1 | // $Id: utility.cc 298 2005-04-29 12:16:21Z peter $ |
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4 | #include <c++_tools/statistics/utility.h> |
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6 | #include <vector> |
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7 | #include <algorithm> |
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9 | #include <cmath> |
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10 | #include <cstdlib> |
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11 | #include <gsl/gsl_randist.h> |
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12 | #include <iostream> |
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15 | namespace theplu { |
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16 | namespace statistics { |
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18 | double cdf_hypergeometric_P(u_int k, u_int n1, u_int n2, u_int t) |
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19 | { |
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20 | double p=0; |
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21 | for (u_int i=0; i<=k; i++) |
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22 | p+= gsl_ran_hypergeometric_pdf(i, n1, n2, t); |
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23 | return p; |
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24 | } |
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25 | |
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26 | |
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27 | double median(std::vector<double>& vec) |
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28 | { |
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29 | return percentile(vec, 50.0); |
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30 | } |
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31 | |
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32 | double median(std::vector<size_t>& vec) |
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33 | { |
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34 | return percentile(vec, 50.0); |
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35 | } |
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36 | |
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37 | double percentile(std::vector<double>& vec, double percentile) |
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38 | { |
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39 | if (percentile==100) |
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40 | return vec[vec.size()-1]; |
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41 | else{ |
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42 | sort(vec.begin(), vec.end()); |
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43 | double j = percentile/100 * (vec.size()-1); |
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44 | int i = static_cast<int>(j); |
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45 | return (1-j+floor(j))*vec[i] + (j-floor(j))*vec[i+1]; |
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46 | } |
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47 | } |
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48 | |
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49 | double percentile(std::vector<size_t>& vec, double percentile) |
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50 | { |
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51 | if (percentile==100) |
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52 | return vec[vec.size()-1]; |
---|
53 | else{ |
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54 | sort(vec.begin(), vec.end()); |
---|
55 | double j = percentile/100 * (vec.size()-1); |
---|
56 | int i = static_cast<int>(j); |
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57 | return (1-j+floor(j))*vec[i] + (j-floor(j))*vec[i+1]; |
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58 | } |
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59 | |
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60 | } |
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61 | |
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62 | |
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63 | }} // of namespace statistics and namespace theplu |
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