| 1 | // $Id: ROC.cc 98 2004-06-10 15:24:05Z peter $ |
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| 3 | // System includes |
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| 4 | //#include <algorithm> |
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| 5 | //#include <utility> |
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| 6 | //#include <vector> |
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| 8 | // Thep C++ Tools |
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| 9 | #include "ROC.h" |
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| 10 | #include "stl_utility.h" |
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| 11 | #include "vector.h" |
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| 13 | namespace theplu { |
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| 14 | namespace cpptools { |
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| 16 | ROC::ROC(const gslapi::vector& target, const gslapi::vector& value) |
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| 18 | : Score(), value_(), nof_pos_(0), minimum_size_(10), area_(-1) |
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| 21 | { |
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| 22 | for (unsigned int i=0; i<target.size(); i++){ |
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| 23 | int targ=static_cast<int>(target(i)); |
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| 24 | std::pair<int, double> tmp(targ, value(i)); |
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| 25 | value_.push_back(tmp); |
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| 26 | if (targ==1) |
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| 27 | nof_pos_++; |
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| 28 | } |
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| 29 | sort(value_.begin(),value_.end(), |
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| 30 | pair_value_compare<int,double>()); |
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| 31 | |
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| 32 | } |
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| 34 | |
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| 35 | double ROC::score() |
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| 36 | { |
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| 37 | using namespace std; |
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| 38 | if (area_==-1){ |
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| 39 | double area_=0; |
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| 40 | for (unsigned int i=0; i<value_.size(); i++) |
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| 41 | if (value_[i].first==1) |
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| 42 | area_+=i; |
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| 43 | // Normalizing the area to 0-1 |
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| 44 | area_ = (area_/nof_pos_ - (nof_pos_ - 1)/2 )/(value_.size() - nof_pos_); |
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| 45 | } |
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| 46 | return area_; |
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| 47 | } |
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| 48 | |
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| 49 | |
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| 50 | double ROC::p_value(void) |
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| 51 | { |
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| 52 | if (area_==-1) |
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| 53 | area_ = score(); |
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| 54 | double p; |
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| 55 | if (nof_pos_ < minimum_size_ & value_.size()-nof_pos_ < minimum_size_) |
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| 56 | p = get_p_exact(area_*nof_pos_*(value_.size()-nof_pos_), |
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| 57 | nof_pos_, value_.size()-nof_pos_); |
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| 58 | else |
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| 59 | p = get_p_approx(area_); |
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| 60 | return p; |
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| 61 | } |
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| 62 | |
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| 63 | |
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| 64 | double ROC::get_p_approx(const double area) |
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| 65 | { |
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| 66 | double x = area - 0.5; |
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| 67 | // Not integrating from the middle of the bin, but from the inner edge. |
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| 68 | if (x>0) |
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| 69 | x -= 0.5/nof_pos_/(value_.size()-nof_pos_); |
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| 70 | else if(x<0) |
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| 71 | x += 0.5/nof_pos_/(value_.size()-nof_pos_); |
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| 72 | |
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| 73 | double sigma = (std::sqrt((value_.size()-nof_pos_)* nof_pos_ * |
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| 74 | (value_.size()+1)/12) / |
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| 75 | (value_.size() - nof_pos_ ) / nof_pos_); |
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| 76 | double p = gsl_cdf_gaussian_Q(x, sigma); |
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| 77 | |
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| 78 | return p; |
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| 79 | } |
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| 80 | |
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| 81 | |
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| 82 | double ROC::get_p_exact(const double block, const double nof_pos, |
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| 83 | const double nof_neg) |
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| 84 | { |
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| 85 | double p; |
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| 86 | if (block <= 0.0) |
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| 87 | p = 1.0; |
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| 88 | else if (block > nof_neg*nof_pos) |
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| 89 | p = 0.0; |
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| 90 | else { |
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| 91 | double p1 = get_p_exact(block-nof_neg, nof_pos-1, nof_neg); |
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| 92 | double p2 = get_p_exact(block, nof_pos, nof_neg-1); |
|---|
| 93 | p = nof_pos/(nof_pos+nof_neg)*p1 + nof_neg/(nof_pos+nof_neg)*p2; |
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| 94 | } |
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| 95 | return p; |
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| 96 | } |
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| 97 | |
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| 98 | }} // of namespace cpptools and namespace theplu |
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