert('Please select at least one item in the list');
132        return;
133      }
134      frm.action = submitPage;
135      frm.cmd.value = 'DeleteItems';
136      frm.submit();
137    }
138    function restoreItems()
139    {
140      var frm = document.forms[formId];
141      if (Forms.numChecked(frm) == 0)
142      {
143        alert('Please select at least one item in the list');
144        return;
145      }
146      frm.action = submitPage;
147      frm.cmd.value = 'RestoreItems';
148      frm.submit();
149    }
150    function deleteItemPermanently(itemId)
151    {
152      Main.deleteItemPermanently('<%=ID%>', true, '<%=itemType.name()%>', itemId);
153    }
154    function configureColumns()
155    {
156      Table.configureColumns('<%=ID%>', formId, '<%=itemType.name()%>', '<%=(String)cc.getObject("defaultColumns")%>');
157    }
158    function runPlugin(cmd)
159    {
160      Table.submitToPopup(formId, cmd, 540, 460);
161    }
162    function returnSelected()
163    {
164      Table.returnSelected(formId, <%=callback != null ? "window.opener."+callback : "null" %>);
165      window.close();
166    }
167    function presetOnChange()
168    {
169      Table.presetOnChange('<%=ID%>', formId, '<%=itemType.name()%>', '<%=(String)cc.getObject("defaultColumns")%>');
170    }
171    function switchTab(tabControlId, tabId)
172    {
173      if (tabId == 'properties' || tabId == 'annotations' || tabId == 'overview')
174      {
175        location.href = '../index.jsp?ID=<%=ID%>&cmd=ViewItem&item_id=<%=scanId%>&tab='+tabId;
176      }
177      else
178      {
179        TabControl.setActiveTab(tabControlId, tabId);
180      }
181    }
182    </script>
183  </base:head>
184 
185  <base:body>
186    <p>
187    <p:path>
188      <p:pathelement title="Scans" href="<%="../index.jsp?ID="+ID%>" />
189      <p:pathelement title="<%=HTML.encodeTags(scan.getName())%>" />
190    </p:path>
191
192    <t:tabcontrol id="main" active="images" switch="switchTab">
193    <t:tab id="properties" title="Properties" />
194    <t:tab id="annotations" title="Annotations &amp; parameters" 
195      tooltip="View annotation values and protocol parameters" />
196   
197    <t:tab id="images" title="Images">
198   
199    <%
200    if (cc.getMessage() != null)
201    {
202      %>
203      <div class="error"><%=cc.getMessage()%></div>
204      <%
205      cc.setMessage(null);
206    }
207    %>
208    <tbl:table 
209      id="images" 
210      clazz="itemlist" 
211      columns="<%=cc.getSetting("columns")%>"
212      sortby="<%=cc.getSortProperty()%>" 
213      direction="<%=cc.getSortDirection()%>"
214      title="<%=title%>"
215      action="index.jsp"
216      sc="<%=sc%>"
217      item="<%=itemType%>"
218      >
219      <tbl:hidden 
220        name="mode" 
221        value="<%=mode.getName()%>" 
222      />
223      <tbl:hidden 
224        name="scan_id" 
225        value="<%=String.valueOf(scanId)%>" 
226      />
227      <tbl:hidden 
228        name="callback" 
229        value="<%=callback%>" 
230        skip="<%=callback == null%>" 
231      />
232      <tbl:columndef 
233        id="name"
234        property="name"
235        datatype="string"
236        title="Name"
237        sortable="true" 
238        filterable="true"
239        exportable="true"
240        show="always" 
241      />
242      <tbl:columndef 
243        id="id"
244        clazz="uniquecol"
245        property="id"
246        datatype="int"
247        title="ID"
248        sortable="true"
249        filterable="true"
250        exportable="true"
251      />
252      <tbl:columndef 
253        id="file"
254        property="file.name"
255        datatype="string"
256        title="File"
257        sortable="true" 
258        filterable="true"
259        exportable="true"
260      />
261      <tbl:columndef 
262        id="preview"
263        property="preview"
264        datatype="boolean"
265        title="Is preview"
266        sortable="true" 
267        filterable="true"
268        exportable="true"
269      />
270      <%
271      Enumeration<String, String> formats = new Enumeration<String, String>();
272      for (Image.Format f : Image.Format.values())
273      {
274        formats.add(Integer.toString(f.getValue()), f.toString());
275      }
276      %>
277      <tbl:columndef 
278        id="format"
279        property="format"
280        datatype="int"
281        enumeration="<%=formats%>"
282        title="Format"
283        sortable="true" 
284        filterable="true"
285        exportable="true"
286      />
287      <tbl:columndef 
288        id="description"
289        property="description"
290        datatype="string"
291        title="Description" 
292        sortable="true" 
293        filterable="true" 
294        exportable="true"
295      />
296      <tbl:toolbar
297        visible="<%=mode.hasToolbar()%>"
298        >
299        <tbl:button 
300          disabled="<%=createPermission ? false : true%>" 
301          image="<%=createPermission ? "new.gif" : "new_disabled.gif"%>" 
302          onclick="newItem()" 
303          title="New&hellip;" 
304          tooltip="<%=createPermission ? "Create new image" : "You do not have permission to create images"%>" 
305        />
306        <tbl:button 
307          disabled="<%=deletePermission ? false : true%>" 
308          image="<%=deletePermission ? "delete.gif" : "delete_disabled.gif"%>" 
309          title="Delete"
310          onclick="deleteItems()" 
311          tooltip="<%=deletePermission ? "Delete the selected items" : "You do not have permission to delete images"%>" 
312        />
313        <tbl:button 
314          disabled="<%=writePermission ? false : true%>"
315          image="<%=writePermission ? "restore.gif" : "restore_disabled.gif"%>"
316          onclick="restoreItems()" 
317          title="Restore" 
318          tooltip="<%=writePermission ? "Restore the selected (deleted) items" : "You do not have permission to restore images"%>"
319        />
320        <tbl:button 
321          image="columns.gif" 
322          onclick="configureColumns()" 
323          title="Columns&hellip;" 
324          tooltip="Show, hide and re-order columns" 
325        />
326        <tbl:button 
327          image="import.gif" 
328          onclick="runPlugin('ImportItems')" 
329          title="Import&hellip;" 
330          tooltip="Import data" 
331          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.IMPORT)%>"
332        />
333        <tbl:button 
334          image="export.gif" 
335          onclick="runPlugin('ExportItems')" 
336          title="Export&hellip;" 
337          tooltip="Export data" 
338          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.EXPORT)%>"
339        />
340        <tbl:button 
341          image="runplugin.gif" 
342          onclick="runPlugin('RunListPlugin')" 
343          title="Run plugin&hellip;" 
344          tooltip="Run a plugin" 
345          visible="<%=pluginCount.containsKey(Plugin.MainType.OTHER)%>"
346        />
347        <ext:render extensions="<%=invoker%>" context="<%=jspContext%>" 
348          wrapper="<%=new PrefixSuffixRenderer(jspContext, "<td>", "</td>") %>"/>
349      </tbl:toolbar>
350      <tbl:navigator
351        page="<%=cc.getPage()%>" 
352        rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
353        totalrows="<%=images == null ? 0 : images.getTotalCount()%>" 
354        visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
355      />
356      <tbl:data>
357        <tbl:columns>
358        <tbl:presetselector 
359          clazz="columnheader"
360          colspan="3"
361          onchange="presetOnChange()"
362        />
363        </tbl:columns>
364         
365        <tr>
366          <tbl:header 
367            clazz="index"
368            >&nbsp;</tbl:header>
369          <tbl:header 
370            clazz="check" 
371            visible="<%=mode.hasCheck()%>"
372            ><base:icon 
373              image="check_uncheck.gif" 
374              tooltip="Check/uncheck all" 
375              onclick="Forms.checkUncheck(document.forms[formId])" style="align: left;"
376            /></tbl:header>
377          <tbl:header 
378            clazz="check" 
379            visible="<%=mode.hasRadio()%>"
380            />
381          <tbl:header 
382            clazz="icons" 
383            visible="<%=mode.hasIcons()%>"
384            >&nbsp;</tbl:header>
385          <tbl:propertyfilter />
386        </tr>
387   
388          <tbl:rows>
389          <%
390          int index = cc.getPage()*cc.getRowsPerPage();
391          int selectedItemId = cc.getId();
392          if (images != null)
393          {           
394            while (images.hasNext())
395            {
396              Image item = images.next();
397              int itemId = item.getId();
398              String tooltip = mode.isSelectionMode() ?
399                  "Select this item" : "View this item" + (writePermission ? " (use CTRL, ALT or SHIFT to edit)" : "");
400              String deletePermanently = "deleteItemPermanently("+itemId+")";
401              String name = HTML.encodeTags(item.getName());
402              index++;
403              numListed++;
404              %>
405              <tbl:row>
406                <tbl:header 
407                  clazz="index"
408                  ><%=index%></tbl:header>
409                <tbl:header 
410                  clazz="check" 
411                  visible="<%=mode.hasCheck()%>"
412                  ><input 
413                      type="checkbox" 
414                      name="<%=itemId%>" 
415                      value="<%=itemId%>" 
416                      title="<%=name%>" 
417                      <%=cc.getSelected().contains(itemId) ? "checked" : ""%>
418                    ></tbl:header>
419                <tbl:header 
420                  clazz="check" 
421                  visible="<%=mode.hasRadio()%>"
422                  ><input 
423                      type="radio" 
424                      name="item_id" 
425                      value="<%=itemId%>" 
426                      title="<%=name%>" 
427                      <%=selectedItemId == itemId ? "checked" : ""%>
428                    ></tbl:header>
429                <tbl:header 
430                  clazz="icons" 
431                  visible="<%=mode.hasIcons()%>"
432                  ><base:icon 
433                    image="<%=deletePermission ? "deleted.gif" : "deleted_disabled.gif"%>"
434                    onclick="<%=deletePermission ? deletePermanently : null%>"
435                    tooltip="This item has been scheduled for deletion" 
436                    visible="<%=item.isRemoved()%>"
437                  />&nbsp;</tbl:header>
438                <tbl:cell column="name"><div class="link" 
439                  onclick="itemOnClick(<%=writePermission ? "event" : null%>, <%=itemId%>)" 
440                  title="<%=tooltip%>"><%=name%></div></tbl:cell>
441                <tbl:cell column="id"><%=item.getId()%></tbl:cell>
442                <tbl:cell column="file"
443                  ><base:propertyvalue 
444                    item="<%=item%>" 
445                    property="file"
446                    enableEditLink="<%=mode.hasEditLink()%>" 
447                    enablePropertyLink="<%=mode.hasPropertyLink()%>"
448                  /></tbl:cell>
449                <tbl:cell column="preview"><%=item.isPreview()%></tbl:cell>
450                <tbl:cell column="format"><%=item.getFormat()%></tbl:cell>
451                <tbl:cell column="description"><%=HTML.encodeTags(item.getDescription())%></tbl:cell>
452              </tbl:row>
453              <%
454            }
455          }
456          %>
457          </tbl:rows>
458        </tbl:data>
459      <%
460      if (numListed == 0)
461      {
462        %>
463        <tbl:panel><%=images == null || images.getTotalCount() == 0 ? "No images were found" : "No images on this page. Please select another page!" %></tbl:panel>
464        <%
465      }
466      else
467      {
468        %>
469        <tbl:navigator
470          page="<%=cc.getPage()%>" 
471          rowsperpage="<%=cc.getRowsPerPage()%>" 
472          totalrows="<%=images == null ? 0 : images.getTotalCount()%>" 
473          visible="<%=mode.hasNavigator()%>"
474          locked="true"
475        />
476        <%
477      }
478      %>
479    </tbl:table>
480    <base:buttongroup align="center">
481      <base:button onclick="returnSelected();" title="Ok" visible="<%=mode.hasOkButton()%>" />
482      <base:button onclick="window.close();" title="Cancel" visible="<%=mode.hasCancelButton()%>" />
483      <base:button onclick="window.close();" title="Close" visible="<%=mode.hasCloseButton()%>" />
484    </base:buttongroup>
485 
486    </t:tab>
487    <t:tab id="overview" title="Overview" 
488      tooltip="Display a tree overview of related items" />
489    </t:tabcontrol>
490
491 
492  </base:body>
493  </base:page>
494  <%
495}
496finally
497{
498  if (images != null) images.close();
499  if (dc != null) dc.close();
500}
501%>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.